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Calcul scientifique Python Discussion :

erreur in dicom.read_file [Python 2.X]


Sujet :

Calcul scientifique Python

Vue hybride

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  1. #1
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    Par défaut erreur in dicom.read_file
    Salut à tus
    je veux travailler avec le python mais toujours j'ai des lacunes et des erreurs qui me perturbe.
    j'ai travailler déjà avec les images png sous python et j'ai effectuer des petit traitement, maintenant je veux passer au images DICOM alors que je me suis bloque en premier pas.
    voila une partie de mon code, là ou il y a l'erreur,
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
    1
    2
    3
     
    def load_scan(path):
        slices = [dicom.read_file(path + '/' + s) for s in os.listdir(path)]
    et aussi les erreurs que j'ai:
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
    1
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    3
    4
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    6
    7
    8
    9
    File "dcmsay.py", line 35, in load_scan
        slices = [dicom.read_file(path + '/' + s) for s in os.listdir(path)]
      File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/dicom/filereader.py", line 614, in read_file
        force=force)
      File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/dicom/filereader.py", line 515, in read_partial
        preamble = read_preamble(fileobj, force)
      File "/usr/local/lib/python2.7/dist-packages/dicom/filereader.py", line 489, in read_preamble
        raise InvalidDicomError("File is missing 'DICM' marker. "
    dicom.errors.InvalidDicomError: File is missing 'DICM' marker. Use force=True to force reading
    aidez moi svp.

  2. #2
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    Salut,

    Le message d'erreur est clair et donne une solution a essayer (pour autant que vous soyez sur que le fichier est "dicom"):
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
    dicom.errors.InvalidDicomError: File is missing 'DICM' marker. Use force=True to force reading
    - W
    Architectures post-modernes.
    Python sur DVP c'est aussi des FAQs, des cours et tutoriels

  3. #3
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    désolé mais j’ai pas compris votre réponse, j'ai bien défini le répertoire ou se trouve les images dcm

  4. #4
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    j'ai un peu modifie e code voila se que j'ai comme erreurs
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
    OSError: [Errno 2] No such file or directory:'/home/images/dcm/'

  5. #5
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    Citation Envoyé par hadjira10 Voir le message
    j'ai un peu modifie e code voila se que j'ai comme erreurs
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
    OSError: [Errno 2] No such file or directory:'/home/images/dcm/'
    Ce qui vous permet de constater que lorsqu'il le fichier n'est pas trouvé, le message d'erreur est différent...

    - W
    Architectures post-modernes.
    Python sur DVP c'est aussi des FAQs, des cours et tutoriels

  6. #6
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    Par défaut
    bonjour
    je veux appliquer le code
    mais je suis bloquer en premier pas la déclaration de path, je ne sais pas pourquoi, j'utlise des fichiers "*.dcm" d'un examen IRM
    MR-001.dcm
    MR-002.dcm

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