Discussion :

[matlabation]

Bonjour à tous,
Ma question est peut être bête, mais moi je galère depuis 2 jours déjà , je n'arrive à importer un fichier xlsx ( 2013) sous Rstudio, j'ai beau essayé plusieurs types de fonctions proposées sur le net ça donne rien.
voila mon code:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

essai<-read.xlsx(file="essai.xlsx",sheet=1)

le message d'erreur:
Error: could not find function "read.xlsx"
suite à ça j'essaye d'installer le package "xlsx" qui me demande a son tour l'installation de "rJava", chose que j'ai faite, mais ça me dis ça:
1: le package ‘xlsx’ a été compilé avec la version R 3.1.3
2: le package ‘rJava’ a été compilé avec la version R 3.1.3
3: In get(Info[i, 1], envir = env) : internal error -3 in R_decompress1
Error: le package ‘rJava’ ne peut être chargé
alors que quand je tape la ligne de commande

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

 library()

je les trouve dans ma bibliothèque.
Je ne comprends vraiment rien
Merci d'avance de votre aide

[Theta]

As tu Java à jour?

[matlabation]

oui oui bien à jour!

[Theta]

Je n'ai jamais eu de problèmes avec rJava.
Essaye de réinstaller les packages, ça arrive qu'ils se corrompent.

[matlabation]

c'est ce que j'ai fait au moins 3 fois, voila ce qui me donne comme message:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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> install.packages("rJava")
Installing package into ‘C:/Users/moi/Documents/R/win-library/3.1’
(as ‘lib’ is unspecified)
trying URL 'http://cran.rstudio.com/bin/windows/contrib/3.1/rJava_0.9-6.zip'
Content type 'application/zip' length 759396 bytes (741 Kb)
opened URL
downloaded 741 Kb
package ‘rJava’ successfully unpacked and MD5 sums checked
 
The downloaded binary packages are in
	C:\Users\moi\AppData\Local\Temp\RtmpS69m6y\downloaded_packages

après ce message j'ai cru comprendre que c'était bien installé, donc je ressaye d'importer mais j'ai encore le même message:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

Error: could not find function "read.xlsx"

!!!!

[bonnessagne]

J'ai le même problème. J'ai téléchargée une nouvelle version de Java mais le message d'erreur est toujours le même :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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install.packages("C:\\ProgramFiles\\R\\R-3.2.0\\library\\rJava")
 
library("rJava", lib.loc="C:/Program Files/R/R-3.2.0/library")
Error : .onLoad a échoué dans loadNamespace() pour 'rJava', détails :
  appel : inDL(x, as.logical(local), as.logical(now), ...)
  erreur : unable to load shared object 'C:/Program Files/R/R-3.2.0/library/rJava/libs/x64/rJava.dll':
  LoadLibrary failure:  Le module spécifié est introuvable.
 
 library("xlsx", lib.loc="C:/Program Files/R/R-3.2.0/library")
Le chargement a nécessité le package : rJava
Error : .onLoad a échoué dans loadNamespace() pour 'rJava', détails :
  appel : inDL(x, as.logical(local), as.logical(now), ...)
  erreur : unable to load shared object 'C:/Program Files/R/R-3.2.0/library/rJava/libs/x64/rJava.dll':
  LoadLibrary failure:  Le module spécifié est introuvable.
 
Error: le package ‘rJava’ ne peut être chargé

Comment faire ?
Pourquoi ne reconnait-il pas le fichier qui a été chargé ?
Une aide serait vraiment la bienvenue !

[chautho]

Bonjour,

J'ai découvert récemment le package readxl. Très pratique il marche très bien pour lire les fichiers xls et xlsx.

Tu n'as qu'à utiliser la fonction read_excel. Ca marche très bien

Remarque : il n'a pas dans ses dépendances le package rJava donc ça t'aidera peut-être

[bonnessagne]

merci, j'essaye de suite !!!
Cela marche bien !
J'ai réussi à résoudre mon problème de Java, j'ai fait une installation manuelle de java en 84 bits (la version qu'utilisait mon ordi était systématiquement en 32 ...).
Après, il faut mettre cette commande étrange mais qui fonctionne : Sys.setenv(JAVA_HOME='C:\\Program Files\\Java\\jre7').
De fait la version installée est la 7 pas la 8 !
Pour la commande read_excel : un grand merci !
Simple mais efficace et oui, elle marche sans repasser par Sys.setenv(JAVA_HOME='C:\\Program Files\\Java\\jre7') comme pour installer rJava !!!

[matlabation]

Bonjour à tous.
Bonnnessagne, peux-tu me dire, s'il te plait, dans quelle mesure tu utilises cette commande : Sys.setenv(JAVA_HOME='C:\\Program Files\\Java\\jre7') ? Car effectivement, en exécutant ça avait l'air de marcher, mais en essayant d'importer le fichier xslx, j'ai toujours le même message d'erreur:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

Error:could not find function "read.xlsx"

Concernant la fonction proposée par chauto, je ne sais pas comment s'écrivent les termes, faut-il installer un package spécifique?
Merci d'avance pour vos réponses.

[chautho]

Oui pour utiliser la fonction read_excel(), il faut installer le package readxl :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

install.packages("readxl")

Ensuite fait :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

?read_excel

Pour mieux connaitre la fonction.

[bonnessagne]

Voilà comment je commence :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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install.packages("readxl")
library(readxl)
ter1=read_excel("nomdufichier.xlsx",sheet=1,col_names = TRUE)

Pour cette commande la feuille est la première (je n'ai qu'une feuille sous mon fichier excel).

Pour l'autre façon :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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Sys.setenv(JAVA_HOME='C:\\Program Files\\Java\\jre7')
install.packages("xlsx")
library(xlsx)
ter=read.xlsx("nomdufichier.xlsx",sheetName="Feuil3")

avec la commande je peux rajouter les lignes et les colonnes que je veux garder ce qui me permet dans ce cas d'éliminer deux colonnes qui apparaissent comme variables ! Ici 107 ligne dont celle avec le nom des variables donc 106 lignes de données.

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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ter=read.xlsx("nondufichier.xlsx",sheetName="Feuil3",startRow = 1,endRow = 107, colIndex = 1:7)

je n'ai pas trouvé de telle fonction dans read_excel !
feuille 3 car le nom de ma feuille est Feuil3 sous R.

Voilà a+

[iGaia]

Plus simplement, et je ne sais pas si cela modifie vraiment les choses. Mais pourquoi ne pas "enregistrer la table sous" et changer le format en .csv ?

De cette façon, il ne suffit plus que d'utiliser un read.csv ou read.csv2.

[bonnessagne]

J'avais tenté cette approche mais elle n'était pas concluante ! Pour l'instant read.xlsx est la commande la plus performante pour mon niveau car elle me permet de facilement de sélectionner les lignes et les colonnes qui m'intéresse !

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

A=read.xlsx("fichierexcel.xlsx",sheetName="Feuil3",startRow = 1,endRow = 107, colIndex = 1:7)