Programmation transcription ADN en ARNm

**VincentBr** · 21/02/2015, 12h27

Si quelqu'un pouvais aider un jeune padawan, ça serait super !

Voici mon code:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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def ADN2arn(ch):
    texte = traitement_fichier(ch)
    transcription = {'T':'a','A':'u','G':'c','C':'g'}
    texte_transcrit = ''
 
    for lettres in transcription:
        texte_transcrit = texte.replace(lettres,transcription[lettres])
 
    return texte_transcrit
 
print(ADN2arn('chromo.txt'))

Je voudrais remplacer chaque lettres majuscules présentent dans le dictionnaire par les lettres minuscules correspondantes.
Mais lorsque je fais tourner le programme ...

Liste initiale -> TCAGTGTTAGTGTTAGTGTTAGTATTAGGGTGTGGTGTGTGGGTGTGGTGTGGGTGTGGGTGTGGGTGTG
GGTGTGGGTGTGGGTGTGGTGTGGTGTGTGGGTGTGGTGTGGGTGTGGTGTGTGTGGG

Liste retournée -> TCAcTcTTAcTcTTAcTcTTAcTATTAcccTcTccTcTcTcccTcTccTcTcccTcTcccTcTcccTcTc\
ccTcTcccTcTcccTcTccTcTccTcTcTcccTcTccTcTcccTcTccTcTcTcTccc

Il a seulement choisit de changer le G ..
Pourquoi pas les autres lettres ?

**plxpy** · 21/02/2015, 12h55

Bonjour

je ne me prononce pas sur la méthode. Mais, l'explication est très simple.

A chaque itération, tu ré-affectes texte_transcrit (et donc tu écrases allègrement ce qui a pu être fait avant). L'ordre étant (presque ...) quelconque quand on parcourt un dictionnaire, tu n'as droit, au final, qu'à la dernière itération : dans le cas présent, 'G' a été transformé en 'c'.

**VincentBr** · 21/02/2015, 13h04

Ah d'accord ! Mais je ne vois pas vraiment comment resoudre mon probleme ..

Vous pensez à quelle autre méthode s'il vous plait ?

**plxpy** · 21/02/2015, 13h10

Envoyé par VincentBr

Mais je ne vois pas vraiment comment resoudre mon probleme ..

Oh ! Travailler sur une chaine mise à jour, itération après itération, pardi. Ne pas repartir de la chaine initiale mais de la chaine modifiée (par les itérations précédentes)