Discussion :

[Yaya074]

Bonjour à tous,

Je bosse sur un projet de macro sur FIJI (ImageJ) qui me permet d'analyser des particules.
Gros boulot de segmentation, puis d'analyse de mes particules une à une.
Mon problème est que j'obtient des données d'analyse de particules et des données de squelette. Pour ne pas voir mes tableaux disparaître, ils sont automatiquement renommés via ma macro.
Ma problème, je n'arrive pas à voir accès à mes données!

J'aimerais vérifier que les données dans les tableaux répondent à des critères pour classer mes particules.

Lorsque le tableau de résultat se nomme Results, je sais qu'on utilise la commande getResult.

(getResult("Area",i))

Mais si mon tableau de résultat s'appelle "Particule", comment accéder à la valeur i de la donnée Area?

Merci!

[Yaya074]

J'ai finalement résolu mon problème de tableau, il suffit de renommer tous les tableaux pour qu'aucun n'ai comme nom Result, puis un simple choix de la fenêtre à étudier permet d'utiliser getResult!

Mais maintenant j'ai un problème avec mon analyse de tableau, je n'arrive pas à vérifier plusieurs conditions en même temps (alors que b devrait monter en valeur!!).

Voila mon code :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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//___________________________________________________________________________________________
//analyse directe des données du tableau
//a, b, c et d correspondent aux nombre de particules appartenant à chaque phénotype.
//nr désigne les phénotypes non reconnaissables
a=0
b=0
c=0
d=0
nr=0
 
 
for (i=1 ; i<nResults ; i++)
{
	selectWindow("AnalyseParticule");
	air=getResult("Area",i);
	perim=getResult("Perim",i);
	height=getResult("Height",i);
	if ((air>0) & (perim>0) & (height>0))
	{
		selectWindow("SkeletteResulte"+i);
		r=getResult("# Branches");
		if (r > 0)
		{
			a=a+1;
		}		
	}
	else if ((air>0) & (perim>0) & (height>0))
	{
		b=b+1;
	}
	else if ((air<500) & (perim<10) & (height<10))
	{
		c=c+1;
	}
	else if ((air<500) & (perim<10) & (height<10))
	{
		d=d+1;
	}
	else
	{	
		nr =nr+1;
	}
}
 
waitForUser("Resultat de l'analyse", "Il y a "+a+" spores de type A, " +b+" spores de type B, " +c+" spores de type C et "+d+" spores de type D");
 
if ((a>b) & (a>c) & (a>d))
{
	waitForUser("Resultat de l'analyse", "Ces spores ont un phénotype de type A");
}
else if ((b>a) & (b>c) & (b>d))
{
	waitForUser("Resultat de l'analyse", "Ces spores ont un phénotype de type B");
}
else if ((c>a) & (c>b) & (c>d))
{
	waitForUser("Resultat de l'analyse", "Ces spores ont un phénotype de type C");
}
else if ((d>a) & (d>b) & (d>c))
{
	waitForUser("Resultat de l'analyse", "Ces spores ont un phénotype de type D");
}
else
{
	waitForUser("Probleme d'analyse");
}

[Tchoukatroc]

Bonjour,

Dans tes tests de conditions if et else if, as tu essayé d'utiliser l'opérateur && (booléen AND) au lieu de & (bitwise AND)? Quand je fais des macros, j'utilise toujours le booléen. Je ne sais pas à quoi sert le bitwise.

[Népomucène]

Je ne sais pas à quoi sert le bitwise.

bitwise AND & évalue les conditions à gauche ET à droite
alors que le booléen AND && évalue d'abord la condition à gauche et s'arrête là si c'est suffisant pour conclure au vrai ou faux.
Donc à priori, il vaut mieux utiliser le booléen && qui peut être plus rapide

Ceci est aussi vrai pour le OR ||

[joel.drigo]

Donc à priori, il vaut mieux utiliser le booléen && qui peut être plus rapide

Et puis ça permet d'éviter certaines exceptions, par exemple :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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if ( string!=null && !string.isEmpty()  ) {
   // ...
}

Alors que le code qui suit provoque une NullPointerException si string est null :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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if ( string!=null & !string.isEmpty()  ) {
   // ...
}

[Tchoukatroc]

Merci Népomucène et Joel pour l'info. Donc le problème de Yaya ne vient pas de l'opérateur.
Yaya, je pense que le problème vient du fait que ton if

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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if ((air>0) & (perim>0) & (height>0))
	{
		selectWindow("SkeletteResulte"+i);
		r=getResult("# Branches");
		if (r > 0)
		{
			a=a+1;
		}		
	}

possède exactement les même conditions que le else if qui suit.

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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else if ((air>0) & (perim>0) & (height>0))
	{
		b=b+1;
	}

Ta valeur b ne pourra jamais augmenter. Si air>0, perim>0, height>0, la condition pour premier if va être respectée et donc ta boucle ne passera pas par le else if, donc pas d'augmentation de b.
Pareil, pour tes valeurs c et d, les else if ont tous les deux exactement les mêmes conditions.

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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else if ((air<500) & (perim<10) & (height<10))
	{
		c=c+1;
	}
else if ((air<500) & (perim<10) & (height<10))
	{
		d=d+1;
	}

Ta valeur d n'augmentera donc jamais.

[Yaya074]

Bonjour à tous,

J'ai finalement résolu mon problème, je n'ai plus le code sous la main (enfin il est rangé dans le DD à la maison), mais au final ce n'était ni mes conditions (vérifiées une par une avec des conditions toujours vrai) ni ma réflexion qui bloquaient, c'était une colonne des tableaux qui n'était pas récupérées, donc impossible de faire avancer la chose!
En fait, la colonne "Périmètre" est "Perim." et non "Perim" comme je l'avais écrit... Bref, beaucoup de choses pour rien :p

Mais merci, au moins je sais maintenant la différence entre & et &&!

[Népomucène]

au moins je sais maintenant la différence entre & et &&!

et comme l'a bien expliqué joel.drigo c'est très utile pour ne pas déclencher de nullPointerException