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Ok et merci

C'est vrai que c'est une autre solution. Est-ce mieux que la regexp que j'utilise? Normalement, les séquences doivent toujours avoir ce format mais il vaut peut-être mieux que je vérifie qu'elles ont...

Désolée, mais ce n'est pas facile à expliquer mais merci pour ton aide :

Il ne faut pas analyser la première occurrence des 3 triplets mais vérifier qu'on trouve bien AGC en position 42, le CGT en...

Voici ce que j'ai fait :


my ($mut1, $mut2, $mut3 ) = $consensus=~ m/[a-z\.]{41}([a-z\.]{3})[a-z]{117}([a-z]{3})[a-z]{219}([a-z]{3})[a-z]{54}/i;

if ($mut1 ne 'AGC'){

my...

peut-être quelque chose du genre :


$consensus = 'TCTGTGCCGCCGYCATTACCATGAGCGATAACAKCGCCGCCAATCTGCTGCTGGCCACCG...’;
my ($mut1, $mut2 ...) = $consensus =~...

Voici mes données :

$TEM_ref = 'TCTGTGCCGCCGTCATTACCATGAGCGATAACAGCGCCGCCAATCTGCTGCTGGCCACCG’;
$contig = 'TCTGTGCCGCCGCCATTACCATGAGCGATAACATCGCCGCCAATCTGCTGCTGGCCACCG’;
$consensus =...