Bonjour,
J'ai un ensemble d'entêtes avec leurs séquences:
Voici un exemple:
Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
>channel_109_read_10_twodirections_Corr
CTAATTAATGAAAACGTCCTTGGCAAATGCT-TTC-GCAGTAGTTAGTCTTCAATAAATCCAAGAATTTCACCTCTGACAAT
>channel_109_read_10_template
TACTTTAATGAAAACGTCCTTGGCAAATGCT-TTCGCAGTAGTTAGTCTTCAATAAATCCAAGAATTTCACCTCTGACAATTGAATACTGATGCCCCCGACCGTCC
>channel_42_read_11_twodirections
TCCTACCGCACCCTGCATTCGAACCGACTTCTAATGTTCGACCGCAAACC
>channel_396_read_70_complement_CC
ATATCGGAGCCAATGTATATCGAGAAAATCCGTGAAGATATCAGACAGGTAGAGAACCTTTTAAATAAAGAAAATGTAAAGATTACGGT
>channel_113_read_8_twodirections
CTAAGGTTTAGTCATGGAGAAGACAAGTTCGAAAAGAGTTTGGAAACGAATTCGAGTAGGCTTGTCGTTCGTTATGTTTTTGTAAATGGCCTCGTCAAAC
Comme vous voyez il y a des séquences qui contiennent "template" et compelement et moi je veux éliminer ces séquences avec leurs entêtes.
Est-ce que vous pouvez m'aider sur ce problème?
Merci