Discussion :

[nanath02]

Bonjour à tous et à toutes.

Je travaille actuellement sur des fichiers csv contenant une première ligne d'intitulés de colonnes et une première colonne d'intitulés de lignes.
Le reste est composé de double.

Lorsque je fais un head(mycsv), voici par exemple une partie de ce que j'obtiens :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
                 X          X1        X1.5          X2
1        untreated 0,563025755 0,554571607 0,564483813

Or, ayant besoin de transformer le tout en matrice pour des traitements ultérieurs, j'effectue ceci :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

mat <- data.matrix(mycsv)

Jusque là, aucun problème. Mais lorsque je fais un head(mat) afin de vérifier mes données, voici ce que j'obtiens :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
 X          X1        X1.5          X2
1        untreated 29 25 22

En fait, je n'ai plus aucun double, que des entiers. D'où cela vient-il ?
Comment puis-je faire pour avoir une matrice contenant les bonnes valeurs, c'est-à-dire, les valeurs de mon fichier csv initial ?

Merci d'avance pour vos réponses !


Nath

[A. D.]

Bonjour,

A première vue comme ça et sans extrait de votre jeu de données, je pense que le problème vient du fait que dans votre jeu de données initial, le séparateur de décimal est la virgule. Or par défaut dans R, le séparateur de décimal est le point. Il vous faudra donc spécifier votre cas particulier comme suit lors du chargement des données dans R :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

mycsv<-read.csv("mesdonnees.csv",header=TRUE,...,dec=",")

Normalement je pense que cela devrait mieux se passer ainsi.

Bonne continuation


Cordialement,

A.D.

[nanath02]

Bonjour, merci pour ta réponse !

Malheureusement, j'ai déjà spécifié le type de séparateur dans ma fonction (qui est ici un ";" en l’occurrence), donc le problème ne vient pas de là...

Je ne comprends pas pourquoi j'ai ce type de résultats...

[Beniou]

Malheureusement, j'ai déjà spécifié le type de séparateur dans ma fonction (qui est ici un ";" en l’occurrence), donc le problème ne vient pas de là...

Je crois qu'il y a confusion entre séparateur de champ qui dans ton csv sera effectivement le ";" (voire la ",") et le séparateur de décimale pour les nombres : 1,5 en "français" sera 1.5 en R d'où le paramètre donné par A.D. pour lire ton csv en spécifiant le séparateur de décimale.

Grosso modo si ton csv ressemble à cela :

col1;col2;col3
1,456;1,687;1,0254

alors la fonction donnée par A.D. devrait t'importer correctement ton tableau

Me trompe-je ?

[nanath02]

Beniou, non tu ne t'es pas trompé ! Et quelle confusion, effectivement !

Ça marche super maintenant, un grand, très très grand merci à vous deux !