Discussion :

[haydens]

Bonjour à tous,

A l'aide la library ade4, j'ai fait une acp :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

z <- dudi.pca(data, center = T, scale = T, scannf = F)

J'arrive à obtenir les coordonnées des deux premières composantes principales :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

z$li

Mais je n'arrive pas à retrouver ces valeurs avec les données des individus.
En effet, lorsque je prends z$co que je multiplie par la première ligne de data, je n'obtiens pas du tout les valeurs dans z$li. J'imagine que ce n'est pas comme cela qu'il faut faire.

Donc est-ce que z$co est bien les composantes principales ? Comment obtenir les coordonnées des individus ?

Merci à tous

[haydens]

J'ai un peu avancé.

Donc en fait, je prenais mes données brutes. Or il fallait les centrer et les réduire (oups .... ). Donc j'ai vérifié que les données dans z$tab sont bien les données centrées réduites puis j'ai fait :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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DataCR=as.matrix(z$tab)
PrinComp1=as.vector(z$co[,1])
PrinComp2=as.vector(z$co[,2])
 
CoordPrin1=DataCR %*% PrinComp1
CoordPrin2=DataCR %*% PrinComp2

Et donc CoordPrin1 est proportionnel à z$li[,1] (coef 0.44)
et CoordPrin2 est proportionnel à z$li[,2] (coef 1.22)

Donc j'ai pas mal avancé mais je ne comprends pas pourquoi mon résultat est propotionnel et non pas égal a celui du programme.

Merci d'avance