Discussion :

[W123sb]

Bonjour,
Je suis un nouveau utilisateur de R,
Je doit faire des ACP inter et intra classes de mes individus pour voir l'effet de certains facteurs abiotiques sur la structures la communauté.
D'après ce que j'ai compris, les données doivent être stoquées dans une liste.
Pour commencer j'ai deux jeux de données
1_Fichier sur individus et variables (quantitatifs)

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
3
4
5
6
7
8
indi   V1  V2  V3  V4..... 
1     10    5   9   6
2     3     3   4   3
3     4     0   2   4
4     5     5   1   9
5     10    5   4   6
.
.

2-Fichier sur individus et facteurs abiotiques

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
3
4
5
6
7
8
indi   Altitude  Sol   date..(qualitatives)... 
1        500      2     SP
2        500      2     SP      
3        500      2     SP
4        500      2     SP
5        500      2     SP 
.
.

Ma première question comment faire pour obtenir cette liste à partir des ces données pour que R arrive à la lire? et quelle fonction serra utilisée pour cela ?

Merci d'avance.

W123sb

[pitipoisson]

Bonjour,

Je ne vois pas précisément ce que tu vas utiliser comme fonction pour les analyses, mais je pense que ce n'est pas une liste qu'il te faut... ou plutôt un cas particulier de liste : une data.frame.

Pour obtenir ça, tu procèdes simplement comme on te l'a indiqué dans la discussion Problème avec read.table() :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

data <- read.table(<les options qui vont bien>)

[W123sb]

J'ai utilisé la fonction s.class(), aant mes données je les ai mis dans un data .frame.



Merci pour votre aide.

W123

[W123sb]

Bonjour,
Après avoir utiliser la fonction s.class () pour représenter les centres de gravite de chaque groupe et le lien entre un échantillon et son groupe d'appartenance. J'ai trouvé une autre fonction between. Ma question est quelles sont les différences entre ces deux fonctions?
Merci

W123sb

[pitipoisson]

s.class n'est qu'une fonction de représentation des classes dans un plan factoriel.
between est une fonction qui sert à faire une analyse (analyses inter-classes). Avec la fonction within (analyses intra-classes), je crois que ça correspond mieux à ce que tu cherche à faire (d'après ce que j'ai pu en comprendre).