Discussion :

[Aurélie Q.]

Bonjour à tous,

Je vous écris afin d'obtenir un peu d’aide concernant la fonction fboxplot () du package « rainbow ».
J’étudie des courbes de croissances et ai besoin de détecter les courbes aberrantes dû à des erreur de saisie lors de l’enregistrement des données.

Pour le moment, je ne travaille que sur des petites parties de mon jeu de données pour pouvoir tester le package. Je vous copie/colle un extrait de ce jeu de données où sont présents les individus dans les colonnes (V1, V2, etc.), leur âge dans la première colonne (jour 1, jour 2, …, jour 20) et à l’intérieur de la matrice, leur données de poids :

    V1  V2  V3  V4  V5  V6  V7  V8  V9 V10   V11   V12 V13
1   39.0  39  43  30  46  35  46  46  32  35  36.1  42.3  32
2   42.0  41  46  32  48  38  51  50  35  38  37.0  44.0  33
3   45.8  47  50  36  51  40  57  58  38  43  40.0  46.0  35
4   54.0  52  60  39  59  47  66  64  47  48  43.0  49.0  40
5   60.0  62  70  46  61  54  78  79  47  54  50.0  55.0  46
6   75.0  75  83  52  75  68  96  94  52  64  57.0  62.0  56
7   92.0  96  90  68  87  82 116 110  70  79  65.0  70.0  62
8  110.0 120 109  80 102  93 140 127  83  90  80.0  80.0  68
9  120.0 135 130  92 121 111 152 142  99 106  93.0  89.0  81
10 137.0 153 150 105 134 125 164 158 119 114 108.0 100.0  98
11 156.0 169 167 110 149 135 183 180 138 128 125.0 120.0 116
12 172.0 184 180 122 164 149 196 200 143 140 144.0 140.0 128
13 187.0 194 194 138 172 164 211 214 155 135 158.0 155.0 142
14 198.0 214 215 150 184 178  NA 232 172 136 170.0 165.0 163
15 216.0 235 234 162 202 200 251 247 190 134 188.0 180.0 182
16 220.0 250 250 171 205 212 271 257 208 140 197.0 190.0 203
17 248.0 273 272 178 217 224 292 272 234 158 210.0 199.0 214
18 261.0 300 278 185 229 247 294 294 248 167 220.0 202.0 228
19 272.0 330 285 199 242 260 300 301 260 169 240.0 224.0 250
20 294.0 350 305 203 248 262 317 327 279 190 249.0 233.0 260

J’ai créé un objet de classe FDS comme requis par fboxplot().
Quand je n’ai aucune valeur manquante, tout semble fonctionner, j’obtiens le graphique attendu. Par contre, lorsque j’introduis une valeur manquante, et que je tape le code :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

fboxplot(MyData,  plot.type  = "functional", type = "bag", alpha = 0.05, na.rm=TRUE)

J’obtiens le message d’erreur suivant : Error in svd(t(x)) : infinite or missing values in 'x'malgré avoir précisé na.rm=TRUEdans le code. J’ai essayé na.rm=FALSE et ai obtenu le même message, ce qui est malheureux puisque dans mon jeu de données complet, j’aurai de nombreuses données manquantes.

Je vous remercie pour l’aide que vous pourriez m’apporter,

Aurélie

[mgdondon]

Bonjour,

C'est bien d'avoir fourni des données mais pouvez-vous indiquer la fonction que vous avez utilisée pour créer un objet fds ?

Merci,