Discussion :

[Margotte02]

Bonjour,

j'ai une base de données et j'aimerais faire le tri afin de savoir ce que je peux moyenner ou pas, je m'explique:

dans ma base de données j'ai 3 variables mesurées:
- variable 1: la taille des racines
-variable 2: le poids des racines
.variable 3: le poids des plantes

j'ai aussi des variables qui peuvent influencer/expliquer ces mesures:
-variété (N=5)
-traitement (N=3) (les traitements sont réalisées dans des UE séparées)
-période d'observation en mois (N=2)
-année de l'essai (N=3 pour variable 1 et 2 et N=2 pour variable 3) = répétitions

Je considère l’année comme une répétition dans mes essais donc l’année doit être un random factor, c’est juste ?

Les observations de la taille des racines, du poids des racines et du poids des plantes sont réalisées à 2 périodes: 3 et 5 mois pour chacune des unités (un traitement par unité)), l'échantillonnage est destructif donc les observations à 5 mois sont réalisées sur des plantes différentes.

J'aimerais faire une ANOVA 3 ou 4 pour voir quels sont les variables et les interactions qui vont vraiment influencer mes variables mesurées afin de savoir ce que je vais pouvoir moyenner ou pas dans mes graphiques (par exemple si la variété n'a pas d'influence je peux faire la moyenne des 5 variété pour représenter l'influence des traitements sur les variables mesurées). Je ne sais pas comment m'y prendre pour faire cela et interpréter, pourriez-vous m'aider SVP?

Est-ce que je dois choisir un modèle split plot design, complete bloc ou autre ? Sachant que dans mes unités (une unité par traitement) les plantes sont réparties toujours dans le même ordre au sein d’une année (= 1 rep) mais l’ordre change en fonction des années (voir image en PJ).

J'aimerais aussi faire une matrice de corrélation et également représenter tout ça sur une ACP et faire un cercle de corrélation mais je ne sais pas si je peux et comment faire. Avez-vous des conseils ?

Sachant que pour le poids des plantes les mesures n'ont pu être réalisées que sur 2 années tandis que pour les autres variables mesurées elles ont été mesurées sur N=3 années, est-ce gênant si il y a des "na" pour ces différentes analyses?

Voici en PJ un fichier excel avec mes données ainsi qu’une image de mon design expérimental.

Merci par avance pour votre aide et vos pistes.
Meilleures salutations.

[Nebulix]

Dans ton fichier les poids des plantes valent quelques unités ou quelques milliers pour une même variété. On ne peut surement pas faire de moyenne. Il faudrait qu'on en sache plus

[Margotte02]

Dans ton fichier les poids des plantes valent quelques unités ou quelques milliers pour une même variété. On ne peut surement pas faire de moyenne. Il faudrait qu'on en sache plus

Bonjour Nebulix, merci pour le retour.
le poids des plantes est en Kg et le poids des racines en grammes, ils changent en fonction des traitements et légerement en fonction des variétés mais surtout en fonction des traitement. Si la'nova montre qu'il n' y a pas d'interraction (variété*produit) j'aimerais faire des moyennes des variétés pour représenter l'influence des traitements sur le poids des plantes et sur le poids des racines.



Je vais aussi probablement ajouter une autre variable "field treatment", c'est à dire que:
pour un deuxième design expérimental si j’ajoute une variable « Field treatment (oui/non) », c’est-à-dire si avant d’être mis dans les unités la moitié des plantes ont subies un traitement au champs et l’autre moitié non (design expérimental 2) donc dans chaque unité j’ai mes 5 variétés traitées au champs et mes 5 variétés non traitées au champs. Et ensuite chaque unité est traitée avec un produit différent et ceci est répété 3 années de suite. (Voici un fichier en PJ avec mon design expérimental 2 ainsi que mon nouveau tableau de données avec le traitement au champs en plus).

Je vais donc avoir:
3 variables mesurées:
- variable 1: la taille des racines (mm)
-variable 2: le poids des racines (g)
.variable 3: le poids des plantes (Kg)

et les variables qui peuvent influencer/expliquer ces mesures:
-variété (N=5)
-traitement (N=3) (les traitements sont réalisées dans des UE séparées)
-Field treatment (oui/non)
-période d'observation en mois (N=2)
-année de l'essai (N=3 pour variable 1 et 2 et N=2 pour variable 3) = répétitions

Je considère l’année comme une répétition.


Est-ce que cela change quelque chose au choix du test?


Si vous avez besoin de plus de précision ou si je ne suis pas claire n'hésitez pas.
Merci pour votre aide.

design_expérimental_1-et-2.xlsxfichier-exemple_desgin2.xlsx

[Nebulix]

Dans ton tableau on trouve (ligne 32) un échantillon de la variété1 de 2.95 kg, et (ligne 34) un échantillon de la variété1 de 2607 kg !!!
L'effet du changement de traitement est ... saisissant
Un peu trop peut-être ?

[Margotte02]

Oui pardon vous avez tout à fait raison, il y avai une erreur d'unité dans mon fichier, désolée pour ça. Voici le nouveau fichier "fichier-exemple-2"en PJ fichier-exemple_2.xlsx

Merci par avance

[anapurna]

salut

sous Excel il y a un outils super sympa qui s'appelle Tableau dynamique
c'est parfait pour voir certaine incohérence dans tes données

exemple

Poids racine 3 mois t3 var1
an1 = 0.15
an2 = 5.85
an3 = 0.91

autre exemple

Poids racine 5 mois t1 var4
an1 = 0.14
an2 = 28.97
an3 = 0.82

t2
an1 = 0.09
an2 = 21.70
an3 = 0.01

cela te permettra de voir rapidement les Eléments qui peuvent t’intéresser

[Nebulix]

Oui pardon vous avez tout à fait raison, il y avai une erreur d'unité dans mon fichier, désolée pour ça. Voici le nouveau fichier "fichier-exemple-2"en PJ fichier-exemple_2.xlsx

Merci par avance

On enseigne quoi dans les écoles ? A mettre un fichier excel dans une boite noire et recopier ce qui sort ?
Les données ne sont pas n'importe quoi et avant toute étude, il convient de s'assurer un minimum que les données sont cohérentes et pas grossièrement fausses.
Si vous retenez çà, je n'aurai pas perdu mon temps ...

Malheureusement l'actualité est pleine d'annonces reposant sur des pratiques statistiques aussi déplorables.

[Margotte02]

On enseigne quoi dans les écoles ? A mettre un fichier excel dans une boite noire et recopier ce qui sort ?
Les données ne sont pas n'importe quoi et avant toute étude, il convient de s'assurer un minimum que les données sont cohérentes et pas grossièrement fausses.
Si vous retenez çà, je n'aurai pas perdu mon temps ...

Malheureusement l'actualité est pleine d'annonces reposant sur des pratiques statistiques aussi déplorables.

Le fichier que j'ai ajouté ici est un fichier "exemple" car mon but en postant ce message était d'avoir des pistes et de l'aide sur le choix du modèle statistique par rapport à mon design expérimental. Sur mon "vrai" fichier de données, je réalise bien évidement des vérifications aléatoires ainsi que des stats descriptives pour avoir un fichier propre et cohérent...

salut

sous Excel il y a un outils super sympa qui s'appelle Tableau dynamique
c'est parfait pour voir certaine incohérence dans tes données

exemple

autre exemple



cela te permettra de voir rapidement les Eléments qui peuvent t’intéresser

Salut, merci pour le conseil. J'utilise souvent ces tableaux croisés dynamiques, c'est en effet très pratique.
Bonne journée.

[anapurna]

salut

dans ces tableaux au lieu de prendre la formule somme prend la moyenne cela te permettra de préparer le terrain et ainsi de déterminé les discriminant les plus approprié
Bonne journée à toi

[Margotte02]

Ok merci, je vais continuer les stats descriptives et continuer mes recherches afin de savoir quel modèle choisir en fonction de mon design expérimental.

Bonne journée également.