Discussion :

[Vantrax]

Bonjour,

Je suis confronté a un problème qui n'en sera surement pas un pour vous, je souhaite récupérer la sortie STDOUT d'un programme (Ce qui s'affiche dans mon terminal). Le programme que j'exécute redirige déjà son résultat vers un fichier or si j'utilise la commande system ou les `` je ne récupère rien dans mon tableau ... quelqu'un à t-il une idée ?

# je ne récupère pas ce qui apparaît dans la console
my (@outPut) = system("mafft-profile $fileRef $fileRef >out") ;
my (@outPut) = `mafft-profile $fileRef $fileRef >out` ;

# je récupère ce qui est censé être redirigé dans le fichier
my (@outPut) = system("mafft-profile $fileRef $fileRef") ;
my (@outPut) = `mafft-profile $fileRef $fileRef ` ;

En vous remerciant par avance et en vous souhaitant une excellente fin de journée .

[Vantrax]

Désolé pour le dérangement,

En faites le résultat de la commande affiché dans le terminal est à considérer comme une erreur, même si l'exécution se déroule sans aucun problème. La fonction open3 permet de récupérer la sortie d'erreur, cela a déjà été présenté de nombreuses fois sur le forum ...

En m'excusant une nouvelle fois et en vous souhaitant bonne journée