Case à cocher et répartition des tâches

**boo64** · 13/05/2009, 10h56

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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$requete= explode($_POST['requete'],delimiter);
 
						case "protein":
							foreach ($requete as $req){
							$requete_hogenom = ('fetchdom -b hogenom_v3 -a '.$req.' -fs " % " -t  id > ../My_php/Webdom/jobs/'.$requete.'/fetch.txt') ;
							exec($requete_hogenom);							
							list($_SESSION['requete'][$req]['ID'], $_SESSION['requete'][$req]['KW'],...) = explode(' % ',recup_req($req));
							}						
							header("location:../description_prot.php");
 
 
						break

re donc voila la partie traitement donc en gros tu recuperes les differentes requetes à faire dans $requete pour chacune tu execute la reque et tu recup les resultats dans ta variable de session ensuite tu redirige vers description_prot (plus besoin d epasser de variable tout est en session)

l'affichage arrive

**boo64** · 13/05/2009, 11h03

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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foreach(array_keys($_SESSION['requete']) as  $req){
	echo'<tr>
		<span class="h3_like"><BIG>&nbsp;'. $req.'&nbsp;</BIG></span>
		</tr>
		<tr><p><b>Description</b></p>
            <p>'.nl2br($_SESSION['requete'][$req]['KW']).'</p>
		</tr>';
 }

et voila un exemple d'affichage ensuite pour un rendu plus joli comme sur le site que tu ma montrais regarde du coté des css mais pour l'instant je ne pense pas que c'est ta priorité

**Yuki_Hime** · 13/05/2009, 12h04

Prob code de traitement

Déja, je crois qu'il y a un prob avec le nom des variables
Est ce que

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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if(isset($_GET['requete'])) $requete = $_GET['requete'];
else $requete = $_POST['requete'];
$_SESSION['requete'] = $requete;
$requetes= explode('  ',$_SESSION['requete']);

ensuite j'ai les erreurs suivantes

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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Warning: fopen(../Webdom/jobs/HBG000010/fetch.txt) [function.fopen]: failed to open stream: Not a directory in /home/idris/My_php/script_requete.php on line 7
 
Notice: Undefined offset: 8 in ../My_php/script_requete.php on line 40
 
Fatal error: Cannot use string offset as an array in ../My_php/script_requete.php on line 40

notamment car les dossiers spécifiques à chaque requetes ne sont pas créer
au lieu d'avoir un dossier "requete1" et un autre "requete 2", j'ai un grand dossier "requete1 requete2"
j'ai aussi un dossier "array" qui se crée avec un fetch.txt mais ne contenant pas ce qu'il faut
et un fichier requete1.txt avec le bon contenu

étange

Pourtant j'ai bien rajouté

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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		case "description":
			if(isset($_POST['choix'])){
			foreach ($requetes as $req){
				if(!file_exists("../My_php/Webdom/jobs/" .$requete))
				mkdir ("../My_php/Webdom/jobs/" .$requete, 0775);}

donc evidemment, s'il n'y a pas de dossier, il ne peut pas lire les fetch.txt
line 7: $fichier = fopen("../Webdom/jobs/".$requete."/fetch.txt", "r");

variable:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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case "protein":
	foreach ($requetes as $req){
		$requete_hogenom = ('fetchdom -b hogenom_v3 -a '.$requete.' -fs " % " -t  id,.... > ..//Webdom/jobs/'.$requete.'/fetch.txt') ;
		exec($requete_hogenom);							
		list($_SESSION['requete'][$req]['ID'], ....) = explode(' % ',recup_req($req));
							}						
	header("location:../description_prot.php");

break;

La je pense qu'il y a un blem, mai s je suis pas sur de moi

line 40 : ist($_SESSION['requete'][$req]['ID'], ....) = explode(' % ',recup_req($req));

**boo64** · 13/05/2009, 14h11

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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//soit tu utlise $_post soit $_get regarde ds ta page daccueil si c methode post ou methode get d'utilisé pour l'instan tu ne mets pas els requetes en session
 if(isset($_POST['requete'])) $requete = explode('  ',$_POST['requete']);
 else $requete=''
 
//$requete est donc un tableau contenant les differentes requetes en suite:
...					
//protein
						case "protein":
							foreach ($requete as $req){ //$req correspond donca chaqe requete
							$requete_hogenom = ('fetchdom -b hogenom_v3 -a '.$req.' -fs " % " -t  id > ../My_php/Webdom/jobs/'.$requete.'/fetch.txt') ; //tu cree le fichier
							exec($requete_hogenom);						
							list($_SESSION['requete'][$req]['ID'], $_SESSION['requete'][$req]['KW'],...) = explode(' % ',recup_req($req)); 
							}						
							header("location:../description_prot.php");
 
 
						break

et donc en sortie tu as un tableau de session constitué comme cela:
Array ( [requete] => Array ( [req1] => Array ( [ID] => valID
[KW] => valKW
....)
[req2] => ...

**Yuki_Hime** · 13/05/2009, 14h41

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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prob dans la fonction
function recup_req($requete){
 			$resultat_requete= "";
			$fichier = fopen("../My_php/Webdom/jobs/".$requete."/fetch.txt", "r");
			if ($fichier) {
				while (!feof($fichier)) {
				$resultat_requete= $resultat_requete.fgets($fichier, 4096);
			}
			fclose($fichier);
			}
	return $resultat_requete;
 }
 

 if(isset($_POST['requete'])) $requete = explode('  ',$_POST['requete']);
 else $requete='';
//print ($_POST['requete']);
$_SESSION['requete'] = $requete;

if(isset($_POST['choix2'])){
	
	switch($_POST['choix2']){

		case "description":
			if(isset($_POST['choix'])){
			foreach ($requete as $req){
				if(!file_exists("../My_php/Webdom/jobs/".$req))// created a folder for each query
				mkdir ("../My_php/Webdom/jobs/".$req, 0775);}
					
					switch($_POST['choix']){
						
						case "protein":
							foreach ($requete as $req){
							$requete_hogenom = ('../My_php/fetchdom/fetchdom-3.20/fetchdom -b ../My_php/fetchdom/fetchdom-3.20/hogenom_v3 -a '.$req.' -fs " % " -t  id,kw,la,nd,inn,inntype,ht,spnb,dr > ../My_php/Webdom/jobs/'.$requete.'/fetch.txt') ;
							exec($requete_hogenom);
							list($_SESSION['requete'][$req]['ID'], $_SESSION['requete'][$req]['KW'],$_SESSION['requete'][$req]['LA'],$_SESSION['requete'][$req]['ND'],$_SESSION['requete'][$req]['INN'],$_SESSION['requete'][$req]['INNTYPE'],$_SESSION['requete'][$req]['HT'],$_SESSION['requete'][$req]['SPND'],$_SESSION['requete'][$req]['DR']) = explode(' % ',recup_req($req));
prob dans la liste de variable
							}						
							header("location:../description_prot.php");

							//header("location:../description_prot.php?requete=".$requete);
							break;

Code :

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Warning: fopen(../My_php/Webdom/jobs/HBG000010 HBG000039/fetch.txt) [function.fopen]: failed to open stream: No such file or directory in /My_php/script_requete.php on line 7
 
Notice: Undefined offset: 8 in My_php/script_requete.php on line 39
 
Notice: Undefined offset: 7 in /My_php/script_requete.php on line 39
 
Notice: Undefined offset: 6 in /My_php/script_requete.php on line 39
 
Notice: Undefined offset: 5 in /My_php/script_requete.php on line 39
 
Notice: Undefined offset: 4 in /My_php/script_requete.php on line 39
 
Notice: Undefined offset: 3 in /My_php/script_requete.php on line 39
 
Notice: Undefined offset: 2 in /My_php/script_requete.php on line 39
 
Notice: Undefined offset: 1 in /My_php/script_requete.php on line 39
 
Warning: Cannot modify header information - headers already sent by (output started at //My_php/script_requete.php:7) in /My_php/script_requete.php on line 41

Comme tu peux le voir, il créer bien le dossier, mais
- il s'appelle "requete1 requete 2"
- il est vide
le dossier array est créer mais
- il ne contien le fetch que de requete 1

il y a un prob au niveau des variables puisque l'on a tout mis en $_SESSION, les as tu enlevé car c'est problématique, où estce un oubli ??

**Yuki_Hime** · 13/05/2009, 15h13

bon j'ai mi ça au debut du script, c'est plus logique

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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session_start();
 if(isset($_POST['requete'])) $requete = explode('  ',$_POST['requete']);
 else $requete='';
 $_SESSION['requete'] = $requete;

puis j'ai mis

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

list($_SESSION['requete'][$req]$_SESSION['ID'], $_SESSION['requete'][$req]$_SESSION['KW'],$_SESSION['requete'][$req]$_SESSION['LA'],$_SESSION['requete'][$req]$_SESSION['ND'],$_SESSION['requete'][$req]$_SESSION['INN'],$_SESSION['requete'][$req]$_SESSION['INNTYPE'],$_SESSION['requete'][$req]$_SESSION['HT'],$_SESSION['requete'][$req]$_SESSION['SPND'],$_SESSION['requete'][$req]$_SESSION['DR']) = explode(' % ',recup_req($req));

et là j'ai l'erreur de la parenthèse invisible sur cette même ligne de code
c'est la seule erreur restant

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

Parse error: syntax error, unexpected T_VARIABLE, expecting ',' or ')' in /My_php/script_requete.php on line 36

**boo64** · 13/05/2009, 15h30

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

 $_SESSION['requete'] = $requete;

ceci ne te sert à rien c'est ici que tu stock tout :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

list($_SESSION['requete'][$req]['ID'], $_SESSION['requete'][$req]['KW'],...) = explode(' % ',recup_req($req));

c'est un tableau ds un tableau

$_SESSION['ID'] n'exite plus tu as maintenant

$_SESSION['requete']['nom de la requete']['ID']

donc $_SESSION['requete'] est un array qui contient en index les noms des requetes et en valeur un autre tableau qui contient toutes els valeurs récupérés de la requete

**Yuki_Hime** · 13/05/2009, 15h37

ok sorry j'avais pas suivi ça comme ça.

bon la prem étape étant :

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foreach ($requete as $req){
				if(!file_exists("../My_php/Webdom/jobs/".$req))// created a folder for each query
				mkdir ("../My_php/Webdom/jobs/".$req, 0775);}

pourquoi ça ne me donne pas des dossiers distincts pour chacunes des req ????

**boo64** · 13/05/2009, 16h19

non normalement ça c toujours la fonction recup req qui le fait montre moi ton code

**Yuki_Hime** · 13/05/2009, 16h23

je désespère, je suis sur que c'est un truc tout con, mais je tourne en rond lol

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session_start();
 if(isset($_POST['requete'])) 
 $requete = explode(' ',$_POST['requete']);
 else $requete='';
 
 function recup_req($requete){// create the files that containt the query's results
 			$resultat_requete= "";
			$fichier = fopen("../My_php/Webdom/jobs/".$requete."/fetch.txt", "r");
			if ($fichier) {
				while (!feof($fichier)) {
				$resultat_requete= $resultat_requete.fgets($fichier, 4096);
			}
			fclose($fichier);
			}
	return $resultat_requete;
 }
 
 
if(isset($_POST['choix2'])){
 
	switch($_POST['choix2']){
 
		case "description":
			if(isset($_POST['choix'])){
			foreach ($requete as $req){
				if(!file_exists("../My_php/Webdom/jobs/".$req))// created a folder for each query
				mkdir ("../My_php/Webdom/jobs/".$req, 0775);
				}
 
					switch($_POST['choix']){
 
						case "protein":
							foreach ($requete as $req){
							$requete_hogenom = ('../My_php/fetchdom/fetchdom-3.20/fetchdom -b ../My_php/fetchdom/fetchdom-3.20/hogenom_v3 -a '.$req.' -fs " % " -t  id,kw,la,nd,inn,inntype,ht,spnb,dr > ../My_php/Webdom/jobs/'.$req.'/fetch.txt') ;
							exec($requete_hogenom);
							list($_SESSION['requete'][$req]['ID'], $_SESSION['requete'][$req]['KW'], $_SESSION['requete'][$req]['LA'], $_SESSION['requete'][$req]['ND'], $_SESSION['requete'][$req]['INN'], $_SESSION['requete'][$req]['INNTYPE'], $_SESSION['requete'][$req]['HT'], $_SESSION['requete'][$req]['SPND'], $_SESSION['requete'][$req]['DR']) = explode(' % ',recup_req($req));
							}						
							header("location:../description_prot.php");

**boo64** · 13/05/2009, 16h39

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if(isset($_POST['choix2'])){
 
	switch($_POST['choix2']){
 
		case "description":
			if(isset($_POST['choix'])){
			foreach ($requete as $req){
 
 
					switch($_POST['choix']){
 
						case "protein":
							foreach ($requete as $req){
							if(!file_exists("../My_php/Webdom/jobs/".$req))// created a folder for each query
							mkdir ("../My_php/Webdom/jobs/".$req, 0775);
							$requete_hogenom = ('../My_php/fetchdom/fetchdom-3.20/fetchdom -b ../My_php/fetchdom/fetchdom-3.20/hogenom_v3 -a '.$req.' -fs " % " -t  id,kw,la,nd,inn,inntype,ht,spnb,dr > ../My_php/Webdom/jobs/'.$req.'/fetch.txt') ;
							exec($requete_hogenom);
							list($_SESSION['requete'][$req]['ID'], $_SESSION['requete'][$req]['KW'], $_SESSION['requete'][$req]['LA'], $_SESSION['requete'][$req]['ND'], $_SESSION['requete'][$req]['INN'], $_SESSION['requete'][$req]['INNTYPE'], $_SESSION['requete'][$req]['HT'], $_SESSION['requete'][$req]['SPND'], $_SESSION['requete'][$req]['DR']) = explode(' % ',recup_req($req));
							}						
							header("location:../description_prot.php");

j'ai remis la creation du fichier ds uns eul for each cela evite de parcourir plusieur fois $requete par contre concernant ton soucis je pense que ce la vien de $requete qui doit être vide remontre moi le formulaire page accueil tu ne dois pas etre en POST

**Yuki_Hime** · 13/05/2009, 16h53

non c'est bien un post !!!

alors bonnes nouvelles :
-les dossiers sont créer séparément
-le fetch convient dans chacun des dossiers
-je suis bien dirigée vers la pages

bad news:
rien ne s'affiche lol je vais faire un tour dans les variables de la pages d'affichage car j'ai bien use ton code

Code :

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<?php
'.foreach(array_keys(.$_SESSION['requete'].) as $req){
	'<tr>
		<span class="h3_like"><BIG>&nbsp;'. $req.'&nbsp;</BIG></span>
		</tr>
		<tr><p><b>Description</b></p>
            <p>'.nl2br($_SESSION['requete'][$req]['KW']).'</p>
		</tr>';
 }.'
?>

j'ai enlevé le echo et j'ai tout mis entre '. .';
mais rien ne fais

PS : moi j'ai une coloration syntaxique pour PHP.........donc ça devrait marcher non ?

**boo64** · 13/05/2009, 17h07

oula peux tu me montrer la page entiere parsque la jevois pas ce que tu chers à faire

**Yuki_Hime** · 13/05/2009, 17h10

ok sorry

'.foreach(array_keys(.$_SESSION['requete'].) as $req){
.........
}.'
c'est tout le bloc en dessous que je veux répéter pour chaque requette

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      <tr>
        <td align="center"  bgcolor="#999999" >
          <table border="0" cellspacing="0" cellpadding="0">
            <tr> 
              <td align="center" valign="top">
                <span class="h3_like"><BIG>&nbsp;'. $_SESSION['requete'][$req].'&nbsp;</BIG></span>
              </td>
            </tr>
          </table>
        </td>
      </tr>
 
      <tr>
        <td align="left">
          <TABLE BORDER=0 ALIGN=Left  cellspacing="3" cellpadding="0">
            <tr>
              <td bgcolor="#CCCCCC">
                <p>
                  <b>Description</b>
                     '.nl2br($_SESSION['requete'][$req]['KW']).'
            </tr>
            <tr>
              <td bgcolor="#CCCCCC">
                <p>
                  <b>Number of protéique sequences</b>
 
                     '.nl2br($_SESSION['requete'][$req]['ND']).'
                </p>
            </tr>
            <tr>
              <td bgcolor="#CCCCCC">
                <p>
                  <b>Alignement lenght</b>
                     '.nl2br($_SESSION['requete'][$req]['LA']).'
                </p>
            </tr>
            <tr>
              <td bgcolor="#CCCCCC">
                <p>
                  <b>Horizontal transfert</b>
                     '.nl2br($_SESSION['requete'][$req]['HT']).'
                </p>
            </tr>
 
            <tr>
              <td bgcolor="#CCCCCC">
                <p>
                  <b>Innovation</b>
                     '.nl2br($_SESSION['requete'][$req]['INN']).' 
                </p>
            </tr>
            <tr>
              <td bgcolor="#CCCCCC">
                <p>
                  <b>Innovation type</b>
                     '.nl2br($_SESSION['requete'][$req]['INNTYPE']).'
                </p>
            </tr>
            </table>

**boo64** · 13/05/2009, 17h15

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<?php
foreach(array_keys(.$_SESSION['requete'].) as $req){
echo'<tr>
        <td align="center"  bgcolor="#999999" >
          <table border="0" cellspacing="0" cellpadding="0">
            <tr> 
              <td align="center" valign="top">
                <span class="h3_like"><BIG>&nbsp;'. $_SESSION['requete'][$req].'&nbsp;</BIG></span>
              </td>
            </tr>
          </table>
        </td>
      </tr>
      
      <tr>
        <td align="left">
          <TABLE BORDER=0 ALIGN=Left  cellspacing="3" cellpadding="0">
            <tr>
              <td bgcolor="#CCCCCC">
                <p>
                  <b>Description</b>
                </p>
              </td>
              <td>
                <p>
                     '.nl2br($_SESSION['requete'][$req]['KW']).'
                </p>
              </td>
            </tr>
            <tr>
              <td bgcolor="#CCCCCC">
                <p>
                  <b>Number of protéique sequences</b>
                </p>
              </td>
              <td>
                <p>
                     '.nl2br($_SESSION['requete'][$req]['ND']).'
                </p>
              </td>
            </tr>
            <tr>
              <td bgcolor="#CCCCCC">
                <p>
                  <b>Alignement lenght</b>
                </p>
              </td>
              <td>
                <p>
                     '.nl2br($_SESSION['requete'][$req]['LA']).'
                </p>
              </td>
            </tr>
            <tr>
              <td bgcolor="#CCCCCC">
                <p>
                  <b>Horizontal transfert</b>
                </p>
              </td>
              <td>
                <p>
                     '.nl2br($_SESSION['requete'][$req]['HT']).'
                </p>
              </td>
            </tr>
            
            <tr>
              <td bgcolor="#CCCCCC">
                <p>
                  <b>Innovation</b>
                </p>
              </td>
              <td>
                <p>
                     '.nl2br($_SESSION['requete'][$req]['INN']).' 
                </p>
              </td>
            </tr>
            <tr>
              <td bgcolor="#CCCCCC">
                <p>
                  <b>Innovation type</b>
                </p>
              </td>
              <td>
                <p>
                     '.nl2br($_SESSION['requete'][$req]['INNTYPE']).'
                </p>
              </td>
            </tr>
            </table>
        </td>
      </tr>';	
 }
  ?>

comme cela?

**Yuki_Hime** · 13/05/2009, 17h19

exact sauf que ça me dit

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
 
Parse error: syntax error, unexpected T_STRING in /home/idris/My_php/description_prot.php on line 122

soit la ligne du for each

**boo64** · 13/05/2009, 17h26

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

foreach(array_keys($_SESSION['requete']) as $req){

voila plutôt

**Yuki_Hime** · 13/05/2009, 17h33

tjs pass lol, même erreur

je verrai demain

merci pour cette dure journée !!!!

**Yuki_Hime** · 14/05/2009, 12h46

j'ai mi tou les pt s, virgules et autres possible...................;rien ne fait

**boo64** · 14/05/2009, 13h06

donne le code de ta page entière que je regarde

Case à cocher et répartition des tâches

Langage PHP

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