Inserer un graph (poorly) dans Shiny

**Yves86** · 06/06/2018, 00h19

Bonjour a tous,

Je souhaite creer une application qui permette a l'utilisateur de upload un fichier excel et de faire des graphes a partir des variables provenant du fichier excel.
Cependant, je n'arrive pas a savoir pourquoi mon graphique ne s'affiche pas. J'utilise ggplot puis ggplotly.

J'espere que vous pourrez m'eclairer.

Merci d'avance.

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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library(shiny)
library(rsconnect)
library(ggplot2)
library(plotly)
 
plotType <- function(data, x, y, type){
  switch(type,
         "Line" = ggplot(data, aes_string(x, y)) + geom_line(),
         "Scatterplot" = ggplot(data, aes_string(x, y)) + geom_point()
  )
}
 
ui <- fluidPage(
 
  # sidebar with user input options
  sidebarPanel(
 
    # Input: select a file
    fileInput(inputId = "file1", label = "Choose CSV File",
              multiple = FALSE,
              accept = c("text/csv",
                         "text/comma-separated-values, text/plain",
                         ".csv")
    ),
    # Horizontal line
    tags$hr(),
 
    # Input: Checkbox if file has header
    checkboxInput("header", "Header", TRUE),
 
    # Input: Select separator
    radioButtons(inputId ="sep", label = "Separator",
                 choices = c(Comma = ",",
                             Semicolon = ";",
                             Tab = "\t"),
                 selected = ","),
 
    radioButtons(inputId = "quote", label = "Quote",
                 choices = c(None = "",
                             "Double Quote" = '"',
                             "Single Quote" = "'"),
                 selected = '"'),
    # Horizontal line
    tags$hr(),
    # Empty inputs - they will be updated after the data is uploaded
    selectInput('xcol', 'X Variable', ""),
    selectInput('ycol', 'Y Variable', "", selected = ""),
     # Horizontal line
    tags$hr(),
    # Input: Select the type of graph 
    radioButtons(inputId ="graph", label = "Type of graph:",
                 choices = c("Line", 
                             "Scatterplot"),
                 selected = "Line")
  ),
    mainPanel(
    tabsetPanel( type = "tabs",
                 tabPanel(
                   # App title
                   titlePanel("Uploading Files"),
                   # Output: Data file
                   tableOutput("contents")
 
                 ),
                 tabPanel(
                   titlePanel("Plot"),
                   plotOutput('MyPlot')
                 ),
                 tabPanel(
                   titlePanel("Summary Statistics"),
                   verbatimTextOutput("summary")
                 )
    )
  )
)
 
server <- function(input, output, session) {
 
 
 
  data <- reactive({
    req(input$file1)
 
    df <- read.csv(input$file1$datapath,
                   header = input$header,
                   sep = input$sep,
                   quote = input$quote)
 
    updateSelectInput(session, inputId = 'xcol', label = 'X Variable',
                      choices = names(df), selected = names(df)[sapply(df, is.numeric)])
    updateSelectInput(session, inputId = 'ycol', label = 'Y Variable',
                      choices = names(df), selected = names(df)[sapply(df, is.numeric)])
 
    return(df)
 
  })
 
  x_axe <- reactive({
    data()[ , input$xcol]
  })
 
  y_axe <- reactive({
    data()[, input$ycol]
  })
 
  style <- reactive({
    input$graph
  })
 
  output$contents <- renderTable({
    data()
  })
 
  output$MyPlot <- renderPlotly({
    #x <- data()[, c(input$xcol, input$ycol)]
    p <- plotType(data(), x_axe(),
             y_axe(),
             style())
    p
 
 
  })
 
 
  output$summary <- renderPrint({
    y <- data()
    summary(y)
 
  })
 
}
 
# Create Shiny app
shinyApp(ui = ui, server = server)

**Yves86** · 18/06/2018, 22h03

Il y a une faute dans le titre. J'ai voulu ecrire : plotly

**Alpacky** · 19/06/2018, 13h04

bonjour,

si tu utilises renderPlot au lieu de renderPlotly, cela fonctionne ?
je pense que le problème vient du fait que tu ne transformes pas ton objet ggplot en ggplotly

à tester, en espérant que cela aide,
cdt,

**Yves86** · 19/06/2018, 20h21

Oui tu as parfaitement raison. Cela fonctionne avec renderPlot. Cependant, lorsque j'utilise renderPlotly et ggplotly, je recois un message d'erreur.
J'utilise ggplotly pour avoir un plus joli graphique.

Voici mon code avec renderPlotly et ggplotly.

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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  output$MyPlot <- renderPlotly({
    x <- data()[, c(input$xcol, input$ycol)]
    p <- plotType(x, input$xcol, input$ycol, input$graph)
    print(p)
    ggplotly(p)
  })

Mais je recois le message d'erreur suivant:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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Listening on http://127.0.0.1:6505
Warning in origRenderFunc() :
  Ignoring explicitly provided widget ID "24c3713fed73"; Shiny doesn't use them

En lisant sur differents forums, j'ai cru comprendre le probleme viendrait probablement de la mise a jour de mes versions.

Pourtant ma version de R ( R version 3.5.0) date du 23 Avril 2018. J'ai les versions suivantes:
- plotly_4.7.1
- shiny_1.1.0

quelqu'un pourrait-il m'aider s'il vous plait?

Amicalement,

**Alpacky** · 20/06/2018, 10h18

salut,

dans ton ui change

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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      plotOutput('MyPlot') par plotlyOutput('MyPlot')

ca fonctionne comme ca chez moi
a+

**Yves86** · 20/06/2018, 20h35

Envoyé par Alpacky

bonjour,

si tu utilises renderPlot au lieu de renderPlotly, cela fonctionne ?
je pense que le problème vient du fait que tu ne transformes pas ton objet ggplot en ggplotly

à tester, en espérant que cela aide,
cdt,

Waouh! Ca va faire plusieurs semaines que j'etais dessus! L'erreur venait donc de la!
Je te remercie infiniment pour ton aide. Tu es le meilleur!

Amities,
Yves

Inserer un graph (poorly) dans Shiny

R

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