Discussion :

[iguanic]

Bonjour à tous
Suite à petit programme en mélange de awk et shell j'obtiens un fichier que je souhaite trier sur plusieurs colonnes mais la commande tri (sort) me pose quelques soucis et je ne trouve rien en awk

mon fichier de départ = fic1 est de type

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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col1 col2 var1 var2 h1 h2
10 11 0.46585 0.45304 0.26612 0.11821
3 10 0.30274 0.46261 0.38001 0.12164
3 11 0.29714 0.45030 0.67664 0.80811E-01
3 4 0.29344 0.23612 0.87633 0.40339E-01
3 9 0.30473 0.12433 -0.37703 0.22029
4 13 0.23579 0.32574 0.76885 0.68132E-01
4 14 0.23536 0.32237 0.76262 0.69857E-01
4 5 0.23513 0.25724 0.84904 0.51867E-01
4 9 0.23955 0.12694 -0.43368 0.22753
5 10 0.26563 0.32722 0.91645 0.28555E-01

Je souhaite que col1 soit trié de 1 à 10 puis col2 de 1 à 10 également

un sort -n ou sort -k1n ou un sort -k1n,2n fic1 me renvoie systématiquement

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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col1 col2 var1 var2 h1 h2
3 4 0.29344 0.23612 0.87633 0.40339E-01
3 9 0.30473 0.12433 -0.37703 0.22029
4 5 0.23513 0.25724 0.84904 0.51867E-01
4 9 0.23955 0.12694 -0.43368 0.22753
5 10 0.26563 0.32722 0.91645 0.28555E-01
3 10 0.30274 0.46261 0.38001 0.12164
3 11 0.29714 0.45030 0.67664 0.80811E-01
4 13 0.23579 0.32574 0.76885 0.68132E-01
4 14 0.23536 0.32237 0.76262 0.69857E-01
10 11 0.46585 0.45304 0.26612 0.11821

Existe t'il un tri en shell ou awk qui prenne en compte la colonne souhaiter? j'aurai aimé en awk quelquechose type sort $1, $2
mais apparemment non ....

Autre question si je veut trier var1 par ordre croissant, il faut que je fasse

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

awk '{print $3; $1;$2;$4;$5;$6}' fic1 | sort-n > fic2

Ensuite je dois remettre mes colonnes dans le bon ordre

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

awk '{print $2;$3; $1;$4;$5;$6}' fic1 | sort-n > fic2

ou Existe t'il quelque chose de plus simple ?

Merci

[N_BaH]

Bonjour,

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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$ sort -k1,2n fichier
col1 col2 var1 var2 h1 h2
3 10 0.30274 0.46261 0.38001 0.12164
3 11 0.29714 0.45030 0.67664 0.80811E-01
3 4 0.29344 0.23612 0.87633 0.40339E-01
3 9 0.30473 0.12433 -0.37703 0.22029
4 13 0.23579 0.32574 0.76885 0.68132E-01
4 14 0.23536 0.32237 0.76262 0.69857E-01
4 5 0.23513 0.25724 0.84904 0.51867E-01
4 9 0.23955 0.12694 -0.43368 0.22753
5 10 0.26563 0.32722 0.91645 0.28555E-01
10 11 0.46585 0.45304 0.26612 0.11821

[iguanic]

Bonjour N_BaH
En faisant cette commande je n'obtiens pas cela.... C'est étrange
Mon "3 10 " se situe après mon "4 9"
Y'a t'il des shell non compatibles avec certaines versions (je suis sur serveur et pas possibilité d'avoir un linux "perso" sur mon ordi)

Suis-je le seul à avoir ce type de problème ?

Merci pour vos infos

[N_BaH]

je suppute un format de fichier non-UNIX...

[Flodelarab]

Bonjour

@ N_BaH : chez toi, "3 11" est avant "3 4" ...

Je ne sais pas ce que trafique "sort", mais il a un problème avec les chiffres, quand le séparateur de champs est une simple espace.
Il m'arrive de rajouter une lettre entre les champs, ou de changer carrément le séparateur de champs.

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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$ sed 's/ /;/g' fichier
col1;col2;var1;var2;h1;h2
10;11;0.46585;0.45304;0.26612;0.11821
3;10;0.30274;0.46261;0.38001;0.12164
3;11;0.29714;0.45030;0.67664;0.80811E-01
3;4;0.29344;0.23612;0.87633;0.40339E-01
3;9;0.30473;0.12433;-0.37703;0.22029
4;13;0.23579;0.32574;0.76885;0.68132E-01
4;14;0.23536;0.32237;0.76262;0.69857E-01
4;5;0.23513;0.25724;0.84904;0.51867E-01
4;9;0.23955;0.12694;-0.43368;0.22753
5;10;0.26563;0.32722;0.91645;0.28555E-01

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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$ sed 's/ /\;/g' fichier | sort -t ';' +0n +1n
col1;col2;var1;var2;h1;h2
3;4;0.29344;0.23612;0.87633;0.40339E-01
3;9;0.30473;0.12433;-0.37703;0.22029
3;10;0.30274;0.46261;0.38001;0.12164
3;11;0.29714;0.45030;0.67664;0.80811E-01
4;5;0.23513;0.25724;0.84904;0.51867E-01
4;9;0.23955;0.12694;-0.43368;0.22753
4;13;0.23579;0.32574;0.76885;0.68132E-01
4;14;0.23536;0.32237;0.76262;0.69857E-01
5;10;0.26563;0.32722;0.91645;0.28555E-01
10;11;0.46585;0.45304;0.26612;0.11821

Et là, c'est trié par rapport au champ 1 puis au champ 2 numériquement !

[N_BaH]

voilà, voilà :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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$ sort -t ' ' -k1n -k2n fichier
col1 col2 var1 var2 h1 h2
3 4 0.29344 0.23612 0.87633 0.40339E-01
3 9 0.30473 0.12433 -0.37703 0.22029
3 10 0.30274 0.46261 0.38001 0.12164
3 11 0.29714 0.45030 0.67664 0.80811E-01
4 5 0.23513 0.25724 0.84904 0.51867E-01
4 9 0.23955 0.12694 -0.43368 0.22753
4 13 0.23579 0.32574 0.76885 0.68132E-01
4 14 0.23536 0.32237 0.76262 0.69857E-01
5 10 0.26563 0.32722 0.91645 0.28555E-01
10 11 0.46585 0.45304 0.26612 0.11821

[Flodelarab]

J'avais commencé comme toi, sans succès :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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$ sort -t ' ' -k1n -k2n fichier
col1 col2 var1 var2 h1 h2
3 4 0.29344 0.23612 0.87633 0.40339E-01
3 9 0.30473 0.12433 -0.37703 0.22029
4 5 0.23513 0.25724 0.84904 0.51867E-01
4 9 0.23955 0.12694 -0.43368 0.22753
3 10 0.30274 0.46261 0.38001 0.12164
3 11 0.29714 0.45030 0.67664 0.80811E-01
4 13 0.23579 0.32574 0.76885 0.68132E-01
4 14 0.23536 0.32237 0.76262 0.69857E-01
5 10 0.26563 0.32722 0.91645 0.28555E-01
10 11 0.46585 0.45304 0.26612 0.11821

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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$ sort --version
sort (GNU coreutils) 8.26
Copyright © 2016 Free Software Foundation, Inc.
License GPLv3+*: GNU GPL version*3 ou ultérieure
<http://gnu.org/licenses/gpl.html>
C'est logiciel libre, vous êtes libre de le modifier et de le redistribuer.
Ce logiciel n'est accompagné d'ABSOLUMENT AUCUNE GARANTIE, dans les limites
autorisées par la loi applicable.
Écrit par Mike Haertel et Paul Eggert.

[iguanic]

Bonjour

Merci pour vos réponses

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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sort (GNU coreutils) 8.4
Copyright © 2010 Free Software Foundation, Inc.
License GPLv3+*: GNU GPL version 3 ou ultérieure
<http://gnu.org/licenses/gpl.html>
Ceci est logiciel libre, vous êtes libre de le modifier et de le redistribuer.
Ce logiciel n est accompagne d'ABSOLUMENT AUCUNE GARANTIE, dans les limites
autorisees par la loi applicable.

Mon fichier est bien au format unix car il est créé par un script.

Je n'avais pas pensé à changer le séparateur, bien joué

Mais j'ai trouvé autre chose sur la toile qui me simplifie la vie donc je vous en fais part c'est l'option -g comme --general-numeric-sort et la ça marche sans problème
J'espère que ça pourra en dépanner d'autres

Merci en tout cas pour la réactivité
A bientôt