Discussion :

[Eaxzm]

Bonjour !

Je rencontre une erreur lorsque j'essaie d'installer des packages, quelque soit le package que je veux installer :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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* installing *source* package ‘mgcv’ ...
** package ‘mgcv’ successfully unpacked and MD5 sums checked
** libs
clang -I/Library/Frameworks/R.framework/Resources/include -DNDEBUG   -I/usr/local/include  -fopenmp -fPIC  -Wall -g -O2  -c coxph.c -o coxph.o
clang: error: unsupported option '-fopenmp'
make: *** [coxph.o] Error 1
ERROR: compilation failed for package ‘mgcv’
* removing ‘/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.4/Resources/library/mgcv’
* restoring previous ‘/Library/Frameworks/R.framework/Versions/3.4/Resources/library/mgcv’

The downloaded source packages are in
	‘/private/var/folders/vv/xddz6gkd72b203zscw5pvyvm0000gn/T/RtmpIhLKJB/downloaded_packages’
Warning message:
In install.packages(update[instlib == l, "Package"], l, repos = repos,  :
  installation of package ‘mgcv’ had non-zero exit status

Je travaille sur MAC OS X El Capitan Version 10.11.6, R version 3.4.1.

Toute aide serait très appréciée !

Merci d'avance !

Eaxzm

[faubry]

D'après ton message, mgcv est chargé comme source et doit donc être compilé, ce qui ne peut pas se faire certainement à cause de ta configuration, et ce qui est classique si tu n'es pas développeur. J'ai eu le même type de problème pour les update (même si ce n'est pas sous Mac) et la solution que j'ai trouvé est de forcer le chargement des packages binaires en ajoutant comme argument aussi bien à install.packages qu'à update.packages, type="binary"

[Eaxzm]

Bonjour, merci beaucoup pour vos réponses.

Je ne sais par quel mystère, à présent ça marche !

Je garde ta réponse faubry pour d'autres occasions.