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Bioinformatique Perl Discussion :

faire du clustering hierarchique avec Bioperl


Sujet :

Bioinformatique Perl

Mode arborescent

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  1. #1
    Membre éclairé
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    Messages : 379
    Par défaut faire du clustering hierarchique avec Bioperl
    Bonjour à tou(te)s,

    j'aimerais avoir des informations sur clustering hierarchique avec Bioperl.

    En effet, j'en ai jamais fait moi-même (ni avec bioperl, ni avec quoi que ce soit d'autre), et j'avoue que je m'y perds un peu.
    Mais là, j'ai pas le choix, boulot oblige, faut que j'en fasse

    J'ai des données que j'ai réussi à représenté sous la forme présentée en image jointe (grâce au module GD).
    les données sont triées, mais pas regroupées.

    j'ai vu sur le cpan qu'il existe un certain nombre de modules perl pour faire des arbres et des clusters, et je ne sais pas par où commencer...
    Faut-il obligatoirement commencer par faire un arbre avant de pouvoir faire un cluster?
    Y'a-t-il un module perl plus efficace/simple que les autres?

    Je me permets de poser la question sans avoir fait de grandes investigations avant car mon contrat se termine dans 3 semaines et que je dois obtenir les résultats avant...

    Merci d'avance pour tous les conseils que vous pourrez m'apporter
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