Discussion :

[salma1990]

bonjour,

je suis en train de traduire l'algorithme d'alignement local "smith_waterman" en un programme c++ mais je suis vraiment coincée là!
l'algorithme ne doit pas rester tel qu'il est! il y a des modifications à faire.
en effet:
-le score d'alignement est égal à: 100/(nombre de caractères de la promière séquence) dans le cas d'un match
-le score d'alignement est égal à: -(100/(nombre de caractères de la promière séquence)) dans le cas d'un mismatch.
d'une manière à ce que le score maximal existant dans la matrice ne dépasse pas 100.

Mon problème c'est que je trouve des valeurs supérieures à 100 dans la matrice ce qui n'est pas admissible.

qui parmi vous aura l'amabilité de m'aider s'il vous plait?

merci,

[GeantVert13]

l'erreur est là: suis la direction de mon doigt...

Plus sérieusement, ça va être dur de t'aider sans voir ce que tu as fait.

[salma1990]

vous voulez que je vous copie tout le programme?

[GeantVert13]

vous voulez que je vous copie tout le programme?

ben au moins la partie qui alimente la matrice

[GeantVert13]

juste une tentative dans le vide... es-tu sure que "nombre de caractères de la première séquence" est toujours > 0 ?

[salma1990]

oui oui! en fait c'est l'utilisateur qui tape les deux séquences comme entrées à chaque fois que je fais un essai je tape deux séquences qui ne sont pas vides