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ImageJ Java Discussion :

[RESOLU]erreur script imagej (2 canaux)


Sujet :

ImageJ Java

  1. #1
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    Par défaut [RESOLU]erreur script imagej (2 canaux)
    Bonjour,

    J'ai un soucis avec mon bout de code suivant:
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    slice=nSlices;
    Dialog.create("Color");
    for (i=1;i<=slice;i++){
    listDch=newArray(i);
    Dialog.addChoice("channel"+ i +":", newArray("Texas Red/FM4-64", "GFP", "DAPI", "YFP","PHASE"));
    }
    Dialog.show();
     
    for (i=1;i<=slice;i++){
     
    listDch[i-1]=Dialog.getChoice();
     
    }
     
     
     
    for (j=1;i<=slice;i++){
     
    Stack.setChannel(j);
     
    if (listDch[j-1]=="Texas Red/FM4-64") {
    run("Red");
     
    else if (listDch[j-1]== "GFP")
    run("Green");
     
    else if (listDch[j-1]== "DAPI")
    run("Cyan");
     
    else if (listDch[j-1]== "YFP")
    run("Yellow");
     
    else if (listDch[j-1]=="PHASE")
    run("Grays");
    }
     
    }
    Je pars d'une image 2 canaux (rouge,phase)

    je voudrais arriver à ceci par l'intermediaire de mon code

    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    Stack.setChannel(1);
    run("Red");
    Stack.setChannel(2);
    run("Grays");
    mais cela ne fonctionne pas.

    Merci

    ps: je n'ai pas réussi a joindre des images , elles sont trop volumineuses.

  2. #2
    Membre régulier Avatar de Tchoukatroc
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    Par défaut
    Bonjour,

    Peux-tu essayer ça? Si ça fonctionne, les erreurs étaient :
    - les boucles sur slices au lieu de channels
    - une accolade en trop dans la boucle if
    - des i à la place des j dans ta dernière boucle for.

    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    getDimensions(width, height, channels, slices, frames);
    Dialog.create("Color");
    for (i=1;i<=channels;i++){
    listDch=newArray(i);
    Dialog.addChoice("channel"+ i +":", newArray("Texas Red/FM4-64", "GFP", "DAPI", "YFP","PHASE"));
    }
    Dialog.show();
     
    for (i=1;i<=channels;i++){
     
    listDch[i-1]=Dialog.getChoice();
     
    }
     
    for (j=1;j<=channels;j++){
     
    Stack.setChannel(j);
     
    if (listDch[j-1]=="Texas Red/FM4-64")
    run("Red");
     
    else if (listDch[j-1]== "GFP")
    run("Green");
     
    else if (listDch[j-1]== "DAPI")
    run("Cyan");
     
    else if (listDch[j-1]== "YFP")
    run("Yellow");
     
    else if (listDch[j-1]=="PHASE")
    run("Grays");
     
    }

  3. #3
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    Par défaut
    Je ne connaissais pas getDimensions(width, height, channels, slices, frames);

    des i à la place des j dans ta dernière boucle for.
    je m'en suis rendu compte une fois avoir mis le code.

    Encore merci

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