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C'est pas encore très démocratisé, surtout sur Azure (ça l'est plus sur Java/Amazon), mais j'ai trouvé ça.

Et sinon la MSDN

Le principe général, de façon très simplifiée, c'est de mettre dans...

BLL/DAL ce sont des notions d'architecture n-tiers.
La couche BLL est la couche métier, DAL c'est l'accès aux données, plus une couche de présentation (3-tiers).

Pour l'e-commerce, ça dépend de...

Comme tu le dis toi même, ça dépend de ta conception générale.

Si t'as une application web, avec une base de données et une IHM, autant faire un MVC (ou MVC2, ou MVC3, MVVM, selon technos etc...),...