Discussion :

[PaulEndymion]

Bonjour,

Ça fait peu de temps que je me suis mis au technologies du web, et je patauge encore entre les différentes bibliothèques javascript. En ce moment j'essaye de modifier un exemple de heatmap ( http://www.highcharts.com/demo/heatmap-canvas )

fonction:

Code :

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    */
    (function (H) {
        var Series = H.Series,
            each = H.each;
 
        /**
         * Create a hidden canvas to draw the graph on. The contents is later copied over
         * to an SVG image element.
         */
        Series.prototype.getContext = function () {
            if (!this.canvas) {
                this.canvas = document.createElement('canvas');
                this.canvas.setAttribute('width', this.chart.chartWidth);
                this.canvas.setAttribute('height', this.chart.chartHeight);
                this.image = this.chart.renderer.image('', 0, 0, this.chart.chartWidth, this.chart.chartHeight).add(this.group);
                this.ctx = this.canvas.getContext('2d');
            }
            return this.ctx;
        };
 
        /**
         * Draw the canvas image inside an SVG image
         */
        Series.prototype.canvasToSVG = function () {
            this.image.attr({ href: this.canvas.toDataURL('image/png') });
        };
 
        /**
         * Wrap the drawPoints method to draw the points in canvas instead of the slower SVG,
         * that requires one shape each point.
         */
        H.wrap(H.seriesTypes.heatmap.prototype, 'drawPoints', function () {
 
            var ctx = this.getContext();
 
            if (ctx) {
 
                // draw the columns
                each(this.points, function (point) {
                    var plotY = point.plotY,
                        shapeArgs;
 
                    if (plotY !== undefined && !isNaN(plotY) && point.y !== null) {
                        shapeArgs = point.shapeArgs;
 
                        ctx.fillStyle = point.pointAttr[''].fill;
                        ctx.fillRect(shapeArgs.x, shapeArgs.y, shapeArgs.width, shapeArgs.height);
                    }
                });
 
                this.canvasToSVG();
 
            } else {
                this.chart.showLoading('Your browser doesn\'t support HTML5 canvas, <br>please use a modern browser');
 
                // Uncomment this to provide low-level (slow) support in oldIE. It will cause script errors on
                // charts with more than a few thousand points.
                // arguments[0].call(this);
            }
        });
        H.seriesTypes.heatmap.prototype.directTouch = false; // Use k-d-tree
    }(Highcharts));
 
 
    var start;
    $('#container').highcharts({
 
        data: {
            csv: document.getElementById('csv').innerHTML,
            parsed: function () {
                start = +new Date();
            }
        },
 
        chart: {
            type: 'heatmap',
            margin: [60, 10, 80, 50]
        },
 
 
        title: {
            text: 'Highcharts extended heat map',
            align: 'left',
            x: 40
        },
 
        subtitle: {
            text: 'Temperature variation by day and hour through 2013',
            align: 'left',
            x: 40
        },
 
        xAxis: {
            type: 'datetime',
            min: Date.UTC(2013, 0, 1),
            max: Date.UTC(2014, 0, 1),
            labels: {
                align: 'left',
                x: 5,
                y: 14,
                format: '{value:%B}' // long month
            },
            showLastLabel: false,
            tickLength: 16
        },
 
        yAxis: {
            title: {
                text: null
            },
            labels: {
                format: '{value}:00'
            },
            minPadding: 0,
            maxPadding: 0,
            startOnTick: false,
            endOnTick: false,
            tickPositions: [0, 6, 12, 18, 24],
            tickWidth: 1,
            min: 0,
            max: 23,
            reversed: true
        },
 
        colorAxis: {
            stops: [
                [0, '#3060cf'],
                [0.5, '#fffbbc'],
                [0.9, '#c4463a'],
                [1, '#c4463a']
            ],
            min: -15,
            max: 25,
            startOnTick: false,
            endOnTick: false,
            labels: {
                format: '{value}℃'
            }
        },
 
        series: [{
            borderWidth: 0,
            nullColor: '#EFEFEF',
            colsize: 24 * 36e5, // one day
            tooltip: {
                headerFormat: 'Temperature<br/>',
                pointFormat: '{point.x:%e %b, %Y} {point.y}:00: <b>{point.value} ℃</b>'
            },
            turboThreshold: Number.MAX_VALUE // #3404, remove after 4.0.5 release
        }]
 
    });
    console.log('Rendered in ' + (new Date() - start) + ' ms'); // eslint-disable-line no-console
 
});

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<pre id="csv" style="display: none">Date,Time,Temperature
2013-01-01,0,1.3
2013-01-01,1,1.4
2013-01-01,2,1.6
2013-01-01,3,2.0
2013-01-01,4,2.4
2013-01-01,5,17
2013-01-01,6,3.1
2013-01-01,7,2.8
2013-01-01,8,2.8
2013-01-01,9,2.7
2013-01-01,10,3.4
2013-01-01,11,2.6
2013-01-01,12,2.4
2013-01-01,13,2.9
2013-01-01,15,2.8
2013-01-01,14,2.8
2013-01-01,16,2.2
2013-01-01,18,1.7
2013-01-01,17,1.8
2013-01-01,19,1.8
2013-01-01,20,1.8
2013-01-01,21,1.7
2013-01-01,22,1.7
2013-01-01,23,2.2
2013-01-02,0,2.2
2013-01-02,1,2.1
2013-01-02,2,1.9
2013-01-02,3,2.0
2013-01-02,4,2.0
2013-01-02,5,2.0
...
</pre>

Ce que j'aimerais faire c'est utiliser ce modèle mais à partir d'une matrice à axes complètement différents avec une data du même type que je pourrais produire en perl... Malheureusement je n'arrive pas à introduire des nouvelles catégories dans la fonction et j'ai du mal a voir ce qui cloche.
J'avoue que je patauge entre tout ces formats de data que je peu voir chez highcharts ou protovis...

Voilà c'est un petit appel à l'aide

Bon dimanche !

Paul.

[NoSmoking]

Bonjour,
je dois admettre que j'ai du mal à comprendre sur quoi tu coinces, écriture des données, exploitation des données ou ... ?

Dans l'exemple que tu montres les données sont contenues dans un pseudo Array (balise PRE) et chaque ligne représente une enregistrement avec comme données : Date, Heure, Température séparées par une virgule.

[PaulEndymion]

Bonjour,

Mes données seront générées automatiquement après une requête utilisateur, la forme n'est pas un problème ce sera le travail de mon script perl, mais comment définir des nouveaux axes X et Y dans la fonction sans faire planter le tout? Je tâtonne, vraiment,.
Cette même valeur "Date" est mon problème, dans le javascript il est déclaré une fonction Date(), ligne 73, dont je ne veux justement pas me servir.

Mon but final est de pouvoir présenter une heatmap de taille variable (entre 10/200 x et 500/1000 y) dont les valeurs soit 1 soit 0. Pour l'instant je génère surtout des version très épuré et peu appréciable avec des versions plus classique de heatmap mais j'aimerais rendre un truc classe. Cette exemple de heatmap est exactement ce qu'il me faudrait du coup.

merci d'avoir pris le temps de répondre!

[NoSmoking]

Cette même valeur "Date" est mon problème, dans le javascript il est déclaré une fonction Date(), ligne 73,...

ne t'en soucis pas le moindre du monde, dans ton code tu peux même les mettre en commentaires, cela n'est la que pour indiquer le temps de traitement des données.

Code :

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data: {
    csv: document.getElementById('csv').innerHTML,
    parsed: function () {
        alert('traitement terminé!');
    }
},

Documentation : parsed: Function.

[PaulEndymion]

Ok, mais quant je rentre un échantillon de mes données j'ai une page blanche en resultat... Voilà ce que j'ai donné à mon fichier html:

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 <pre id="csv" style="display: none">Megacluster,Virus,hit
meg1,59_Coral_002,1
meg1,66_Microbialites_001,1
meg1,68_Microbialite_003,1
meg1,Bourget_052,1
meg1,Bourget_154,1
meg1,Bourget_164,1
meg1,Bourget_224,1
meg1,Bourget_245,1
meg1,Bourget_248,1
meg1,Bourget_259,1
meg1,Bourget_309,1
meg1,Bourget_332,1
meg1,Bourget_504,1
meg1,Bourget_523,1
meg1,Bourget_915,1
meg1,CF7ML_001,1
meg1,Human_feces_A_013,1
meg1,Human_feces_A_016,1
meg1,Human_feces_A_019,1
meg1,Human_feces_A_020,1
meg1,Human_feces_A_021,1
meg1,Human_feces_A_029,1
meg1,Human_feces_A_032,1
meg1,Human_feces_A_033,1
meg1,Human_feces_A_034,1
meg1,Human_feces_A_047,1
meg1,Human_feces_A_048,1
meg1,Human_feces_B_007,1
meg1,Human_feces_B_020,1
meg1,Human_feces_B_021,1
meg1,Human_feces_B_023,1
meg1,Human_feces_B_029,1
meg1,Human_feces_B_039,1
meg1,Human_feces_B_068,1
meg1,Human_feces_C_010,1
meg1,Human_feces_C_014,1
meg1,Human_feces_C_016,1
meg1,Human_feces_C_029,1
meg1,Human_feces_C_031,1
meg1,Human_feces_C_043,1
meg1,Human_feces_D_008,1
meg1,Human_feces_D_014,1
meg1,Human_feces_D_015,1
meg1,Human_feces_D_022,1
meg1,Human_feces_D_031,1
meg1,Human_feces_D_045,1
meg1,Human_feces_E_007,1
meg1,Human_feces_E_009,1
meg1,Human_feces_E_010,1
meg1,Human_feces_E_011,1
meg1,Human_feces_E_017,1
meg1,Human_gut_21_005,1
meg1,Human_gut_21_019,1
meg1,Human_gut_22_017,1
meg1,Human_gut_24_085,1
meg1,Human_gut_27_015,1
meg1,Human_gut_27_035,1
meg1,Human_gut_30_017,1
meg1,Human_gut_30_040,1
meg1,Human_gut_31_037,1
meg1,Human_gut_31_045,1
meg1,Human_gut_31_054,1
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meg1,Human_gut_32_012,1
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</pre>

Et voilà de quoi je part avant que ça me fasse une page blanche :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
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93
94
95
96
97
98
99
100
101
102
<html>
 
 
   <script type="text/javascript" src="https://ajax.googleapis.com/ajax/libs/jquery/1.8.2/jquery.min.js"></script>
 
 
    <script src="Highcharts/js/highcharts.js"></script>
    <script src="https://code.highcharts.com/modules/data.js"></script>
<script src="https://code.highcharts.com/modules/heatmap.js"></script>
<script src="https://code.highcharts.com/modules/exporting.js"></script>
 
 
   <script src="myhitmap.js"></script>
 
    <head><title>Mon index</title></head>
 
    <body>
 
        <div id="container" style="height: 320px; width: 1000px; margin: 0 auto"></div>
 
 
        <pre id="csv" style="display: none">Date,Time,Temperature
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2013-01-01,19,1.8
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2013-01-01,21,1.7
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2013-01-02,1,2.1
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2013-01-02,11,2.7
2013-01-02,12,2.6
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2013-01-02,19,2.2
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2013-01-02,21,1.9
2013-01-02,22,1.8
2013-01-02,23,2.2
2013-01-03,0,2.2
2013-01-03,1,1.9
2013-01-03,3,0.7
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2013-01-03,10,4.7
2013-01-03,11,6.1
2013-01-03,12,5.7
2013-01-03,13,5.9
2013-01-03,14,6.3
2013-01-03,15,6.4
2013-01-03,16,6.4
2013-01-03,17,6.5
2013-01-03,18,6.5
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2013-01-03,20,6.0
2013-01-03,21,5.4
2013-01-03,22,4.7
2013-01-03,23,4.0
 
</pre>
 
 
 
    </body>
 
</html>

[NoSmoking]

Je pense qu'il faut que tu trouves une autre représentation graphique car tes données ne correspondent pas aux formats attendus et traités par ce type de présentation.

[PaulEndymion]

Sans vouloir vous offusquer, vous comprendrez qu'il me serait difficile d'accepter cette conclusion que vous proposez à mon problème.

Je pourrais très bien produire des heatmap plus simple en png avec R et les téléchargés sur ma page, mais mon but c'est d'utiliser du javascript.
La heatmap en soit n'est qu'une matrice représentée de manière dynamique si je puis dire, donc ici je ne vois pas pourquoi il y aurait un problème de représentation.

Mais en effet, je suis toujours à la recherche d'autres library en parallèle...

[NoSmoking]

Ce que je voulais dire, et que j'ai dit, c'est que le choix de cette représentation graphique avec cette bibliothèque ne correspond pas au style de données manipulées.

Pour chaque Megacluster parmi les x Megacluster, ils existent x Virus qui ont chacun un hit.

[PaulEndymion]

Alors si j'ai bien compris, c'est la représentation graphique en heatmap qui vous semble mal adapté?
Quel type de représentation graphique utiliseriez vous donc pour représenter une matrice de 100x/100x alors?

Pour chaque Jour parmis les x Jour, il existe x heures qui ont chacun une température.
Pour chaque Megacluster parmi les x Megacluster, il existe x Virus qui ont chacun un hit.
Je ne vois pas ce qui cloche là dedans.

[NoSmoking]

Je ne vois pas ce qui cloche là dedans.

les données de l'axe des Y, les heures dans l'exemple, qui sont communes à toutes les "colonnes" ce qui n'est pas le cas avec tes données.

Quel type de représentation graphique ...

Je verrais plutôt, à priori, la catégorie "Column and bar charts"

[PaulEndymion]

Hello,

J'avais pas vus ta réponse, j'irais jeter un œil. Du coup je me suis rediriger vers D3 qui possède pas mal de doc très intéressantes (tuto youtube de Vienno), ça m'a pris quelques jours pour apprendre les bases et je me sens plus à mon aise maintenant. Je m'amuse beaucoup avec les force directed layout .
J'ai mis de côté highcharts, il doit y avoir de quoi fouiller un peu plus mais j'ai trouver que ce n'était rien comparé au ressources de D3.js. Je suis notamment tomber sur des banques d'exemples simplifiés et ré-exploitables comme C3.js qui sont très intéressantes.

Après dans l'ensemble toutes les libraries proposent plus ou moins les même types de graphs mais j'ai trouver que D3 était une des plus facile à manipuler.
Ici quelques exemples que j'ai réutiliser :
http://mbostock.github.io/protovis/ex/nba.html
http://mbostock.github.io/protovis/ex/matrix.html

Voilààà je considère la question comme résolue.