Discussion :

[Shyma]

Bonjour,

Voilà, j'ai deux fichiers avec à l’intérieur des données différentes, le fichier 1 ($1, $2, je voudrais l'organiser en table de hash où tab[longeur]=valeur
le fichier 1 se présente ainsi :
45 CRTTARR
594 GFIIEJ
2 GFTTG
61 GPPAN
----
----
----

Le fichier 2, est beaucoup plus volumineux, je voudrais comparer $2 des deux fichiers, si c'est le même code, j'affiche la valeur $1 du fichier1 , dans $3 du fichier 2

PS / Le tout dans un seul script

Merci de votre aide

[N_BaH]

Bonjour,

est-ce qu'on peut avoir les deux fichiers, et le résultat attendu ? on visualisera mieux.

as-tu regardé ce que join peut faire ?
ça a l'air de correspondre à ce que tu veux faire...

[Shyma]

Salut @N_BaH

Bah oui j'ai pensé à ça, mais les fichiers ne sont pas disposés pareil !

J'ai le fichier 1 qui est comme ceci ($1, $2), je voudrais l'organiser en table de H, clé/valeur, et le comparer avec le fichier 2, qui aura le même code que $2, et si c'est le cas, récupérer la valeur qui correspond dans fichier 1 et l'afficher dans le fichier2.

Fichier 1:
421 tr|Q16951|5HTB2_APLCA
509 uu|Q25414|5HTR_LYMST
4 pp|P35904|ACH1_ACHFU
531 ss|P35903|ACHC_ACHFU
229 pa|P58154|ACHP_LYMST
376 aa|Q964E3|ACTC_BIOAL
376 ll|P92179|ACTC_BIOGL
376 mr|Q964E1|ACTC_BIOOB

Fichier 2 :
NOM: tr|Q16951|5HTB2_APLCA 266 342 . Large_h 713836 737603 + 176 M 27 81 S 0 1 5 0 2 I 0 23532 3 0 2 S 1 2 M 6 18 G 0 3 M 42 126

(le fichier 2 a plusieurs lignes comme celle qui j'ai partagé, mais il n'est pas complètement comme cette ligne, j'ai pris juste la ligne qui m’intéresse pour récupérer la valeur dans le fichier1, et l'utiliser après pour un calcul d'un score)

Vous remarquez ici, le $2 des deux fichiers est le même, je voudrais donc récupérer la valeur 421 et l'afficher dans le fichier 2, donc pour tous les noms identiques récupérer les valeurs qui vont avec.

Merci de votre aide et désolée si j'ai mal expliqué

[Sve@r]

Bonjour

J'ai le fichier 1 qui est comme ceci ($1, $2)

Assez confu comme explication. C'est quoi pour toi "$1" et "$2" ???

récupérer la valeur qui correspond dans fichier 1 et l'afficher dans le fichier2.

Ca veut dire quoi la phrase "je veux afficher une valeur dans le fichier" ??? Quand on affiche c'est à l'écran qu'on affiche, pas dans un fichier...

et désolée si j'ai mal expliqué

Ben oui. Ce qui se conçoit bien s'énonce clairement.

Bon bref voici mon jeu d'essai
Fichier f1

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
3
4
5
6
7
8
421 tr|Q16951|5HTB2_APLCA
509 uu|Q25414|5HTR_LYMST
4 pp|P35904|ACH1_ACHFU
531 ss|P35903|ACHC_ACHFU
229 pa|P58154|ACHP_LYMST
376 aa|Q964E3|ACTC_BIOAL
376 ll|P92179|ACTC_BIOGL
376 mr|Q964E1|ACTC_BIOOB

Fichier f2

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

tr|Q16951|5HTB2_APLCA 266 342

Script

Code bash :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
3
4
5
6
#!/bin/bash
cat f2 |while read ligne; do
	clef=$(echo "$ligne" |cut -f1 -d' ')
	result=$(grep "$clef$" f1)
	echo $result |cut -f1 -d' '
done

Resultat:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
$ ./essai.sh 
421

[N_BaH]

les fichiers ne sont pas disposés pareil

ça n'a pas d'importance : join utilise les champs qu'on lui indique.
le plus problématique, c'est que tu ne souhaites pas récupérer la totalité du premier champ.

awk peut le faire, mais c'est à toi de t'exercer, et de nous montrer ce que tu as fait, et où tu bloques.

tu dois aussi faire un effort pour articuler ta pensée, l'exprimer de manière intelligible pour les autres, et illustrer ton propos par des exemples cohérents.
y compris quand ça ne fait pas ce que tu souhaites.

rigueur à la conception
clarté à l'énoncé

[jack-ft]

Salut @N_BaH

Bah oui j'ai pensé à ça, mais les fichiers ne sont pas disposés pareil !

J'ai le fichier 1 qui est comme ceci ($1, $2), je voudrais l'organiser en table de H, clé/valeur, et le comparer avec le fichier 2, qui aura le même code que $2, et si c'est le cas, récupérer la valeur qui correspond dans fichier 1 et l'afficher dans le fichier2.

Fichier 1:
421 tr|Q16951|5HTB2_APLCA
509 uu|Q25414|5HTR_LYMST
4 pp|P35904|ACH1_ACHFU
531 ss|P35903|ACHC_ACHFU
229 pa|P58154|ACHP_LYMST
376 aa|Q964E3|ACTC_BIOAL
376 ll|P92179|ACTC_BIOGL
376 mr|Q964E1|ACTC_BIOOB

Mon interprétation est que la 1ère ligne de "Fichier 1" contient les champs:
$1 == 421
$2 == tr|Q16951|5HTB2_APLCA

(D'ailleurs, ce serait plus clair, si on connaissait les noms des champs (genre "score" et "identifiant du joueur")

Fichier 2 :
NOM: tr|Q16951|5HTB2_APLCA 266 342 . Large_h 713836 737603 + 176 M 27 81 S 0 1 5 0 2 I 0 23532 3 0 2 S 1 2 M 6 18 G 0 3 M 42 126

(le fichier 2 a plusieurs lignes comme celle qui j'ai partagé, mais il n'est pas complètement comme cette ligne, j'ai pris juste la ligne qui m’intéresse pour récupérer la valeur dans le fichier1, et l'utiliser après pour un calcul d'un score)

Vous remarquez ici, le $2 des deux fichiers est le même,

Mon interprétation est que la 1ère ligne de "Fichier 2" contient les champs:
$1 == NOM:
$2 == tr|Q16951|5HTB2_APLCA
$3 == 266
etc.

je voudrais donc récupérer la valeur 421

Pour la ligne indiquée de "Fichier 2", le "$2" est "tr|Q16951|5HTB2_APLCA", qui correspond à la ligne de "Fichier 1" qui commence par "421".

et l'afficher dans le fichier 2, donc pour tous les noms identiques récupérer les valeurs qui vont avec.

Est-ce que tu veux faire l'équivalent de:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
3
4
5
sed -i 's/tr|Q16951|5HTB2_APLCA/421/' "Fichier 2"
 
=>
 
NOM: 421 266 342 . Large_h 713836 737603 + 176 M 27 81 S 0 1 5 0 2 I 0 23532 3 0 2 S 1 2 M 6 18 G 0 3 M 42 126

C'est bien ce que tu veux comme résultat?

Si tu veux un autre résultat, merci de nous le présenter...

Merci de votre aide et désolée si j'ai mal expliqué

[Shyma]

Tout d'abord, merci pour vos réponses !

Alors pour mieux comprendre ce que je veux faire; Comparer dans les deux fichiers, si il y a le même code, en l’occurrence comme ici, on a "tr|Q16951|5HTB2_APLCA" qui est présent dans les deux fichiers. Ensuite, si le code se trouve, récupérer la valeur qui lui correspond dans le fichier1 (ici c'est 421), pour l'afficher et pouvoir l'utiliser pour calculer le score, qui dans mon exemple (NOM: B(un premier score que j'ai calculé) 421)
J'ai besoin de calculer ce score là : (B/421)*100. (J'espère que c'est assez clair ! )

Fichier 1

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
3
4
5
6
7
8
421 tr|Q16951|5HTB2_APLCA
509 uu|Q25414|5HTR_LYMST
4 pp|P35904|ACH1_ACHFU
531 ss|P35903|ACHC_ACHFU
229 pa|P58154|ACHP_LYMST
376 aa|Q964E3|ACTC_BIOAL
376 ll|P92179|ACTC_BIOGL
376 mr|Q964E1|ACTC_BIOOB

Fichier 2

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

 NOM: tr|Q16951|5HTB2_APLCA 266 342 . Large_h 713836 737603 + 176 M 27 81 S 0 1 5 0 2 I 0 23532 3 0 2 S 1 2 M 6 18 G 0 3 M 42 126

Résultat :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

 NOM: B(un premier score que j'ai calculé) 421

En fait, j'ai un script awl, qui fait le traitement sur les deux fichiers pour générer un troisième avec les résultats de mes calculs.

Encore une fois, désolée pour ma mauvaise explication

Le $1, et $2 (du fichier1) correspondent en fait aux colonnes, $1=colonne1, $2=colonne2.

[N_BaH]

c'est bizarre,
quand on commence à te lire, on se dit que tu as compris comment exposer tes intentions,
et puis, à la fin, on se retrouve avec une nouvelle donnée, floue.

En fait, j'ai un script awl, qui fait le traitement sur les deux fichiers pour générer un troisième avec les résultats de mes calculs.

donc, tu n'as pas besoin de nous !?