salut à tous,
j'utilise un script shell qui lance un programme en qsub.
Pour forcer à attendre la fin de l'exécution du programme en qsub, je compte le nombre de lignes résultant de la commande qstat avec un grep -c dans une boucle et je fais dormir (sleep) mon script tant que le programme lancé en qstat n'est pas terminé, c'est à dire que le nombre de lignes n'est pas 0.
voici le code :
mon problème est le suivant, la variable $FOUND a pour valeur : 4,5, ou 6 alors qu'elle devrait avoir pour valeur 1 uniquement, puisqu'il n'y a qu'un job soumis avec l'id indiqué en qsub
Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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18 #execution du script en qsub JOBID=`qsub -q $QUEUE -o /tmp/$NAME.out -e /tmp/$NAME.err $SCRIPTS/$NAME` echo "jobid : $JOBID " #pour forcer a attendre la fin de l execution de qstat FOUND=$(qstat | grep -c "$JOB_ID") #count row with right job id sleep 5 #temporisation echo "found here : $FOUND" while [ $FOUND -ne 0 ] # when no more matching row, job is over do sleep 3 #go to bed for 3 seconds echo -n '.' #FOUND=`qstat -r | grep "$JOB_ID" | wc -l` FOUND=$(qstat | grep -c "$JOB_ID") done echo "found value after : $FOUND" ###### Reprise du script ######. D'ailleurs, si je fais ceci directement dans le shell :
J'obtiens 1 puis 0 quand le job a fini de tourner, ce qui est normal
Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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2 while ( true ) do qstat | grep -c "monjobid.monserveur" ; done;.
Comment expliquer cette différence ?
merci d'avance,
ben
voici la trace :
Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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99 #pour forcer a attendre la fin de l execution de qstat avant de faire le chmod sinon erreur FOUND=`qstat | grep "$JOB_ID" | wc -l` #count row with right job id qstat | grep "$JOB_ID" | wc -l ++ qstat ++ wc -l ++ grep '' + FOUND=4 sleep 5 #temporisation + sleep 5 found here : 4 echo "found here : $FOUND" + echo 'found here : 4' while [ $FOUND -ne 0 ] # when no more matching row, job is over do sleep 3 #go to bed for 3 seconds echo -n '.' #FOUND=`qstat -r | grep "$JOB_ID" | wc -l` FOUND=$(qstat | grep -c "$JOB_ID") done + '[' 4 -ne 0 ']' + sleep 3 .+ echo -n . qstat | grep -c "$JOB_ID" ++ qstat ++ grep -c '' + FOUND=4 + '[' 4 -ne 0 ']' + sleep 3 .+ echo -n . qstat | grep -c "$JOB_ID" ++ qstat ++ grep -c '' + FOUND=4 + '[' 4 -ne 0 ']' + sleep 3 .+ echo -n . qstat | grep -c "$JOB_ID" ++ qstat ++ grep -c '' + FOUND=4 + '[' 4 -ne 0 ']' + sleep 3 .+ echo -n . qstat | grep -c "$JOB_ID" ++ qstat ++ grep -c '' + FOUND=4 + '[' 4 -ne 0 ']' + sleep 3 .+ echo -n . qstat | grep -c "$JOB_ID" ++ qstat ++ grep -c '' + FOUND=4 + '[' 4 -ne 0 ']' + sleep 3 .+ echo -n . qstat | grep -c "$JOB_ID" ++ qstat ++ grep -c '' + FOUND=4 + '[' 4 -ne 0 ']' + sleep 3 .+ echo -n . qstat | grep -c "$JOB_ID" ++ qstat ++ grep -c '' + FOUND=4 + '[' 4 -ne 0 ']' + sleep 3 .+ echo -n . qstat | grep -c "$JOB_ID" ++ qstat ++ grep -c '' + FOUND=4 + '[' 4 -ne 0 ']' + sleep 3 .+ echo -n . qstat | grep -c "$JOB_ID" ++ qstat ++ grep -c '' + FOUND=4 + '[' 4 -ne 0 ']' + sleep 3 .+ echo -n . qstat | grep -c "$JOB_ID" ++ qstat ++ grep -c '' + FOUND=4 + '[' 4 -ne 0 ']' + sleep 3 .+ echo -n . qstat | grep -c "$JOB_ID" ++ qstat ++ grep -c '' + FOUND=4 + '[' 4 -ne 0 ']' ETC
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