Bonjour,
J'ai grandement besoin de votre aide:
Je suis nouvelle sous mac mais familiere (enfin c'est ce que je pretends) du gbrowse.
Voici mon resultat de l'install gbrowse :
Comme vous le voyez j'ai un peu personnalise mon install ( du a l'architecture de mon projet) mais le repertoire /conf pointe vers /usr/local/apache/conf et pareil pour cgi-bin
Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
1
2
3
4
5
6
7
8
9
10
11
12
13
14
15
16
17
18
19
20
21
22
23
24
25
26
27
28 *** Installing Generic-Genome-Browser *** Downloading http://easynews.dl.sourceforge.net/sourceforge/gmod/Generic-Genome-Browser-1.70.tar.gz... Unpacking gbrowse.tgz... Apache root directory (enter '' for none)? [/usr/local/apache] /Users/drula/scripts Apache conf directory? [/Users/drula/scripts/conf] Apache htdocs directory? [/Library/Webserver/Documents] Apache cgibin directory? [/Users/drula/scripts/cgi-bin] GBrowse root for static files? [gbrowse] ---------------------------------------------- File Paths CONF /Users/drula/scripts/conf HTDOCS /Library/Webserver/Documents CGIBIN /Users/drula/scripts/cgi-bin GBROWSE_ROOT gbrowse INSTALL_BASE LIB BIN YES PREFIX PACKAGE_DIR DO_XS 1 NONROOT SELINUX (Run perl Makefile.PL -h for help on changing) ----------------------------------------------
Tout semble s'etre bien installe puisque je peux acceder a la page d'accueil via http://localhost/gbrowse.
Mon probleme est l'affichage de l'exemple yeast.
Voici ce que j'ai dans le error.log d'apache:
Avez vous une idee ? Le probleme vient de mon gbrowse_root: j'ai laisse par defaut gbrowse alors que me signifie ce
Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
1
2
3
4 [Mon Oct 18 16:55:01 2010] [notice] Apache/2.2.14 (Unix) mod_ssl/2.2.14 OpenSSL/0.9.7l DAV/2 mod_perl/2.0.2 Perl/v5.8.8 configured -- resuming normal operations [Mon Oct 18 16:55:05 2010] [error] [client ::1] mkdir /Users///gbrowse: Permission denied at /Library/Perl/5.8.8/darwin-thread-multi-2level/Bio/Graphics/Browser.pm line 1707 [Mon Oct 18 16:55:05 2010] [error] [client ::1] Premature end of script headers: gbrowse?
Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part mkdir /Users///gbrowse
J'ai pense a parametrer mon httpd.conf aussi !
Merci beaucoup d'avance pour votre aide
Partager