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Shell et commandes GNU Discussion :

Lecture de fichier de données et stockage dans des variables.


Sujet :

Shell et commandes GNU

Vue hybride

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  1. #1
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    Par défaut Lecture de fichier de données et stockage dans des variables.
    Bonjour à tous !!

    Je suis débutant en ce qui concerne le shell et les commandes Bash, et je voudrais créer un petit script qui me permettrait d'avancer plus vite dans mon travail. Voici le cadre et l'objectif général : J'ai un programme qui tourne, prenant en compte des paramêtres d'imput étant stockés dans un fichier .par. Mon étude consiste à modifier ces paramètres et voir ce que ça va donner sur le résultat final.

    Ce que je veux faire : j'ai crée un fichier .txt dans lequel j'ai stocké les différentes valeurs de ces paramètres sous la forme de deux colonnes séparées par un espace. Je voudrais créer un script bash qui contiendrait une boucle lisant ligne à ligne ce fichier .txt de telle manière qu'à chaque tour de boucle, je stocke les deux valeurs de la ligne dans deux variables différentes, puis je les reporte dans le fichier .par en le modifiant, et ensuite je lance le programme général, et stocke les résultats dans un dossier.

    Je sais comment faire lancer le programme, créer le nouveau dossier et stocker les résultats. Mon principal problème et la lecture du fichier et le stockage dans des variables, ce que je ne sais pas faire. Si par ailleurs vous avez des conseils sur des commandes à utiliser pour la modification du fichier .par, je suis preneur

    Merci beaucoup !

    Liris

  2. #2
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    Par défaut
    manifestement tu a deja compris les logiques de bases

    et l approche est la bonne (lecture ligne a ligne de fichier de référence

    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    ...
    while read
    do
    .....
    traitement >> fichierresultat
    .....
    done < fichier
    .....

    par exemple

    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    francois@baal:~$ echo toto titi > f1
    francois@baal:~$ while read; do va=$(echo $REPLY|cut -d" " -f1) ; vb=$(echo $REPLY|cut -d" " -f2); echo $vb" "$va >> sortie; done < f1
    francois@baal:~$ cat sortie
    titi toto
    francois@baal:~$
    vb=$(echo $REPLY|cut -d" " -f2) utiliser un echo pour couper un chaine est pas optimise mais pour comprendre c est plus simple

    $REPLY est la variable iterative de while il est donc pas utile de la REdeclarer
    va et vb par contre sont des variable a moi variable=valeur
    ici valeur = resultat de la commande entre $(...)

    ici la boucle ne fait qu une ligne de fichier mais qu importe c est juste un exemple avec 8096 lignes c est meme principe


    je te laisse adapter tester

  3. #3
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    Par défaut
    C'est exactement ce qu'il me fallait pour couper ma chaine en deux !!!

    Que pensez-vous d'un syntaxe sous cette forme :

    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    while IFS=: read -r var1 var2
    do
    ....
     
    done < file.txt
    Dans ce cas, à quoi sert le -r ?

    Additionnel : Avec la boucle while, comme fais-je pour sauter les deux première lignes ?

    EDIT : j'ai pas mal avancé, et j'en suis au niveau où je dois remplacer la nouvelle valeur du paramètre dans le fichier .par.
    Voici le code que j'utilise :

    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    #!/bin/bash
     
    IMPUTFILE="Lambda.par"
    PARFILE="dun_explo.par.mmm"
     
     
    while IFS=: read Trans Dep
    do
    echo $Trans
    echo $Dep
     
    varline=$(cat $PARFILE | grep "Lambda_C =")
    var1="Lambda_C = ${Dep}"
     
    sed -i "s/^\${varline}.*/\${var1}/" ${PARFILE}
     
    done < $IMPUTFILE
    Néanmoins, le PARFILE n'est pas du tout modifié à la fin de l'exécution de la commande sed et je n'arrive pas à comprendre pourquoi ...


    Merci !

    Liris

  4. #4
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    Par défaut
    Bonjour

    Parce que la substitution ne se fait pas, car le motif n'est pas reconnu. Pourquoi avoir échappé le $ ?

  5. #5
    Modérateur
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    Par défaut
    Bonjour,

    Dans ce cas, à quoi sert le -r ?
    à empêcher des caractères d'être interprétés par un backslash :
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    $ read var <<<'\u00e8'
    $ printf "$var\n"
    u00e8
    $ read -r var <<<'\u00e8'
    $ printf "$var\n"
    è
    NB : veille à toujours mettre tes variables entre guillemets.
    N'oubliez pas de consulter les cours shell, la FAQ, et les pages man.

  6. #6
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    Par défaut
    Merci pour vos réponses !

    Citation Envoyé par Flodelarab Voir le message
    Bonjour

    Parce que la substitution ne se fait pas, car le motif n'est pas reconnu. Pourquoi avoir échappé le $ ?
    Qu'entends-tu par "échappé le $" ? ^^'

    J'ai de plus un second problème car la variable $Dep (resp. $Trans) est vide au moment de l'attribution , alors que pourtant le
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
    1
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     echo $Trans
    echo $Dep
    affiche bien les deux bonnes valeurs .. Comme si ces variables n'étaient bien attribuées qu'à ce moment la .

    NB : veille à toujours mettre tes variables entre guillemets.
    Il me semble bien l'avoir fait partout, non ? Ou dois-je aussi en mettre à
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
    varline=$(cat $PARFILE | grep "Lambda_C =")
    qui deviendrait donc
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
    varline="$(cat $PARFILE | grep "Lambda_C =")"
    .

  7. #7
    Modérateur
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    Par défaut
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
    varline=$(cat "$PARFILE" | grep "Lambda_C =")
    une substitution de commandes n'a pas besoin d'être entre guillemets lors une assignation.
    N'oubliez pas de consulter les cours shell, la FAQ, et les pages man.

  8. #8
    Expert confirmé Avatar de disedorgue
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    Par défaut
    Bonjour,

    Echapper veut dire pourquoi avoir mis un "\" devant les "$" de ta ligne sed, car c'est ce qui empêche l'interprétation des variables...

    Sinon, personnellement, j'aurai fait une boucle qui crée un fichier sed qui contient toutes les commandes de remplacement et une fois la boucle terminée, je lancerais le sed avec son fichier de commande sur le PARFILE.
    Ceci pour n'avoir à modifier le fichier qu'une seule fois et non pas n fois.

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