Discussion :

[titou_170]

bonjour
je suis novice en python et j'aimerai ecrire un script integrant un fichier csv en tableau puis faire des calculs de distances type euclidean.

j'ai rencontre différents problèmes dont le dernier, après l'installation de scipy 0.7 ( pour pouvoir reconnaitre la librairy scipy.spatial.distance), apres l'installation de ce module il n'arrive plus a lire io-array alors que sous la version 0.6 de scipy cela fonctionnait.
pouvez vous m'aider pour trouver les modules adéquates pour calculer a la fois io-array et scipy.spatial.distance.euclidean
merci d'avance!!

Code :

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tableau = io.array_import.read_array(sys.argv[1])

message d'erreur:

Code :

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Traceback (most recent call last):
  File "./calculAD", line 9, in <module>
    tableau = io.array_import.read_array(sys.argv[1])
NameError: name 'io' is not defined

[Matthieu Brucher]

Il ne connaît pas le module io, as-tu bien fait from scipy import io ?

[titou_170]

non, la version scipy 0,7 ne reconnais pas io mais est reconnue par la version 0,6

j'ai mis cette version car je voulais la librairie spatial.distance qui n'est reconnue par aucune des deux versions

une idée d'où pourrait venir mon problème??

[titou_170]

oui j'ai bien fais : from scipy import *

[Matthieu Brucher]

from scipy import * n'est pas la bonne méthode.
Fais plutôt des from scipy import io.

[titou_170]

Merci!!!
maintenant le probleme io est resolu mais il me reste le probleme avec les spatial.distance
dans mon code les spatial.distance ne sont pas reconnues
faut il importer un paquet specifique de scipy?

Code :

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Traceback (most recent call last):
  File "./calculAD", line 21, in <module>
    d = euclidean(u, v)
NameError: name 'euclidean' is not defined

[Matthieu Brucher]

Si tu donnes plus d'infos, ça ira mieux. De manière générale, from XXX import *, c'est pas bon, donc fais un import explicite de la fonction que tu veux.

[20100.]

Je rebondis sur ton affirmation : from xxx import * c'est pas bon. Pourquoi ?
Je commence toujours mes programmes sous scipy par from scipy import *
pour pouvoir faire appel à l'ensemble des fonctions de base de scipy sans devoir dire explicitement schtroumpf.arange() ou xxx.dot() etc... Je veux bien croire que ça prend un peu plus de temps au chargement, mais à part ça quels sont les inconvénients ?

[Matthieu Brucher]

Parce que tu ne sais pas ce que tu importes (et tu n'importes pas tout).
Sur les dernières versions de scipy, il n'y a plus d'import automatique des sous-modules.

[titou_170]

J'ai essayé d'importer seulement la partie qui m'intéressait mais pas plus de reussite...

[Matthieu Brucher]

Il va falloir plus que ça pour qu'on résolve ton problème. Donne nous un mini script qui reproduit le problème.

[titou_170]

j'ai résolu le problème en réinstallant la version scipy précédente et maintenant le module oi.array remarche

merci!

[pfeuh]

Salut,

from xxx import * c'est pas bon.

C'est un problème de portée. Prenons l'exemple des fonctions split et join, qui sont présentes à la fois dans os.path et dans string. Avec une importation du style

Code :

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from xxx import *

c'est les fonctions du dernier module importé qui seront appelées par split ou join. Par contre avec une importation correcte ce problème est résolu

Code :

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import os.path
import string
print string.join(['got', 'from', 'string'], '.')
print os.path.join('disk', 'level1', 'level2', 'filename')

[Matthieu Brucher]

En même temps, string est déprécié et à ne plus utiliser

[pfeuh]

Il n'y a apparemment que des fonctions très précises qui sont dépréciées:

atof
atoi
atol

Pour les autres fonctions, je ne vois aucune raison de ne pas les utiliser. Des fonctions de remplacement existent? Je pense à split, join, upper, lower etc... que j'utilise souvent.

[Matthieu Brucher]

Oui, toutes ces fonctions sont remplacées par les méthodes.

"".split(), "".join(), ...

[pfeuh]

Ok, vu. Merci beaucoup.