Discussion :

[zimamouche1]

Bonjour,

J'aimerais savoir comment utiliser ce programme qui s'appelle « Baliscore.c »
Ce programme a été développé pour mesurer la qualité d'un alignement multiple par rapport à un alignement de référence.
ce programme necessite 2 fichiers au format MSF.
Le premier, ref_aln.msf : contient l'alignement qu'on veut tester ;
Le deuxième, test_aln : contient l'alignement de référence de balibase ;
Le problème c'est que le programme affiche un message d'erreur :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

Cannot open reference aln file [null]

pourtant j'ai placé mes deux fichiers dans le même endroit que mon programme.

Vous trouverez en pièces jointes les 2 fichiers MSF avec le programme « baliscore.c ».
Le programme est disponible sur ce site :programme baliscore
Veuillez ré-enregistrer les deux fichiers texte au format MSF parce que je ne peux par les charger sous ce format.

Merci d'avance.

[ram-0000]

Tu peux peut être passer le chemin complet du fichier à ouvrir pour tester

Autre chose, dans ton debugger, tu dois pouvoir spécifier le répertoire par défaut (working directory) dans lequel le programme démarre (c'est peut être/probablement cela ton problème, le working directory n'est pas forcément l'endroit où se trouve ton binaire).

[zimamouche1]

Tu peux peut être passer le chemin complet du fichier à ouvrir pour tester

Autre chose, dans ton debugger, tu dois pouvoir spécifier le répertoire par défaut (working directory) dans lequel le programme démarre (c'est peut être/probablement cela ton problème, le working directory n'est pas forcément l'endroit où se trouve ton binaire).

Merçi mon frére ça marche avec la premiére technique

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

fopen("monfichier.msf","r")

[kouka23]

Merçi mon frére ça marche avec la premiére technique

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

fopen("monfichier.msf","r")

salut à tous .. je suis vraiment débutante dans ce domaine .. je voulais tester ce programme balibase.c .. j'ai essayé d'exécuter votre exemple mais ça marche pas .. il m'affiche le message suivant :
where ref_aln reference alignment in msf format
test_aln test alignment in msf format
annot_file optional BAliBASE annotation file
-v verbose mode

j'espère que je trouve de l'aide
Merci d'avance