[RESOLU]erreur script imagej (2 canaux)

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Bonjour,

J'ai un soucis avec mon bout de code suivant:

Code:

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slice=nSlices;
Dialog.create("Color");
for (i=1;i<=slice;i++){
listDch=newArray(i);
Dialog.addChoice("channel"+ i +":", newArray("Texas Red/FM4-64", "GFP", "DAPI", "YFP","PHASE"));
}
Dialog.show();
 
for (i=1;i<=slice;i++){
 
listDch[i-1]=Dialog.getChoice();
 
}
 
 
 
for (j=1;i<=slice;i++){
 
Stack.setChannel(j);
 
if (listDch[j-1]=="Texas Red/FM4-64") {
run("Red");
 
else if (listDch[j-1]== "GFP")
run("Green");
 
else if (listDch[j-1]== "DAPI")
run("Cyan");
 
else if (listDch[j-1]== "YFP")
run("Yellow");
 
else if (listDch[j-1]=="PHASE")
run("Grays");
}
 
}

Je pars d'une image 2 canaux (rouge,phase)

je voudrais arriver à ceci par l'intermediaire de mon code

Code:

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Stack.setChannel(1);
run("Red");
Stack.setChannel(2);
run("Grays");

mais cela ne fonctionne pas.

Merci

ps: je n'ai pas réussi a joindre des images , elles sont trop volumineuses.

Bonjour,

Peux-tu essayer ça? Si ça fonctionne, les erreurs étaient :
- les boucles sur slices au lieu de channels
- une accolade en trop dans la boucle if
- des i à la place des j dans ta dernière boucle for.

Code:

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getDimensions(width, height, channels, slices, frames);
Dialog.create("Color");
for (i=1;i<=channels;i++){
listDch=newArray(i);
Dialog.addChoice("channel"+ i +":", newArray("Texas Red/FM4-64", "GFP", "DAPI", "YFP","PHASE"));
}
Dialog.show();
 
for (i=1;i<=channels;i++){
 
listDch[i-1]=Dialog.getChoice();
 
}
 
for (j=1;j<=channels;j++){
 
Stack.setChannel(j);
 
if (listDch[j-1]=="Texas Red/FM4-64")
run("Red");
 
else if (listDch[j-1]== "GFP")
run("Green");
 
else if (listDch[j-1]== "DAPI")
run("Cyan");
 
else if (listDch[j-1]== "YFP")
run("Yellow");
 
else if (listDch[j-1]=="PHASE")
run("Grays");
 
}

09/01/2019, 17h03
ludovic787

Je ne connaissais pas getDimensions(width, height, channels, slices, frames);

Citation:

des i à la place des j dans ta dernière boucle for.

je m'en suis rendu compte une fois avoir mis le code.

Encore merci