Deux requetes en une seule

**hajarita** · 14/12/2012, 15h35

Bonjour,

je m'explique:

Mes données sont organisées comme cela:
Sequence-Charge-Modification-Intensite-Replicat-Fraction-Analyse
Seq1-2-modif1-2.5-1-1-A
Seq1-2-modif1-3.5-1-2-A
Seq1-2-modif1-2.5-1-3-A
Seq1-2-modif1-0-2-1-A
Seq1-2-modif1-22.5-2-2-A
Seq1-2-modif1-12.5-2-3-A
Seq1-2-modif1-7-3-1-A
Seq1-2-modif1-5-3-2-A
Seq1-2-modif1-5.9-3-3-A
Seq1-2-modif1-29.5-1-1-B
Seq1-2-modif1-12.5-1-2-B
Seq1-2-modif1-22.5-1-3-B
Seq1-2-modif1-2.9-2-1-B
Seq1-2-modif1-7.4-2-2-B
Seq1-2-modif1-3.5-2-3-B
Seq1-2-modif1-0-3-1-B
Seq1-2-modif1-1.2-3-2-B
Seq1-2-modif1-7.7-3-3-B

Au début j'avais ça, comme résultat à afficher :
################################################################
Sequence-Charge-Modification-Intensite_A-Intensite_B- Replicat
Seq1-2-modif1-8.5-64.5-1
Seq1-2-modif1-42-13.8-2
Seq1-2-modif1-17.9-8.9-3
################################################################
donc la requête que j'avais fait c'est cella:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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SELECT Sequence,
		Charge,
		Modification,
		Replicat,
	SUM(
		CASE
			WHEN Analyse = 'A' THEN Intensite
			ELSE 0
		END
	) AS Intensite_A,
	SUM(
		CASE
			WHEN Analyse = 'B' THEN Intensite
			ELSE 0
		END
	) AS Intensite_B,
	URL
FROM Peptide
GROUP BY Sequence, Charge, Modification, Replicat

maintenant je dois afficher les intensités normalisée:
#########################################################################################
Sequence-Charge-Intensite_A- Intensite_A_norm-Intensite_B-Intensite_B_norm- Replicat
Seq1-2-modif1-8.5- -64.5- -1
Seq1-2-modif1-42- -13.8-- 2
Seq1-2-modif1-17.9- -8.9- -3
##########################################################################################
où dans chaque replicat:
Intensite_A_norm = Intensite_A /somme_A
Intensite_B_norm = Intensite_B / somme_B

pour calculer la somme des intensités dans chaque replicat et dans chaque analyse, je fait cette requete:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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SELECT   
		SUM(
			CASE
				WHEN Analyse = 'A'
				THEN Aire
				ELSE 0
			END ) AS som_A , 
			SUM(
			CASE
				WHEN Analyse = 'B'
				THEN Aire
				ELSE 0
			END ) AS som_B
	FROM Peptide
GROUP BY Replicat

Mon problème est que je ne sais pas comment faire pour inclure cette seconde requête dans la première et ainsi calculer les les intensité normalisée

merci d'avance

**CinePhil** · 14/12/2012, 15h49

C'étaient mes requêtes ça non ?

Dans la première, je constate quand même qu'il manque URL dans le GROUP BY.

Comme, si je ne me trompe, la seconde requête ne donne qu'une seule ligne de résultat, tu dois pouvoir, sans conséquence sur le calcul, faire un CROSS JOIN entre les deux requêtes :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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SELECT t1.Sequence, t1.Charge, t1.Modification, t1.Replicat, t1.URL,
	t1.Intensite_A,
	t1.Intensite_A / t2.som_A AS Intensite_A_norm,
	t1.Intensite_B,
	t1.Intensite_B / t2.som_B AS Intensite_B_norm
FROM
(
	SELECT Sequence,
			Charge,
			Modification,
			Replicat,
		SUM(
			CASE
				WHEN Analyse = 'A' THEN Intensite
				ELSE 0
			END
		) AS Intensite_A,
		SUM(
			CASE
				WHEN Analyse = 'B' THEN Intensite
				ELSE 0
			END
		) AS Intensite_B,
		URL
	FROM Peptide
	GROUP BY Sequence, Charge, Modification, Replicat, URL
) t1
CROSS JOIN
(
	SELECT
			SUM(
				CASE
					WHEN Analyse = 'A'
					THEN Aire
					ELSE 0
				END ) AS som_A ,
				SUM(
				CASE
					WHEN Analyse = 'B'
					THEN Aire
					ELSE 0
				END ) AS som_B
		FROM Peptide
	GROUP BY Replicat
) t2

**hajarita** · 14/12/2012, 15h55

Envoyé par CinePhil

C'étaient mes requêtes ça non ?

Dans la première, je constate quand même qu'il manque URL dans le GROUP BY.

Comme, si je ne me trompe, la seconde requête ne donne qu'une seule ligne de résultat, tu dois pouvoir, sans conséquence sur le calcul, faire un CROSS JOIN entre les deux requêtes :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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SELECT t1.Sequence, t1.Charge, t1.Modification, t1.Replicat, t1.URL,
	t1.Intensite_A,
	t1.Intensite_A / t2.som_A AS Intensite_A_norm,
	t1.Intensite_B,
	t1.Intensite_B / t2.som_B AS Intensite_B_norm
FROM
(
	SELECT Sequence,
			Charge,
			Modification,
			Replicat,
		SUM(
			CASE
				WHEN Analyse = 'A' THEN Intensite
				ELSE 0
			END
		) AS Intensite_A,
		SUM(
			CASE
				WHEN Analyse = 'B' THEN Intensite
				ELSE 0
			END
		) AS Intensite_B,
		URL
	FROM Peptide
	GROUP BY Sequence, Charge, Modification, Replicat, URL
) t1
CROSS JOIN
(
	SELECT
			SUM(
				CASE
					WHEN Analyse = 'A'
					THEN Aire
					ELSE 0
				END ) AS som_A ,
				SUM(
				CASE
					WHEN Analyse = 'B'
					THEN Aire
					ELSE 0
				END ) AS som_B
		FROM Peptide
	GROUP BY Replicat
) t2

Oui tout à fait, c'est les tiennes

En fait non, la seconde requete donne trois lignes de resultat, car c'est selon le nombre de replicat, et dans ce cas j'ai trois replicats, donc elle me donne la somme dans chaque replicat.
Et donc chaque sequence je dois la divisé par la somme de replicat où elle appartient

**CinePhil** · 14/12/2012, 16h42

Effectivement, je n'avais pas fais attention au GROUP BY replicat

En ce cas, peut-être qu'une jointure interne sur le réplicat fera l'affaire ?

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SELECT t1.Sequence, t1.Charge, t1.Modification, t1.Replicat, t1.URL,
	t1.Intensite_A,
	t1.Intensite_A / t2.som_A AS Intensite_A_norm,
	t1.Intensite_B,
	t1.Intensite_B / t2.som_B AS Intensite_B_norm
FROM
(
	SELECT Sequence,
			Charge,
			Modification,
			Replicat,
		SUM(
			CASE
				WHEN Analyse = 'A' THEN Intensite
				ELSE 0
			END
		) AS Intensite_A,
		SUM(
			CASE
				WHEN Analyse = 'B' THEN Intensite
				ELSE 0
			END
		) AS Intensite_B,
		URL
	FROM Peptide
	GROUP BY Sequence, Charge, Modification, Replicat, URL
) t1
INNER JOIN
(
	SELECT	Replicat,
			SUM(
				CASE
					WHEN Analyse = 'A'
					THEN Aire
					ELSE 0
				END ) AS som_A ,
				SUM(
				CASE
					WHEN Analyse = 'B'
					THEN Aire
					ELSE 0
				END ) AS som_B
		FROM Peptide
	GROUP BY Replicat
) t2 ON t2.Replicat = t1.Replicat

**hajarita** · 14/12/2012, 17h24

Envoyé par CinePhil

Effectivement, je n'avais pas fais attention au GROUP BY replicat

En ce cas, peut-être qu'une jointure interne sur le réplicat fera l'affaire ?

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SELECT t1.Sequence, t1.Charge, t1.Modification, t1.Replicat, t1.URL,
	t1.Intensite_A,
	t1.Intensite_A / t2.som_A AS Intensite_A_norm,
	t1.Intensite_B,
	t1.Intensite_B / t2.som_B AS Intensite_B_norm
FROM
(
	SELECT Sequence,
			Charge,
			Modification,
			Replicat,
		SUM(
			CASE
				WHEN Analyse = 'A' THEN Intensite
				ELSE 0
			END
		) AS Intensite_A,
		SUM(
			CASE
				WHEN Analyse = 'B' THEN Intensite
				ELSE 0
			END
		) AS Intensite_B,
		URL
	FROM Peptide
	GROUP BY Sequence, Charge, Modification, Replicat, URL
) t1
INNER JOIN
(
	SELECT	Replicat,
			SUM(
				CASE
					WHEN Analyse = 'A'
					THEN Aire
					ELSE 0
				END ) AS som_A ,
				SUM(
				CASE
					WHEN Analyse = 'B'
					THEN Aire
					ELSE 0
				END ) AS som_B
		FROM Peptide
	GROUP BY Replicat
) t2 ON t2.Replicat = t1.Replicat

OK!
Merci pour ton aide

Deux requetes en une seule

Requêtes MySQL

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