Discussion :

[Krauserr]

Bonjour à tous, nous avons développé un programme matlab (version 2012) qui automatise le traitement de l'image mais nous aimerions l'intégrer à imageJ. N'y connaissant rien en java j'aimerais savoir si vous pouviez nous éclairer sur la procédure à suivre pour pouvoir l'utiliser avec imageJ.

Merci d'avance.

A. T.

[Jerome Briot]

As-tu déjà jeté un œil à ceci ?

=> MIJ - A Java package for bi-directional communication and data exchange from Matlab to ImageJ/Fiji

[Krauserr]

J'ai essayé cette possibilité mais sa ne marche pas, peut être que j'ai mal effectué les étapes c'est pourquoi je voulais savoir si il y aait un autre moyen.

Je vous joins un screenshot de l'erreur je ne sais pas si c'est parce que j'utilise la version 2012 de matlab et que dans le tutoriel ils utilisent la version 2009.


http://imageshack.us/photo/my-images...riablemij.png/

[Jerome Briot]

Je refais une capture plus économique de ton message d'erreur.

Pourquoi mets-tu le fichier mij.jar dans le dossier java du MCR ?

Tu dois le mettre dans le dossier renvoyé par la commande suivante :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

fullfile(matlabroot,'java')

[Jerome Briot]

Je viens de faire l'installation sur mon ordi.

Il faut plutôt copier le fichier mij.jar dans le dossier d'installation de ImageJ et ajouter les chemins vers les mij.jar et ij.jar sous MATLAB comme préconisé ici

Voici ce que cela donne sur ma machine :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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>> javaaddpath 'C:\Program Files (x86)\ImageJ\mij.jar'
>> javaaddpath 'C:\Program Files (x86)\ImageJ\ij.jar'
>> MIJ.start('C:\Program Files (x86)\ImageJ)')
--------------------------------------------------------------
MIJ 1.3.8: Matlab to ImageJ Interface
--------------------------------------------------------------
More Info: http://bigwww.epfl.ch/sage/soft/mij/
Help: MIJ.help
JVM> 1.3.8
JVM> Version: 1.6.0_04
JVM> Total amount of memory: 82624 Kb
JVM> Amount of free memory: 37915 Kb
ImageJ> Version:1.46r
ImageJ> Memory:52MB of 179MB (28%)
ImageJ> Directory plugins: Not specified
ImageJ> Directory macros: Not specified
ImageJ> Directory luts: Not specified
ImageJ> Directory image: Not specified
ImageJ> Directory imagej: Not specified
ImageJ> Directory startup: C:\Users\Jerome\Documents\MATLAB\
ImageJ> Directory home: C:\Users\Jerome\
--------------------------------------------------------------
Status> ImageJ is running.
--------------------------------------------------------------
>> 
>> >> methods(MIJ)
 
Methods for class MIJ:
 
MIJ              getClass         getImage         hashCode         run              start            
createColor      getColumn        getListColumns   help             setColumn        toString         
createImage      getCurrentImage  getListImages    main             setRoi           version          
equals           getCurrentTitle  getResultsTable  notify           setTreshold      wait             
exit             getHistogram     getRoi           notifyAll        setupExt