Discussion :

[morakevi]

Bonjour à tous,

j'ai développer une petite application Swing qui permet de transformer des fichier DICOM en image JPEG. Cette application fonctionne très bien quand je suis dans mon IDE. j'ai généré un jar de cette application et là ça ne fonctionne plus.

En regardant un peu de plus près, j'ai remarquer qu'il "bloquait" sur la ligne

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

Iterator iterator = ImageIO.getImageReadersByFormatName("DICOM");

.

Voici la classe entière :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28
29
30
31
32
33
34
35
36
37
38
39
40
41
42
43
44
45
46
47
48
49
50
51
52
53
54
55
56
57
58
59
60
61
62
63
64
65
66
 
public static DicomInfo extractDicomData(File file, File tempDirectory) {
    LogFile.getInstance().log("info", "start extractDicomData method");
    DicomInfo dicomInfo = new DicomInfo();
    try {
      BufferedImage image = null;
      LogFile.getInstance().log("info", "BufferedImage image = null;");
      ImageIO.scanForPlugins();
      LogFile.getInstance().log("info", " ImageIO.scanForPlugins();");
      Iterator iterator = ImageIO.getImageReadersByFormatName("DICOM");
      LogFile.getInstance().log("info", "ImageIO.getImageReadersByFormatName(\"DICOM\");");
      ImageReader reader = (ImageReader) iterator.next();
      DicomImageReadParam param = (DicomImageReadParam) reader.getDefaultReadParam();
      LogFile.getInstance().log("info", " DicomImageReadParam param = (DicomImageReadParam) reader.getDefaultReadParam();");
      ImageInputStream iis = ImageIO.createImageInputStream(file);
      reader.setInput(iis, false);
      LogFile.getInstance().log("info", "reader.setInput(iis, false);");
      image = reader.read(0, param);
      iis.close();
 
      if (image == null) {
        LogFile.getInstance().log("error", "couln't read dicom image!");
        return null;
      }
 
      File jpegFile = File.createTempFile("dicom", ".jpg", tempDirectory);
      LogFile.getInstance().log("info", "Temp file : " + jpegFile.getAbsolutePath());
      OutputStream output = new BufferedOutputStream(new FileOutputStream(jpegFile));
 
      ImageWriter writer = null;
      Iterator iter = ImageIO.getImageWritersByFormatName("jpg");
      writer = (ImageWriter) iter.next();
      ImageOutputStream ios = ImageIO.createImageOutputStream(output);
      writer.setOutput(ios);
      ImageWriteParam iwparam = new JPEGImageWriteParam(Locale.getDefault());
      iwparam.setCompressionMode(ImageWriteParam.MODE_EXPLICIT);
      iwparam.setCompressionQuality(Float.parseFloat(PropertiesCache.getInstance().getProperty("CompressionQuality")));
      writer.write(null, new IIOImage(image, null, null), iwparam);
      ios.flush();
      writer.dispose();
      ios.close();
      output.close();
      dicomInfo.setImage(jpegFile);
      dicomInfo.setSourcePath(file);
    } catch (Exception ex) {
      LogFile.getInstance().log("error", "No image available in this dicom file " + file.getName());
      LogFile.getInstance().log("Exception", ex.getMessage());
      return null;
    }
 
    try {
      DicomInputStream dicomInputStream = new DicomInputStream(file);
      DicomObject object = dicomInputStream.readDicomObject();
      dicomInfo.setStudyDate((Date) getMetaData(object, "Study Date", Types.DATE));
      dicomInfo.setStudyDescription((String) getMetaData(object, "Study Description", Types.VARCHAR));
      dicomInfo.setPatientName((String) getMetaData(object, "Patient’s Name", Types.VARCHAR));
      dicomInfo.setPatientId((Long) getMetaData(object, "Patient ID", Types.BIGINT));
      dicomInfo.setPatientBirthdate((Date) getMetaData(object, "Patient’s Birth Date", Types.DATE));
      dicomInfo.setPatientSex((String) getMetaData(object, "Patient’s Sex", Types.VARCHAR));
    } catch (IOException ex) {
      LogFile.getInstance().log("error", "unable to get METADATA");
      LogFile.getInstance().log("Exception", ex.getMessage());
    }
 
    return dicomInfo;
  }

Comme vous pouvez le voir, j'ai ajouter des logs pour voir jusqu’où il va et c'est là que j'ai vu que dès que j'utilise ImageIO, il ne va pas plus loin.

J'ai également regarder avec ceci ->

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

java -verbose -jar dicomUpload.jar

et voici ce que ça donne (cf pièce jointe) et là je vois des messages d'erreur comme

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
3
4
5
6
7
8
Loaded java.lang.ClassNotFoundException from C:\Program Files\Java\jre1.8.0_77\lib\rt.jar]
[Loaded java.lang.LinkageError from C:\Program Files\Java\jre1.8.0_77\lib\rt.jar]
[Loaded java.lang.NoClassDefFoundError from C:\Program Files\Java\jre1.8.0_77\lib\rt.jar]
[Loaded java.lang.ClassCastException from C:\Program Files\Java\jre1.8.0_77\lib\rt.jar]
[Loaded java.lang.ArrayStoreException from C:\Program Files\Java\jre1.8.0_77\lib\rt.jar]
[Loaded java.lang.VirtualMachineError from C:\Program Files\Java\jre1.8.0_77\lib\rt.jar]
[Loaded java.lang.OutOfMemoryError from C:\Program Files\Java\jre1.8.0_77\lib\rt.jar]
[Loaded java.lang.StackOverflowError from C:\Program Files\Java\jre1.8.0_77\lib\rt.jar]

est-ce que quelqu'un a une idée de l'origine du problème ? car ça fait des heures que je suis dessus sans succès.

Merci d'avance pour vos réponses