Discussion :

[Newenda]

Bonjour,

J'aimerais faire tourner 3 programmes successifs (en fortran) et sauver tous les fichiers crées dans un répertoire propre (nommé models)
à la fin de chaque itération, je dois ouvrir des fichiers de paramètres, en changer quelques un et relancer tout le bousin

Pour ce faire j'ai commencé un script en bash

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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#!/bin/bash
 
models="102 103 104"
for model in $models
do
mkdir $model
../../bin/prog1
../../bin/prog2
mpirun prog3
done

Je n'ai pas avancé beaucoup alors j'aurais 2 questions :

- Comment envoyer directement les sorties de mes programmes dans le répertoire fraîchement crée (ex: 102, pour le 1er) en évitant les copié-collés

- Comment ensuite changer un paramètre dans un fichier donnée ?

Merci pour toutes aides, astuces ou conseils.

[N_BaH]

Bonjour,

Comment envoyer directement les sorties de mes programmes dans le répertoire fraîchement crée (ex: 102, pour le 1er) en évitant les copié-collés

avec une redirection, en utilisant la variable...

Comment ensuite changer un paramètre dans un fichier donnée ?

'comprends pas

[Newenda]

Bonjour,


avec une redirection, en utilisant la variable...
'comprends pas

Bonjour,

Quel genre de redirection ? car je ne peux pas utiliser

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

../../bin/prog1 > $model/result_prog1.txt

car mes fichiers de sorties sont déjà nommés par le programme en question et peuvent eux même avoir des noms compliqués suivant les paramètres donnés.
Il me faudrait un "truc" qui me disent

"quelque soit les fichiers qui proviennent de cette ligne de commande je les met dans ce répertoire"

Merci

[disedorgue]

Bonjour,

Toujours rien compris du problème.

Comment fais tu actuellement, à la main, pour résoudre ton problème ?

[Newenda]

je lance ces commandes successivement dans mon bash

../../bin/prog1
../../bin/prog2
mpirun prog3

le programme 1 me renvoi 4 fichiers utilisés dans le 2 qui lui même en sort 6 autres utilisés dans le prog 3 qui lui calcul tous résultats placés dans une multitude de fichiers.

Ensuite je copie colle tous mes résultats dans un autre répertoire que je crée à main,
je réédite 3 fichiers textes différents de paramètres qui sont utilisés par les 3 programmes,
et je relance

../../bin/prog1
../../bin/prog2
mpirun prog3

et ainsi de suite

C'est le programme 3 qui peut s'avérer très long, et c'est dans l'optique de faire bosser mon PC tout seul de nuit que j'aimerais faire un script pour qu'il puisse lancer les programmes > placer les fichiers dans un répertoire > changer les paramètres de fichiers d’initiation txt > relancer

[N_BaH]

ok, on va reprendre proprement :

tant_que (tant que quoi ?)

• édition de 3 fichiers paramètres (avec quelles données ?)
• prog1 #crée 4 fichiers (quel est le format de leurs noms ?)
• prog2 #crée 6 fichiers (idem)
• prog3 # crée z fichiers (idem)
• déplacement des z derniers fichiers (où ? et, que fait-on des 10 premiers ?)

fin tant_que

[Newenda]

ça serait plus un FOR qu'un WHILE, un for avec la liste de nom du numéro des mes modeles

Pour les 3 fichiers paramètres, il simplement de changer quelques lignes comme par exemple
0.005 #dt
en une autre valeur:
0.004 #dt
mais limite ça c'est un second problème

Les noms des fichiers textes crées sont trop complexes et ne peuvent en aucun cas être prédis par avance..

Donc ta réponse m'indique clairement que c'est pas aussi simple que je l'avais pensé. On ne peut pas directement pointé sur les fichiers crées. ou alors il faudrait faire des copier/coller à la fin mais ce que je voulais éviter de faire pour ne pas perdre de temps.

Peut être que le plus simple est de créer d'abord mes répertoires et d'y modifier dans chaque mes fichiers paramètres et de faire simplement tourner mes programmes dans ces répertoires

Je vais essayer..

Encore merci

[disedorgue]

Non, c'est peut-être faisable mais on n'a pas assez d'élément et de compréhension sur le besoin...

Personnellement, je n'ai toujours pas compris mais c'est peut-être la fatigue ou la vieillerie

[Newenda]

ou alors j'ai été trop précis et ajouter de la confusion.

En faite dans l'idée c'est tout con:

Je suis dans un répertoire avec mes 3 fichiers txt paramètres que je change à la main
je lance les 3 commandes de programme successives qui vont me sortir tout plein de fichiers dans ce même répertoire
et j'aimerais TOUT sauver dans un autre
Ensuite revenir dans l'ancien répertoire, changer mes fichiers paramètres et tout relancer
ETC.

Donc j'imagine que le plus pratique c'est de lancer les prog > faire un CP de tout le répertoire vers un autre > Revenir ds le repertoire principal > changer mes fichiers paramètres > Relancer

OU alors

Créer avant tous les répertoires avec les fichiers paramètres déjà modifés dans chaque et lancer une boucle pour faire tourner les 3 programmes dans chacun des répertoire

Ca sera plus simple non?

alors disons que j'aimerais changer un fichier texte :

je vais préciser ma question: comment remplacer une ligne d'un fichier par une autre ?

[disedorgue]

Avec sed...

[jack-ft]

Je suis dans un répertoire avec mes 3 fichiers txt paramètres que je change à la main
je lance les 3 commandes de programme successives qui vont me sortir tout plein de fichiers dans ce même répertoire

On peut donc supposer que tes programme génèrent des fichiers dans le répertoire courant (celui dans lequel tu dis "être").

et j'aimerais TOUT sauver dans un autre
Ensuite revenir dans l'ancien répertoire, changer mes fichiers paramètres et tout relancer
ETC.

Donc j'imagine que le plus pratique c'est de lancer les prog > faire un CP de tout le répertoire vers un autre > Revenir ds le repertoire principal > changer mes fichiers paramètres > Relancer

Si tu fais une copie des fichiers, ils vont rester présents pour la commande suivante qui, elle-même va copier ses résultats ainsi que ceux de la commande précédente: pas glop!
Il vaudrait mieux faire un déplacement (commande "mv" et non "cp"), mais le problème c'est de garder les fichiers de paramètres, et autant que possible, ceux-là, il faudrait les copier dans les répertoires résultats (comme ça, on a le jeu de paramètres d'entrée au même endroit que les résultats).
C'est possible, mais pas hyper facile.

OU alors

Créer avant tous les répertoires avec les fichiers paramètres déjà modifés dans chaque et lancer une boucle pour faire tourner les 3 programmes dans chacun des répertoire

Ca sera plus simple non?

Oui, ça me paraît plus simple!

alors disons que j'aimerais changer un fichier texte :

je vais préciser ma question: comment remplacer une ligne d'un fichier par une autre ?

Une ébauche (non testé) en repartant de ta proposition (dans un fichier "../../bin/ma_commande.sh"):

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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#!/bin/bash
 
models="102 103 104"
for model in $models; do mkdir "$model"; done # une bonne chose de faite...
 
# Préparation des données
 
# Pour la 1ère itération, on le garde tel quel
cp param1.txt 102/
 
# Pour la 2ème itération, on change tout ce qui doit être changé
cat param1.txt | sed -e 's|0.005 #dt|0.004 #dt|' > 103/param1.txt
 
# Pour la 3ème itération, on change tout ce qui doit être changé
cat param1.txt | sed -e 's|quelque chose|autre chose|' > 104/param1.txt
 
etc.
 
# Lancement des itérations
 
for model in $models; do
    cd "$model" # on change de répertoire courant
    ../../../bin/prog1 # avec un niveau de plus pour remonter en haut...
    ../../../bin/prog2
    mpirun prog3 # on suppose que celui-ci marche...
    cd .. # on revient au répertoire initial
done