Discussion :

[goenitz]

bjr à tous
je suis en train de créer une application sous python 2.6 et j'utilise la bibliothèque igraph, ce pendant j'ai un problème: quand j'utilise la fonction (write) pour sauvegarder mon graph sous le format graphml pas de problème mais quand j'essaie de le lire avec Graph.Read j'ai un message d'erreur par exp:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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from igraph import*
g=Graph(4)
g.add_edges([(0,1),(1,3),(0,2)])
g.vs["name"]=["a","b","c","d"]
write(g,"c:/test.txt","graphml")

après quand j'essaie: v=Graph.Read("c:/test.txt","graphml")
j'ai message d'erreur:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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igraph.core.InternalError: Error at .\src\foreign-graphml.c:1033: GraphML support is disabled, Unimplemented function call
File "C:\Documents and Settings\Khalef\Bureau\lalala.py", line 7, in <module>
  v=Graph.Read("c:/teste111.txt","graphml")
File "C:\Python26\Lib\site-packages\igraph\__init__.py", line 1138, in Read
  return reader(f, *args, **kwds)

et meme quand j'essaie d'utiliser le fichier créé via un autre logiciel comme pajek sa ne marche pas.
si quelcun pouvais m'aider sa serai très sympa
merci d'avance.

[wiztricks]

Salut,
Le message d'erreur est assez explicite:

GraphML support is disabled, Unimplemented function call

Si vous jetiez un oeil dans les sources vous verriez:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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int igraph_read_graph_graphml(igraph_t *graph, FILE *instream,
			      int index) {
 
#if HAVE_LIBXML == 1
  xmlParserCtxtPtr ctxt;
  {...}
  return 0;
#else
  IGRAPH_ERROR("GraphML support is disabled", IGRAPH_UNIMPLEMENTED);
#endif
}

Ce qui signifie en général que lors de l'installation le package a été recompilé après que "configure" d'autotools ait vérifié ce qui était présent ou pas. N'ayant pas trouvé la libxml, il a crée un config.h avec HAVE_LIBXML = 0 et igraph_read_graph_graphml retourne cette erreur.

Installez la libxml est donc un pré-requis.
Est-ce qu'il suffit de réinstaller igraph pour que çà tombe en marche? Vous nous raconterez çà tantôt.
- W
PS: Et pourquoi est-il capable de créer des fichiers GraphML? Ben sauf pour valider la conformité du XML crée avec un DTD ou un XSD, la création de fichiers XML est suffisamment simple pour qu'on se passe de bibliothèque XML. Pour la lecture, c'est différent et s'en passer signifie refaire pas mal de codes.

[goenitz]

d'abord merci pour votre réponse mais mon problème persiste quand mémé.
j'ai refait toute mon installation c.a.d j'ai désinstallé python2.6 je l'ai réinstallé puis j'ai installé le module libxml2.7.4,après j'ai installé igraph0.5.2, j'ai ressayé et toujours le meme message d'erreur.

[wiztricks]

Salut,

j'ai refait toute mon installation c.a.d j'ai désinstallé python2.6 je l'ai réinstallé puis j'ai installé le module libxml2.7.4,après j'ai installé igraph0.5.2, j'ai ressayé et toujours le meme message d'erreur.

configure ne trouve pas libxml.
Est ce que libxml est dans le PATH?
Sur quel OS êtes vous?
Si vous tapez xmllint 'à la console' çà donne quoi?
- W

[goenitz]

pour répondre au questions, d'abord je veux preciser que je suis un novice ,alors pour "Est ce que libxml est dans le PATH?" je ne sais pas repondre.
sinon je travail sous windows xp et quand je tape xmllint j'ai un message d'erreur disant que xmllint n'est pas définie

[wiztricks]

pour répondre au questions, d'abord je veux preciser que je suis un novice ,alors pour "Est ce que libxml est dans le PATH?" je ne sais pas repondre.

Mais si:

sinon je travail sous windows xp et quand je tape xmllint j'ai un message d'erreur disant que xmllint n'est pas définie

Ajoutez le chemin/répertoire où ont été installés xmllint et libxml2 au "path" en procédant comme décrit à l'URL.

- W
PS: L'installation de logiciels open sources n'est pas une activité raisonnable pour des "novices": vous risquez de commettre des dégâts regrettables sur votre environnement système sans même savoir comment.