Discussion :

[VincentBr]

Si quelqu'un pouvais aider un jeune padawan, ça serait super !

Voici mon code:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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def ADN2arn(ch):
    texte = traitement_fichier(ch)
    transcription = {'T':'a','A':'u','G':'c','C':'g'}
    texte_transcrit = ''
 
    for lettres in transcription:
        texte_transcrit = texte.replace(lettres,transcription[lettres])
 
    return texte_transcrit
 
print(ADN2arn('chromo.txt'))

Je voudrais remplacer chaque lettres majuscules présentent dans le dictionnaire par les lettres minuscules correspondantes.
Mais lorsque je fais tourner le programme ...

Liste initiale -> TCAGTGTTAGTGTTAGTGTTAGTATTAGGGTGTGGTGTGTGGGTGTGGTGTGGGTGTGGGTGTGGGTGTG
GGTGTGGGTGTGGGTGTGGTGTGGTGTGTGGGTGTGGTGTGGGTGTGGTGTGTGTGGG

Liste retournée -> TCAcTcTTAcTcTTAcTcTTAcTATTAcccTcTccTcTcTcccTcTccTcTcccTcTcccTcTcccTcTc\
ccTcTcccTcTcccTcTccTcTccTcTcTcccTcTccTcTcccTcTccTcTcTcTccc

Il a seulement choisit de changer le G ..
Pourquoi pas les autres lettres ?

[plxpy]

Bonjour

je ne me prononce pas sur la méthode. Mais, l'explication est très simple.

A chaque itération, tu ré-affectes texte_transcrit (et donc tu écrases allègrement ce qui a pu être fait avant). L'ordre étant (presque ...) quelconque quand on parcourt un dictionnaire, tu n'as droit, au final, qu'à la dernière itération : dans le cas présent, 'G' a été transformé en 'c'.

[VincentBr]

Ah d'accord ! Mais je ne vois pas vraiment comment resoudre mon probleme ..

Vous pensez à quelle autre méthode s'il vous plait ?

[plxpy]

Mais je ne vois pas vraiment comment resoudre mon probleme ..

Oh ! Travailler sur une chaine mise à jour, itération après itération, pardi. Ne pas repartir de la chaine initiale mais de la chaine modifiée (par les itérations précédentes)

[VincentBr]

Je ne comprends pas vraiment en fait comment tourne le programme finalement ..
Pourquoi l'étape

Travailler sur une chaine mise à jour, itération après itération

ne se fait pas déjà ?
Je ne cerne pas la condition nécessaire pour ma boucle while dans le cas contraire pour parcourir le texte modifié précédent.

[plxpy]

... pour ma boucle while

quelle boucle while ? Je n'ai rien vu de tel !

[VincentBr]

Je me suis mal fait comprendre !

Juste pour résoudre mon problème et travailler sur une chaine mis à jour, je pensais que je devais utiliser une boucle while. Il n'en est rien ?
Je ne vois pas comment mettre en oeuvre votre conseille en fait.

[wiztricks]

Salut,

Vous avez les méthodes maketrans et translate pour faire çà:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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>>> table = str.maketrans('TAGC', 'aucg')
>>> 'TCAGTGTTAGTGTTAGTGTTAGTATTAGGGTG'.translate(table)
'agucacaaucacaaucacaaucauaaucccac'
>>>

- W