Discussion :

[Puppet_Master]

Bonjour.

J'ai, pour la première fois, un problème pour installer un paquet. N'ayant jamais été confronté à ce problème je ne sais pas quelle démarche adopter afin de résoudre mon problème ! Je suis preneur si vous avez des idées !

Voici quelques informations :
– système d'exploitation Linuxmint 19.1

– version de R: 3.6.1 en amd64

– version de R studio : 1.2.1335

le problème survient à l'installation du paquet stringr. Voici le log:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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> install.packages("stringr")
Installing package into ‘/home/mrdjez/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6’
(as ‘lib’ is unspecified)
also installing the dependency ‘stringi’
 
essai de l'URL 'https://cloud.r-project.org/src/contrib/stringi_1.4.3.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 7290890 bytes (7.0 MB)
==================================================
downloaded 7.0 MB
 
essai de l'URL 'https://cloud.r-project.org/src/contrib/stringr_1.4.0.tar.gz'
Content type 'application/x-gzip' length 135777 bytes (132 KB)
==================================================
downloaded 132 KB
 
* installing *source* package ‘stringi’ ...
** package ‘stringi’ correctement décompressé et sommes MD5 vérifiées
** using staged installation
checking for R_HOME... /usr/lib/R
checking for R... /usr/lib/R/bin/R
checking for endianness... little
checking for R >= 3.1.0 for C++11 use... yes
checking for R < 3.4.0 for CXX1X flag use... no
checking for cat... /bin/cat
checking for local ICUDT_DIR... icu61/data
checking for gcc... gcc -std=gnu99
checking whether the C compiler works... yes
checking for C compiler default output file name... a.out
checking for suffix of executables... 
checking whether we are cross compiling... no
checking for suffix of object files... o
checking whether we are using the GNU C compiler... yes
checking whether gcc -std=gnu99 accepts -g... yes
checking for gcc -std=gnu99 option to accept ISO C89... none needed
checking how to run the C preprocessor... g++ -std=gnu++11 -E
configure: error: in `/tmp/RtmpHQvCrL/R.INSTALL34f64adfb80e/stringi':
configure: error: C preprocessor "g++ -std=gnu++11 -E" fails sanity check
See `config.log' for more details
ERROR: configuration failed for package ‘stringi’
* removing ‘/home/mrdjez/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/stringi’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘stringi’ had non-zero exit status
ERROR: dependency ‘stringi’ is not available for package ‘stringr’
* removing ‘/home/mrdjez/R/x86_64-pc-linux-gnu-library/3.6/stringr’
Warning in install.packages :
  installation of package ‘stringr’ had non-zero exit status
 
The downloaded source packages are in
	‘/tmp/RtmpiDDXV8/downloaded_packages’

Il semble que le paquet qui pose problème soit stringi mais je ne sais pas comment aller plus loin pour résoudre le problème.

[mgdondon]

Bonjour,

Cette discussion pourra peut-être vous aider ?

Cordialement,

[Puppet_Master]

Bonjour mgdondon.

Merci pour votre réponse !

Alors en lisant la discussion j'ai résolu mon problème. Je suis revenu a une version antérieur de R mais au moins je peux avancer sur mes rapport RMarkdown !