Discussion :

[leemoon]

Bonjour a tous,

Je travaile sur les règles d'association sur les données biologiques.

Voici un exemple de mes données:

1MRVMEIRKNYQHLWKGGILLLGMLMICNVAGQLWVTVYYGVPVWKETTTTLFCASDAKGY
2MRVMEIRKNYQHLWKGGILLLGMLMICNVAGQLWVTVYYGVPVWKETTTTLFCASDAKGY
3MKVKGIRKNWQRLWKWTMLLGMLMICSATDKLWVTVYYGVPVWKEATTTLFCASDAKAY
...
9 -------------------------------- WVTVYYGVPVWKEATTTLFCASDAKAYDTEAHNVWAIHACVPTD
10 ------------------------------- WVTVYYGVPVWKEATTTLFCASDAKAYDTEAHNVWATHACVPT


10 lignes (Séquences ordonnées en fonction de temps) et la longueur d'une séquence est variable.
Ces séquences sont ordonnées à travers le temps.(l'ordre est important pour les deux dimensions). mon travail consiste a comparer les changements des symboles (les caractères) a travers les séquences pour chaque colonne.

Je n'arrive pas a trouver la structure de données appropriée pour mon problème.Sachant que après le chargement des données en mémoire, la longueur des séquences va changer après avoir supprimé certains éléments(symboles) qui sont peu fréquents.

Est ce que j'utilise deux tableux de 2 dimensions ou tableau multidimensionnel d'ArrayList de caracteres et comment les initialiser a Java.

Pouvez vous m'aider svp?.

Merci d'avance.

[anadoncamille]

Bonjour,

Tu peux utiliser un tableau de chaines de caractères, ça serait assez logique. La longueur du tableau ne pourra pas changer mais tu pourras supprimer des caractères des chaînes de caractères.

L'initialisation se fait comme suit :

String[] monTableau = new String[10];

Ensuite tu peux assigner chaque chaine à sa position :

monTableau[1] = "uneChaineDeCaractères";

Tu pourras ainsi travailler sur chaque chaine de caractères, les comparer entre elles et la structure respecte la chronologie.