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Lazarus Pascal Discussion :

Un conteneur pour matrices creuses


Sujet :

Lazarus Pascal

  1. #1
    Membre confirmé

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    Novembre 2013
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    Par défaut Un conteneur pour matrices creuses
    Bjr à vous,

    Je vous propose ici un conteneur pour matrices creuses de très grande taille telles qu'on les rencontre en spéléologie (si, si: topographie souterraine) ou en calcul des structures.
    Il ne stocke que les valeurs non nulles de la matrice.

    Mes connaissances maths sont de niveau BTS industriel, après CAP et Bac techno F4: donc un peu faiblard.
    En prog, je suis 100% autodidacte.

    Ce conteneur a été conçu pour minimiser l'empreinte mémoire du logiciel GHTopo dans le cadre du calcul du canevas topographique dans une carrière souterraine.
    http://ghtopo.blog4ever.com


    Il a été testé avec succès sur un réseau de 4800 branches et 3900 noeuds, empreinte RAM: 35 Mo.

    Ce conteneur sans prétention aucune (de tels conteneurs existent notamment pour implémenter un tableur, mais c'est un excellent exercice), mais faisant le job demandé, est sous licence libre.

    Le conteneur utilise les listes génériques dont voici la déclaration de classe, les méthodes parlant d'elles-mêmes.
    Dans GHTopo, elles sont dans une unité UnitListesSimplesWithGeneriques.pas, mais elles peuvent être directement incorporées
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    type TElementNonNulOfAnRow = record
      IdxColumn  : Integer;
      Valeur     : double;
    end;  
     
    type
     TListeSimple<T> = class(TFPList)
      private
      public
        procedure ClearListe();
        function  GetNbElements(): integer; inline;
        procedure AddElement(const E: T);  // et Rros Minet
        function  GetElement(const Idx: integer): T; inline;
        procedure PutElement(const Idx: integer; const E: T); inline;
        function  RemoveElement(const Idx: integer): boolean;
    end;  
    ...
    procedure TListeSimple<T>.ClearListe;
    var
      i, n: Integer;
    begin
      //AfficherMessage(Format('%s.ClearListe()', [classname]));
      n := self.Count;
      if (n > 0) then
      for i:=Count-1 downto 0 Do
      begin
        if (self.Items[i] <> Nil) then Dispose(self.Items[i]); // Libération
        self.Delete(i);                                        // Suppression de l'élément
      end;
    end;
     
    function TListeSimple<T>.GetNbElements: integer;
    begin
      Result := self.Count;
    end;
     
    procedure TListeSimple<T>.AddElement(const E: T);
    var pE: ^T;
    begin
      New(pE);
      pE^ := E;
      self.Add(pE);
    end;
     
    function TListeSimple<T>.GetElement(const Idx: integer): T;
    begin
      Result := T(Items[Idx]^);
    end;
     
     
     
    procedure TListeSimple<T>.PutElement(const Idx: integer; const E: T);
    begin
      T(Items[Idx]^) := E;
    end;
     
    function TListeSimple<T>.RemoveElement(const Idx: integer): boolean;
    begin
      Result := False;
      try
        Dispose(self.Items[Idx]);
        self.Delete(Idx);
        Result := True;
      except
      end;
    end;
    Unité du conteneur:
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    unit unitMatricesCreuses_LOL;
    // Stockage de matrices creuses sous forme de listes de listes (LOL)
    {$INCLUDE CompilationParameters.inc}
     
    interface
    // Tests effectués:
    // TArrayList: Fonctionne mais est 2x plus lent que TList
    // TVector   : Fonctionne mais légèrement plus lent que TList
    // Utilisation de TList.Capacity: Aucun gain de temps
     
     
    uses
      Common, // pour AfficherMessage() et AfficherMessageErreur()
      Classes, SysUtils, math,
      Graphics,
      UnitListesSimplesWithGeneriques // inutile si on incorpore le TListeSimple<T> ci-dessus
      ;
     
    // Liste des valeurs non-nulles d'une ligne
    type
     
    { TListeNonZerosOfRow }
     
     TListeNonZerosOfRow = class(TListeSimple<TElementNonNulOfAnRow>)
      strict private // indique que ce qui suit n'est pas visible à l'extérieur de la classe
        FMinIdxNonZero: integer;
        FMaxIdxNonZero: integer;
      public
        property  MinIdxNonZero: integer read FMinIdxNonZero write FMinIdxNonZero; // Index de colonne du premier élément non nul
        property  MaxIdxNonZero: integer read FMaxIdxNonZero write FMaxIdxNonZero; // Index de colonne du deuxième élément non nul
        procedure SortValuesByColumns();                                           // Tri des veleurs par index de colonnes
        function  FindValueByIndexCol(const Idx: integer;
                                      out   BP: TElementNonNulOfAnRow;
                                      out   InternalIdx: integer): boolean;
    end;
     
     
    type
    { TMatriceCreuse }
     
     TMatriceCreuse = class
       private
         FMatrixName: string;
         FNbAppelsAddValue: Int64;
         FMaxRow: integer;
         FMaxCol: integer;
         FListeLignes: array of TListeNonZerosOfRow;  // tableau 1D de listes, avec un item par ligne
         FLowIndexes  : array of Integer;             // tableau des premiers index de valeurs non nulles
         FHighIndexes : array of Integer;
     
       public
         function  Initialiser(const NbRows, NbCols: integer; const Name: string): boolean;
         procedure Finaliser();
     
         property  MaxRow: integer read FMaxRow;
         property  MaxCol: integer read FMaxCol;
     
         function  SetValeur(const I, J: integer; const V: double): boolean;
         function  GetValeur(const I, J: integer): double;
         property  NbAppelsAddValue: Int64 read  FNbAppelsAddValue;
         // affichage de la matrice sous forme de texte
         procedure Lister();
         // affichage de la matrice sous forme d'image
         procedure CreerRepresentationMatriceEnImage(const QFileName: string);
     
         procedure RecenserLowIndexes();
         procedure RecenserHighIndexes();
         procedure TrierLesIdxColonnes();
    end;
     
    implementation
    function SortRowValuesByIdxCol(Item1, Item2: Pointer): integer;
    var
      E1, E2: ^TElementNonNulOfAnRow;
    begin
      E1 :=Item1;
      E2 :=Item2;
      if (E1^.IdxColumn < E2^.IdxColumn) then
        Result := -1
      else if (E1^.IdxColumn = E2^.IdxColumn) then
        Result := 0
      else
        Result := 1;
    end;
     
     
    function TListeNonZerosOfRow.FindValueByIndexCol(const Idx: integer;
                                                     out   BP: TElementNonNulOfAnRow;
                                                     out   InternalIdx: integer): boolean;
    var
      i, QN, n: Integer;
      // recherche par méthode récursive dichotomique (effectivement le plus rapide)
      function FindDepth(const I1, I2: integer; const QIDX: integer):  integer;
      var
        PVT: integer;
        C1: TElementNonNulOfAnRow;
      begin
        // coupure en deux => calcul index médian
        PVT := (I2+I1) div 2;
        // début > fin >> sortie directe avec erreur
        if (I1 > I2) then Exit(-1);  // penser à utiliser Exit comme le return() du C
        C1 := self.GetElement(PVT);
        // comparaison. Si vrai -> sortie avec numéro d'index
        if (C1.IdxColumn = QIDX) then Exit(PVT);
        // sinon, recherche en profondeur avec un niveau supplémentaire
        if (QIDX < C1.IdxColumn) then Exit(FindDepth(I1, PVT-1, QIDX));
        Result := FindDepth(PVT+1, I2, QIDX);
      end;
    begin
      Result      := false;
      QN := self.GetNbElements();
      if (QN = 0) then Exit;
      InternalIdx := -1;
      i := FindDepth(0, QN - 1, Idx);
      if (i >= 0) then
      begin
        InternalIdx := i;
        BP     := GetElement(i);
        Exit(True);
      end;
    end;
     
     
     
     
     
     
    procedure TListeNonZerosOfRow.SortValuesByColumns;
    var
      EWE: TElementNonNulOfAnRow;
      n: Integer;
    begin
      self.FMinIdxNonZero  := -1;
      self.FMaxIdxNonZero  := -1;
      n := self.GetNbElements();
      if (n = 0) then Exit;
      //self.PurgerLesZeros();
      self.Pack;
      self.Sort(SortRowValuesByIdxCol);
      EWE := self.GetElement(0);
      self.FMinIdxNonZero := EWE.IdxColumn;
      EWE := self.GetElement(n - 1);
      self.FMaxIdxNonZero := EWE.IdxColumn;
    end;
    //******************************************************************************
    { TMatriceCreuse }
     
     
     
    procedure TMatriceCreuse.CreerRepresentationMatriceEnImage(const QFileName: string);
    var
      BMP: TBitmap;
      i, j: Integer;
    begin
      AfficherMessage(Format('%s.CreerRepresentationMatriceEnImage(%s) (%dx%d)', [ClassName, QFileName, FMaxRow, FMaxCol]));
      Exit;
      BMP := TBitmap.Create;
      try
        BMP.Width  := 1 + FMaxCol;
        BMP.Height := 1 + FMaxRow;
        BMP.Canvas.Brush.Color := clAqua;
        BMP.Canvas.Pen.Color   := clRed;
        BMP.Canvas.FillRect(0, 0, BMP.Width, BMP.Height);
        for i := 1 to FMaxRow do
          for j := 1 to FMaxCol do
            if (not IsZero(GetValeur(i, j))) then BMP.Canvas.Pixels[j, i] := clRed;
        BMP.SaveToFile(QFileName);
      finally
        BMP.Free;
      end;
    end;
     
     
     
    function TMatriceCreuse.GetValeur(const I, J: integer): double;
    var
      MyRow: TListeNonZerosOfRow;
      BP: TElementNonNulOfAnRow;
      QInternalIdx: integer;
    begin
      Result := 0.00;
      MyRow := FListeLignes[i];
      if (MyRow.FindValueByIndexCol(j, BP, QInternalIdx)) then Result := BP.Valeur;
    end;
    function TMatriceCreuse.SetValeur(const I, J: integer; const V: double): boolean;
    var
      MyRow: TListeNonZerosOfRow;
      BP   : TElementNonNulOfAnRow;
      QInternalIdx: integer;
    begin
      Result := false;
      QInternalIdx := -1;
      if (abs(V) > 0.00) then
      begin
        MyRow := FListeLignes[i];
        // S'il y a déjà une valeur en M[i,j], on la remplace
        if (MyRow.FindValueByIndexCol(J, BP, QInternalIdx)) then
        begin
          BP.Valeur    := V;
          MyRow.PutElement(QInternalIdx, BP);
        end
        else // sinon on ajoute
        begin
          Inc(FNbAppelsAddValue);
          BP.IdxColumn := j;
          BP.Valeur    := V;
          MyRow.AddElement(BP);
          // Index min de non-zero changé ? On retrie
          if (j < MyRow.MinIdxNonZero) then MyRow.SortValuesByColumns();
        end;
        //*)
        Result := true;
      end;
    end;
     
     
    function TMatriceCreuse.Initialiser(const NbRows, NbCols: integer; const Name: string): boolean;
    var
      WU : TElementNonNulOfAnRow;
      i: Integer;
    begin
      result := false;
      FNbAppelsAddValue := 0;
      FMatrixName := Name;
      AfficherMessageErreur(Format('%s.Initialiser: %s (%d, %d)', [ClassName, FMatrixName, NbRows, NbCols]));
      try
        SetLength(FListeLignes, 0);
        SetLength(FListeLignes, 1 + NbRows);
        SetLength(FLowIndexes, 0);
        SetLength(FLowIndexes, 1 + NbRows);
        FMaxRow := NbRows;
        FMaxCol := NbCols;
        WU.IdxColumn := 0;
        WU.Valeur    := 0;
        FListeLignes[0] := TListeNonZerosOfRow.Create;
        FListeLignes[0].ClearListe();
        FListeLignes[0].AddElement(WU);
        for i := 1 to High(FListeLignes) do
        begin
          FListeLignes[i] := TListeNonZerosOfRow.Create;
          FListeLignes[i].ClearListe();
          //FListeLignes[i].Capacity := 4000;
        end;
        Result := true;
      except
      end;
    end;
    procedure TMatriceCreuse.Finaliser;
    var
      i: Integer;
    begin
      AfficherMessageErreur(Format('%s.Finaliser(%s)', [ClassName, FMatrixName]));
      for i := 0 to High(FListeLignes) do
      begin
        try
          FListeLignes[i].ClearListe();
        finally
          FListeLignes[i].Free;
        end;
      end;
      SetLength(FListeLignes, 0);
      SetLength(FLowIndexes, 0);
    end;
     
    procedure TMatriceCreuse.RecenserLowIndexes();
    var
      i, j: Integer;
    begin
      for i:=1 to FMaxRow do
      begin
        for j:=1 to FMaxCol do
        begin
          if (Abs(self.GetValeur(j, i)) > 0) then
          begin
            FLowIndexes[i] := j;
            Break;
          end;
        end;
      end;
    end;
    procedure TMatriceCreuse.RecenserHighIndexes();
    var
      i, j: Integer;
    begin
      for i:= 1 to FMaxRow do
      begin
        for j:= FMaxCol downto 1 do
        begin
          if (Abs(self.GetValeur(j, i)) > 0) then
          begin
            FHighIndexes[i] := j;
            Break;
          end;
        end;
      end;
    end;
    (*
    function TMatriceCreuse.GetLowIndex(const ARow: integer): integer;
    begin
      Result := FLowIndexes[ARow];
    end;
    //*)
    procedure TMatriceCreuse.Lister;
    var
      R: TListeNonZerosOfRow;
      i, n, j: Integer;
      V: TElementNonNulOfAnRow;
      EWE: String;
    begin
      AfficherMessageErreur(Format('%s.Lister(): Matrice: %s (%dx%d)', [ClassName, FMatrixName, FMaxRow, FMaxCol]));
      if (FMaxRow = 0) then Exit;
      for i := 0 to FMaxRow do
      begin
        R := FListeLignes[i];
        EWE := Format('Row %d: %d values: ', [i, R.GetNbElements()]);
        n := R.GetNbElements();
        if (n > 0) then
        begin
          for j := 0 to n-1 do
          begin
            V := R.GetElement(j);
            EWE += Format('M[%d, %d] = %f; ', [i, V.IdxColumn, V.Valeur]);
          end;
        end;
        AfficherMessageErreur(EWE);
      end;
    end;
     
    procedure TMatriceCreuse.TrierLesIdxColonnes();
    var
      i: Integer;
    begin
      for i := 1 to MaxRow do FListeLignes[i].SortValuesByColumns();
    end;
     
    end.
    Exemple d'Utilisation:

    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    var
      A: TMatriceCreuse;      
      toto: double;       
    begin
      m := 1000; n := 1000;
      A := TMatriceCreuse.Create; 
      try
        A.Initialiser(m, n, 'Matrice A');
        ...
        A.SetValeur(5,10, 666.66); // écrire une valeur
        toto := A.GetValeur(40, 48); // lire une valeur
        ...
       A.Finaliser();
      finally           
        A.Free;
      end;
    end;
    Pour remarques et suggestions.

  2. #2
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    salut

    pourquoi ne pas avoir tout simplement utiliser un arbre plutôt

    je pense qu'avec un arbre binaire tu aurais pu t'en sortir sans problème
    Nous souhaitons la vérité et nous trouvons qu'incertitude. [...]
    Nous sommes incapables de ne pas souhaiter la vérité et le bonheur, et sommes incapables ni de certitude ni de bonheur.
    Blaise Pascal
    PS : n'oubliez pas le tag

  3. #3
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    Par défaut Arbre binaire: Testé avec succès mais plus lent.
    Citation Envoyé par anapurna Voir le message
    salut

    pourquoi ne pas avoir tout simplement utiliser un arbre plutôt

    je pense qu'avec un arbre binaire tu aurais pu t'en sortir sans problème
    J'ai testé (avec succès point de vue 'résultats corrects') avec les BTree (un arbre par ligne) et les TAvgLvlTree (un TAvgLvlTree par ligne, les arbres étant stockés dans un tableau). Ces méthodes fonctionnent très bien mais s'avèrent plus lentes dans cette application.

  4. #4
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    salut

    un arbre par ligne ?
    il faut simplement un arbre et tu insère tes feuilles au fur et à mesure
    il faut peut être repenser un peu les insertion et les suppression des feuilles dans l'arbre et tu devrais atteindre des vitesse
    plus qu'honorable normalement

    on peut Définir que le fils gauche est la position en colonne et que le fils droit est la position ligne
    a chaque insertion on retries les éléments pour les placer au plus prés de leur position original

    une autre solution est de passer par une liste
    et une matrice d'entier (celle ci servant d'index de recherche)

    on sais qu'en pascal on peu linéariser une matrice MATRICE[0..N,0..M] = LIGNE[0..N*M]
    donc quand tu installe une valeur dans ta liste tu enregistre son index de liste dans ta matrice d'entier
    de cette manière tu as un accès plus rapide que si tu devait faire une recherche dans toutes ta liste
    tu peut le faire aussi avec un tableau dynamique (ton conteneur de valeur) et une matrice d'entier
    même principe cela permet d'indexer le tableau dynamique si la case a -1 c'est que la valeur n'existe pas donc pas besoin
    de faire une recherche

    je verrai bien un truc un peu dans ce genre là

    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    TMatriceCreuse = Class
       FMatrixName: string;
       Datas : Array of TElement;
       Index : Array of Integer;
     public
         function  Initialiser(const NbRows, NbCols: integer; const Name: string): boolean;
         procedure Finaliser();  
     
         property  MaxRow: integer read FMaxRow;
         property  MaxCol: integer read FMaxCol; 
     
        function  SetValeur(const I, J: integer; const V: TElement): boolean;
        function  GetValeur(const I, J: integer): TElement;
    end;
     
     
    function TMatriceCreuse.Initialiser(const NbRows, NbCols: integer; const Name: string): boolean;
    begin
      Setlength(Index,NbRows*NbCols);
      FillChar(Index[0],Length(Index) * SizeOf(Index[0]),-1);
      FMatrixName := Name;
      FMaxRow :=  NbRows;
      FMaxCol := NbCols; 
    end;
     
     
    function TMatriceCreuse.SetValeur(const I, J: integer; const V: TElement): boolean;	
    begin
      Setlength(Datas,Length(Datas)+1);
      Datas[High(Datas)]:=V
      Index[(i-1)*FMaxRow+j] := High(Datas)
    end;
     
    function  TMatriceCreuse.GetValeur(const I, J: integer): TElement;
    begin
      Result := Datas[Index[(i-1)*FMaxRow+j]]
    end;
    /*
    la formule 
     ((Ligne-1)*NbRow)+Col
     
    */
    ....
    voila mes deux cents

    PS ... je n'ai pas teste le code mais ce principe fonctionne
    PS2 ... Il est possible qu'il faille adapter la formule selon que tes indice commence a zero ou a 1
    Nous souhaitons la vérité et nous trouvons qu'incertitude. [...]
    Nous sommes incapables de ne pas souhaiter la vérité et le bonheur, et sommes incapables ni de certitude ni de bonheur.
    Blaise Pascal
    PS : n'oubliez pas le tag

  5. #5
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    salut

    un arbre par ligne ?
    En effet.
    Dans mon application, le nombre de lignes est connu à l'avance (la matrice doit être impérativement inversible). Donc, il y a effectivement une structure (arbre ou liste) par ligne pour stocker les 'non-zeros' et leurs positions.

    Dans ta propale de cote (merci d'ailleurs), il y a un tableau 2D d'entiers qui fait déjà le quart (entiers 16bits) ou la moitié (entiers 32) du tableau 2D de double correspondant.

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