grep extraire plusieurs termes en comparant plusieurs fichiers entre eux

**sab113** · 01/03/2012, 22h57

Bonsoir à tous,

Je suis tombée sur une petite ambiguitée, je veux comparer plusieurs fichiers entre eux de telle sorte que :
J'ai un dossier A de fichiers A que je veux comparer avec le dossier B qui contient les fichiers B par exemple. Telque: le fichierA0 je le comprare avec le fichierB0
le fichierA1 je le compare avec le fichierB1
ainsi de suite jusqu'au fichierAn que je compare avec le fichierBn.

Voilà mon but étant d'éxtraire les termes qui sont dans les fichiersA et qui appartient seulement aux fichiersB car au final je veux travailler avec une liste plus restreinte donc juste me limiter avec les termes qui apparaissent dans les fichiersB.

Voilà, avec grep : j'ai essayé

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

grep -iwof /home/sabrina/fichiersA/* /home/sabrina/fichiersB/*

pour dire que je vais comparer chaque fichier A au fichierB en quelque sorte

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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grep -iwof /home/sabrina/fichiersA0.txt /home/sabrina/fichiersB0.txt
grep -iwof /home/sabrina/fichiersA1.txt /home/sabrina/fichiersB1.txt
grep -iwof /home/sabrina/fichiersA2.txt /home/sabrina/fichiersB2.txt
................................................................................................
grep -iwof /home/sabrina/fichiersAn.txt /home/sabrina/fichiersBn.txt

Mais j'ai des résultats bizzards. Je voudrais juste comprendre si c'est correcte ce que j'ai fait ou bien j'ai du mal intrépréter ma problématique sous commande.
Merci pour vos réponse. Très bonne soirée.

**jack-ft** · 02/03/2012, 10h49

Envoyé par sab113

Voilà, avec grep : j'ai essayé

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

grep -iwof /home/sabrina/fichiersA/* /home/sabrina/fichiersB/*

pour dire que je vais comparer chaque fichier A au fichierB en quelque sorte

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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6
 
grep -iwof /home/sabrina/fichiersA0.txt /home/sabrina/fichiersB0.txt
grep -iwof /home/sabrina/fichiersA1.txt /home/sabrina/fichiersB1.txt
grep -iwof /home/sabrina/fichiersA2.txt /home/sabrina/fichiersB2.txt
................................................................................................
grep -iwof /home/sabrina/fichiersAn.txt /home/sabrina/fichiersBn.txt

Mais j'ai des résultats bizzards. Je voudrais juste comprendre si c'est correcte ce que j'ai fait ou bien j'ai du mal intrépréter ma problématique sous commande.
Merci pour vos réponse. Très bonne soirée.

Je ne pense pas que tu puisses faire boucler grep comme ça!
En fait, dans ta 2ème partie, tu dis assez précisément ce que tu veux faire faire à ton programme. On peut même le prendre comme des spécifications... Et il ne reste plus qu'à le coder!

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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#!/bin/ksh
# Comparer chaque fichier A au fichier B
for fichierA in /home/sabrina/fichiersA*.txt ; do
    fichierB=$(echo "${fichierA}" | sed -e 's:fichiersA:fichiersB:')
    grep -iwof "${fichierA}" "${fichierB}"
done

HTH
)jack(
PS: ton bizzard est très bizarre

**Winnt** · 02/03/2012, 14h22

Salut,

Sachant que tu souhaites comparer 2 fichiers A et B pourquoi ne pas utiliser diff dont c'est justement la spécialité (voir le man pour les options).
Voir aussi comm qui peut afficher les résultat soit commun aux 2 fichiers soit exclusifs à l'un des 2 fichiers.

**sab113** · 02/03/2012, 23h07

Bonsoir,

Pouvez vous m'expliquer ce que fait la ligne suivante:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

fichierB=$(echo "${fichierA}" | sed -e 's:fichiersA:fichiersB:')

les fichiers B se trouvent dans un autre dossier qui n'est pas spécifié dans cette ligne et j'aimerais comprendre cette ligne sed -e 's:fichiersA:fichiersB:'

Pour les commandes comm et diff la comande comm compare deux fichiers s'ils sont triés dans mon cas les fichiersA est un ensemble de motifs ou mots chaque ligne et un mot .
par contre les fichiers B est un ensemble de phrases.
je veux récupérer les mots qui existent seulement ou bien qui se trouvent seulement dans les phrases des fichiers B.

Exemple :
fichier A0 contient :
Alkylation
Animals
Chromatography
Ethers
Fish Oils
Glycerol
Greenland
Hydroxylation
Mass Spectrometry
Sharks
le fichier B0 contient:
1-O-(2-hydroxyalkyl)glycerols isolated from Greenland shark liver oil.

donc je veux avoir les motifs qe A0 qui sont seulement dans la phrase du fichier B0.

Le problème c'est qu'avec une collection de fichiers A et une autre collection de fichiers B
pour moi ça devient plus difficile de formuler que :
le fichier A0 je le compare seulement au fichier B0.
le fichier A1 je le compare seulement au fichier B1.
.......
le fichier An je le compare seulement au fichier Bn.

Pourriez vous m'aider svp.
PS: mon bizzare est devenu normal. ^^

**Winnt** · 03/03/2012, 10h25

Salut,

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

sed -e 's:fichiersA:fichiersB:'

Dans ce code jack-ft a simplement changer le délimiteur de commande de sed qui traditionnellement est /.
C'est donc équivalent à

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

sed -e 's/fichiersA/fichiersB/' ou sed -e 's#fichiersA#fichiersB#'

Ce code demande à sed de substituer le motif fichiersA par le motif fichiersB.

**zipe31** · 03/03/2012, 10h34

Salut,

Le problème c'est qu'avec une collection de fichiers A et une autre collection de fichiers B pour moi ça devient plus difficile de formuler que...

Ben justement tout ce qu'il nous manque pour t'aider au mieux c'est le nom exact des fichiers contenus dans A et dans B, ou du moins savoir comment associer le fichier A/A0 au fichier B/B0

**sab113** · 03/03/2012, 11h54

Salut,
oui bien sur je vais reformuler ma question plus correctement:
j'ai un dossier de fichiers A tel que chaque fichier ici nommé meshA

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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root@ubuntu:/home/sabrina/essai/meshTitreA# ls -v
meshA00   meshA156  meshA312  meshA468  meshA624  meshA780  meshA936
meshA01   meshA157  meshA313  meshA469  meshA625  meshA781  meshA937
meshA02   meshA158  meshA314  meshA470  meshA626  meshA782  meshA938
meshA03   meshA159  meshA315  meshA471  meshA627  meshA783  meshA939
meshA04   meshA160  meshA316  meshA472  meshA628  meshA784  meshA940
meshA05   meshA161  meshA317  meshA473  meshA629  meshA785  meshA941
meshA06   meshA162  meshA318  meshA474  meshA630  meshA786  meshA942
meshA07   meshA163  meshA319  meshA475  meshA631  meshA787  meshA943
meshA08   meshA164  meshA320  meshA476  meshA632  meshA788  meshA944
meshA09   meshA165  meshA321  meshA477  meshA633  meshA789  meshA945
meshA10   meshA166  meshA322  meshA478  meshA634  meshA790  meshA946
meshA11   meshA167  meshA323  meshA479  meshA635  meshA791  meshA947
meshA12   meshA168  meshA324  meshA480  meshA636  meshA792  meshA948
meshA13   meshA169  meshA325  meshA481  meshA637  meshA793  meshA949
meshA14   meshA170  meshA326  meshA482  meshA638  meshA794  meshA950
meshA15   meshA171  meshA327  meshA483  meshA639  meshA795  meshA951
meshA16   meshA172  meshA328  meshA484  meshA640  meshA796  meshA952
meshA17   meshA173  meshA329  meshA485  meshA641  meshA797  meshA953
meshA18   meshA174  meshA330  meshA486  meshA642  meshA798  meshA954
meshA19   meshA175  meshA331  meshA487  meshA643  meshA799  meshA955
meshA20   meshA176  meshA332  meshA488  meshA644  meshA800  meshA956
meshA21   meshA177  meshA333  meshA489  meshA645  meshA801  meshA957
meshA22   meshA178  meshA334  meshA490  meshA646  meshA802  meshA958
meshA23   meshA179  meshA335  meshA491  meshA647  meshA803  meshA959
meshA24   meshA180  meshA336  meshA492  meshA648  meshA804  meshA960
meshA25   meshA181  meshA337  meshA493  meshA649  meshA805  meshA961
meshA26   meshA182  meshA338  meshA494  meshA650  meshA806  meshA962
meshA27   meshA183  meshA339  meshA495  meshA651  meshA807  meshA963
meshA28   meshA184  meshA340  meshA496  meshA652  meshA808  meshA964
meshA29   meshA185  meshA341  meshA497  meshA653  meshA809  meshA965
meshA30   meshA186  meshA342  meshA498  meshA654  meshA810  meshA966
meshA31   meshA187  meshA343  meshA499  meshA655  meshA811  meshA967
meshA32   meshA188  meshA344  meshA500  meshA656  meshA812  meshA968
meshA33   meshA189  meshA345  meshA501  meshA657  meshA813  meshA969
meshA34   meshA190  meshA346  meshA502  meshA658  meshA814  meshA970
meshA35   meshA191  meshA347  meshA503  meshA659  meshA815  meshA971
meshA36   meshA192  meshA348  meshA504  meshA660  meshA816  meshA972
meshA37   meshA193  meshA349  meshA505  meshA661  meshA817  meshA973
meshA38   meshA194  meshA350  meshA506  meshA662  meshA818  meshA974
meshA39   meshA195  meshA351  meshA507  meshA663  meshA819  meshA975
meshA40   meshA196  meshA352  meshA508  meshA664  meshA820  meshA976
meshA41   meshA197  meshA353  meshA509  meshA665  meshA821  meshA977
meshA42   meshA198  meshA354  meshA510  meshA666  meshA822  meshA978
meshA43   meshA199  meshA355  meshA511  meshA667  meshA823  meshA979
meshA44   meshA200  meshA356  meshA512  meshA668  meshA824  meshA980
meshA45   meshA201  meshA357  meshA513  meshA669  meshA825  meshA981
meshA46   meshA202  meshA358  meshA514  meshA670  meshA826  meshA982
meshA47   meshA203  meshA359  meshA515  meshA671  meshA827  meshA983
meshA48   meshA204  meshA360  meshA516  meshA672  meshA828  meshA984
meshA49   meshA205  meshA361  meshA517  meshA673  meshA829  meshA985
meshA50   meshA206  meshA362  meshA518  meshA674  meshA830  meshA986
meshA51   meshA207  meshA363  meshA519  meshA675  meshA831  meshA987
meshA52   meshA208  meshA364  meshA520  meshA676  meshA832  meshA988
meshA53   meshA209  meshA365  meshA521  meshA677  meshA833  meshA989
meshA54   meshA210  meshA366  meshA522  meshA678  meshA834  meshA990
meshA55   meshA211  meshA367  meshA523  meshA679  meshA835  meshA991
meshA56   meshA212  meshA368  meshA524  meshA680  meshA836  meshA992
meshA57   meshA213  meshA369  meshA525  meshA681  meshA837  meshA993
meshA58   meshA214  meshA370  meshA526  meshA682  meshA838  meshA994
meshA59   meshA215  meshA371  meshA527  meshA683  meshA839  meshA995
meshA60   meshA216  meshA372  meshA528  meshA684  meshA840  meshA996
meshA61   meshA217  meshA373  meshA529  meshA685  meshA841  meshA997
meshA62   meshA218  meshA374  meshA530  meshA686  meshA842  meshA998
meshA63   meshA219  meshA375  meshA531  meshA687  meshA843  meshA999
meshA64   meshA220  meshA376  meshA532  meshA688  meshA844  meshA1000
meshA65   meshA221  meshA377  meshA533  meshA689  meshA845  meshA1001
meshA66   meshA222  meshA378  meshA534  meshA690  meshA846  meshA1002
meshA67   meshA223  meshA379  meshA535  meshA691  meshA847  meshA1003
meshA68   meshA224  meshA380  meshA536  meshA692  meshA848  meshA1004
meshA69   meshA225  meshA381  meshA537  meshA693  meshA849  meshA1005
meshA70   meshA226  meshA382  meshA538  meshA694  meshA850  meshA1006
meshA71   meshA227  meshA383  meshA539  meshA695  meshA851  meshA1007
meshA72   meshA228  meshA384  meshA540  meshA696  meshA852  meshA1008
meshA73   meshA229  meshA385  meshA541  meshA697  meshA853  meshA1009
meshA74   meshA230  meshA386  meshA542  meshA698  meshA854  meshA1010
meshA75   meshA231  meshA387  meshA543  meshA699  meshA855  meshA1011
meshA76   meshA232  meshA388  meshA544  meshA700  meshA856  meshA1012
meshA77   meshA233  meshA389  meshA545  meshA701  meshA857  meshA1013
meshA78   meshA234  meshA390  meshA546  meshA702  meshA858  meshA1014
meshA79   meshA235  meshA391  meshA547  meshA703  meshA859  meshA1015
meshA80   meshA236  meshA392  meshA548  meshA704  meshA860  meshA1016
meshA81   meshA237  meshA393  meshA549  meshA705  meshA861  meshA1017
meshA82   meshA238  meshA394  meshA550  meshA706  meshA862  meshA1018
meshA83   meshA239  meshA395  meshA551  meshA707  meshA863  meshA1019
meshA84   meshA240  meshA396  meshA552  meshA708  meshA864  meshA1020
meshA85   meshA241  meshA397  meshA553  meshA709  meshA865  meshA1021
meshA86   meshA242  meshA398  meshA554  meshA710  meshA866  meshA1022
meshA87   meshA243  meshA399  meshA555  meshA711  meshA867  meshA1023
meshA88   meshA244  meshA400  meshA556  meshA712  meshA868  meshA1024
meshA89   meshA245  meshA401  meshA557  meshA713  meshA869  meshA1025
meshA90   meshA246  meshA402  meshA558  meshA714  meshA870  meshA1026
meshA91   meshA247  meshA403  meshA559  meshA715  meshA871  meshA1027
meshA92   meshA248  meshA404  meshA560  meshA716  meshA872  meshA1028
meshA93   meshA249  meshA405  meshA561  meshA717  meshA873  meshA1029
meshA94   meshA250  meshA406  meshA562  meshA718  meshA874  meshA1030
meshA95   meshA251  meshA407  meshA563  meshA719  meshA875  meshA1031
meshA96   meshA252  meshA408  meshA564  meshA720  meshA876  meshA1032
meshA97   meshA253  meshA409  meshA565  meshA721  meshA877  meshA1033
meshA98   meshA254  meshA410  meshA566  meshA722  meshA878  meshA1034
meshA99   meshA255  meshA411  meshA567  meshA723  meshA879  meshA1035
meshA100  meshA256  meshA412  meshA568  meshA724  meshA880  meshA1036
meshA101  meshA257  meshA413  meshA569  meshA725  meshA881  meshA1037
meshA102  meshA258  meshA414  meshA570  meshA726  meshA882  meshA1038
meshA103  meshA259  meshA415  meshA571  meshA727  meshA883  meshA1039
meshA104  meshA260  meshA416  meshA572  meshA728  meshA884  meshA1040
meshA105  meshA261  meshA417  meshA573  meshA729  meshA885  meshA1041
meshA106  meshA262  meshA418  meshA574  meshA730  meshA886  meshA1042
meshA107  meshA263  meshA419  meshA575  meshA731  meshA887  meshA1043
meshA108  meshA264  meshA420  meshA576  meshA732  meshA888  meshA1044
meshA109  meshA265  meshA421  meshA577  meshA733  meshA889  meshA1045
meshA110  meshA266  meshA422  meshA578  meshA734  meshA890  meshA1046
meshA111  meshA267  meshA423  meshA579  meshA735  meshA891  meshA1047
meshA112  meshA268  meshA424  meshA580  meshA736  meshA892  meshA1048
meshA113  meshA269  meshA425  meshA581  meshA737  meshA893  meshA1049
meshA114  meshA270  meshA426  meshA582  meshA738  meshA894  meshA1050
meshA115  meshA271  meshA427  meshA583  meshA739  meshA895  meshA1051
meshA116  meshA272  meshA428  meshA584  meshA740  meshA896  meshA1052
meshA117  meshA273  meshA429  meshA585  meshA741  meshA897  meshA1053
meshA118  meshA274  meshA430  meshA586  meshA742  meshA898  meshA1054
meshA119  meshA275  meshA431  meshA587  meshA743  meshA899  meshA1055
meshA120  meshA276  meshA432  meshA588  meshA744  meshA900  meshA1056
meshA121  meshA277  meshA433  meshA589  meshA745  meshA901  meshA1057
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titreA131  titreA287  titreA443  titreA599  titreA755  titreA911  titreA1067
titreA132  titreA288  titreA444  titreA600  titreA756  titreA912  titreA1068
titreA133  titreA289  titreA445  titreA601  titreA757  titreA913  titreA1069
titreA134  titreA290  titreA446  titreA602  titreA758  titreA914  titreA1070
titreA135  titreA291  titreA447  titreA603  titreA759  titreA915  titreA1071
titreA136  titreA292  titreA448  titreA604  titreA760  titreA916  titreA1072
titreA137  titreA293  titreA449  titreA605  titreA761  titreA917  titreA1073
titreA138  titreA294  titreA450  titreA606  titreA762  titreA918  titreA1074
titreA139  titreA295  titreA451  titreA607  titreA763  titreA919  titreA1075
titreA140  titreA296  titreA452  titreA608  titreA764  titreA920  titreA1076
titreA141  titreA297  titreA453  titreA609  titreA765  titreA921  titreA1077
titreA142  titreA298  titreA454  titreA610  titreA766  titreA922  titreA1078
titreA143  titreA299  titreA455  titreA611  titreA767  titreA923  titreA1079
titreA144  titreA300  titreA456  titreA612  titreA768  titreA924  titreA1080
titreA145  titreA301  titreA457  titreA613  titreA769  titreA925  titreA1081
titreA146  titreA302  titreA458  titreA614  titreA770  titreA926  titreA1082
titreA147  titreA303  titreA459  titreA615  titreA771  titreA927  titreA1083
titreA148  titreA304  titreA460  titreA616  titreA772  titreA928  titreA1084
titreA149  titreA305  titreA461  titreA617  titreA773  titreA929  titreA1085
titreA150  titreA306  titreA462  titreA618  titreA774  titreA930  titreA1086
titreA151  titreA307  titreA463  titreA619  titreA775  titreA931  titreA1087
titreA152  titreA308  titreA464  titreA620  titreA776  titreA932  titreA1088
titreA153  titreA309  titreA465  titreA621  titreA777  titreA933  titreA1089
titreA154  titreA310  titreA466  titreA622  titreA778  titreA934  titreA1090
titreA155  titreA311  titreA467  titreA623  titreA779  titreA935  titreA109

Voilà, mon but en réalité c'est travailler avec une liste plus restreinte de mots . Qui veut dire je voudrais travailler seulement avec la liste des mots qui existent dans les titres.
Pour cela grep va m'aider pour dégager juste l'ensemble des mots qui se trouvent dans les fichiers B.

Je veux faire:
grep -iof meshA0.txt titreA0.txt //comparer seulement les termes qui se trouvent dans meshA0.txt avec le contenu du fichierA0.txt
grep -iof meshA1.txt titreA1.txt
........................
grep iof meshA1091.txt titreA1091.txt

Merci pour toutes vos propositions.

**zipe31** · 03/03/2012, 12h29

C'est le nom exact de tes fichiers ?

A savoir des lettres alphabétiques en minuscules suivies de la lettre A (en majuscule) et d'une suite de chiffres (la dernière partie étant commune aux fichiers présents dans les 2 répertoires) ?

Y-a-t'il oui ou non une extension à la fin de tes fichiers ?

Désolé d'être aussi pointilleux, mais si tu veux une solution à ton problème il nous faut un maximum de détails, l’approximation ayant peu de chance d'aboutir

**sab113** · 03/03/2012, 14h01

Oui ce sont les noms exacts de mes fichiers :
Je vais préciser mieux : j'ai deux dossiers dossier 1 nommé meshTitreA (/home/sabrina/essai/meshTitreA): contient les fichiers: meshA00, meshA01, meshA02,.....,meshA1091.

chaque fichier mesh.txt de ce dossier contient une liste de mots:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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exemple: meshA00.txt contient la liste des mots:
 Alkylation
Animals
Chromatography
Ethers
Fish Oils
Glycerol
Greenland
Hydroxylation
Mass Spectrometry
Sharks

Le deuxième dossier nommé colleCtionTitreA (/home/sabrina/essai/colleCtionTitreA) : contient les fichiers: titreA00,titreA01,titreA01,....,titreA1091.
chaque fichier titre.txt contient des phrases.

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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3
 
exemple: titreA00.txt contient une seule phrase:
1-O-(2-hydroxyalkyl)glycerols isolated from Greenland shark liver oil.

je voulais faire en gros :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

grep -iwof /home/sabrina/essai/meshTitreA/*  /home/sabrina/essai/colleCtionTitreA/*

Pour pouvoir récupérer en général:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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grep -iof meshA00.txt titreA00.txt //comparer seulement les termes qui se trouvent dans meshA00.txt avec le contenu du titreA00.txt
grep -iof meshA01.txt titreA01.txt
........................
grep iof meshA1091.txt titreA1091.txt

mais les résultats que j'obtiens sont faussés.

J'ai essayé de le faire manuellement mais ça me prend énormément de temps et ça m'engendre des erreurs également.

Oui je travaille sur des fichiers simples des fichiers textes .
Oui y a aucun souci, je veux juste comprendre comment faire si vous voulez bien m'aider svp.
Je vous remercie ^^.

**zipe31** · 03/03/2012, 16h02

Re-

Essaie ça :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

while read line ; do grep -iof "/home/sabrina/essai/meshTitreA/${line}" /home/sabrina/essai/colleCtionTitreA/*${line//[[:lower:]]/}txt ; done < <(ls -1v /home/sabrina/essai/meshTitreA/)

**sab113** · 03/03/2012, 20h19

Merci zip31 de m'avoir répondu :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

while read line ; do grep -iof "/home/sabrina/essai/meshTitreA/${line}" /home/sabrina/essai/colleCtionTitreA/*${line//[[:lower:]]/}txt ; done < <(ls -1v /home/sabrina/essai/meshTitreA/)

ma affiché:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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root@ubuntu:/home/sabrina/essai# while read line ; do grep -iwof "/home/sabrina/essai/meshTitreA/${line}" /home/sabrina/essai/colleCtionTitreA/*${line//[[:lower:]]/} txt ; done < <(ls -1v /home/sabrina/essai/meshTitreA/)
grep: /home/sabrina/essai/colleCtionTitreA/*MHA.txt: No such file or directory
grep: /home/sabrina/essai/colleCtionTitreA/*MHA3.txt: No such file or directory
grep: /home/sabrina/essai/colleCtionTitreA/*A00txt: No such file or directory
grep: /home/sabrina/essai/colleCtionTitreA/*A01txt: No such file or directory
grep: /home/sabrina/essai/colleCtionTitreA/*A02txt: No such file or directory
grep: /home/sabrina/essai/colleCtionTitreA/*A03txt: No such file or directory
grep: /home/sabrina/essai/colleCtionTitreA/*A04txt: No such file or directory
grep: /home/sabrina/essai/colleCtionTitreA/*A05txt: No such file or directory
grep: /home/sabrina/essai/colleCtionTitreA/*A06txt: No such file or directory
grep: /home/sabrina/essai/colleCtionTitreA/*A07txt: No such file or directory
grep: /home/sabrina/essai/colleCtionTitreA/*A08txt: No such file or directory
grep: /home/sabrina/essai/colleCtionTitreA/*A09txt: No such file or directory
grep: /home/sabrina/essai/colleCtionTitreA/*A10txt: No such file or directory
.............................................................................................................

Après j'ai retapé:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

while read line ; do grep -iwof "/home/sabrina/essai/meshTitreA/${line}" /home/sabrina/essai/colleCtionTitreA/titre${line//[[:lower:]]/} ; done < <(ls -1v /home/sabrina/essai/meshTitreA/)

Là après j'obtiens des bons résultats:

Code :

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Greenland
lung
kidney
rats
oils

Merci Zip31 pour ton aide mais voilà juste une dernière petite chose :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

*${line//[[:lower:]]/}

veut dire ???

Merci encore

**zipe31** · 04/03/2012, 10h00

Envoyé par sab113

Merci Zip31 pour ton aide mais voilà juste une dernière petite chose :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

*${line//[[:lower:]]/}

veut dire ???

Merci encore

De rien

Voir dans le man bash le remplacement des paramètres, en gros on supprime de la variable toutes les les lettres minuscules :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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$ A="meshA00.txt"
 
$ echo ${A}
meshA00.txt
 
$ echo ${A//[[:lower:]]/}
A00.
 
$

**sab113** · 05/03/2012, 09h10

Merci Zip31 pour tes explications

**jack-ft** · 05/03/2012, 10h13

Envoyé par sab113

Oui ce sont les noms exacts de mes fichiers :
Je vais préciser mieux : j'ai deux dossiers dossier 1 nommé meshTitreA (/home/sabrina/essai/meshTitreA): contient les fichiers: meshA00, meshA01, meshA02,.....,meshA1091.
...
je voulais faire en gros :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

grep -iwof /home/sabrina/essai/meshTitreA/*  /home/sabrina/essai/colleCtionTitreA/*

Mille mercis à zipe31 qui a osé demander des précisions précises!
Le degré d'imprécision des réponses que nous t'avions apportées était directement lié au manque d'information!
La solution que je t'avais proposée était probablement moins efficace, mais (à mon sens (ou, au moins, pour moi)) plus simple à comprendre:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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#!/bin/ksh
# Comparer chaque fichier meshA au fichier titreA correspondant
for fichierA in /home/sabrina/essai/meshTitreA/meshA* ; do
    fichierB=$(echo "${fichierA}" | sed -e 's:meshTitreA/meshA:colleCtionTitreA/titreA:')
    grep -iwof "${fichierA}" "${fichierB}"
done

L'intérêt d'utiliser ':' (ou tout autre caractères) est de ne pas entrer en conflit avec les '/' des répertoires (et puis, ça fait plus vertical (à mon goût) que le traditionnel '/').
)jack(

**sab113** · 07/03/2012, 19h03

Mille mercis à zipe31 qui a osé demander des précisions précises!
Le degré d'imprécision des réponses que nous t'avions apportées était directement lié au manque d'information!
La solution que je t'avais proposée était probablement moins efficace, mais (à mon sens (ou, au moins, pour moi)) plus simple à comprendre:

Oui mille mercis à Zipe31 de m'avoir aidé à comprendre ce qui me semblait ambigu.
Maintenant s'il avait un manque d'informations j'aurais comme j'ai fait reformuler mes questions en précisant au mieux ma problématique ici c'était les noms des fichiers exacts qu'il fallait citer, l'essentiel pour moi c'est de comprendre et d'apprendre de mes erreurs.
Il faut également à mon sens quand on répond aux questions, expliquer un peu mieux sa réponse.

Je vous remercies tous pour toutes vos réponses

grep extraire plusieurs termes en comparant plusieurs fichiers entre eux

Shell et commandes GNU

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