Salut,

Voici une petite explication pour ceux qui sont sous Windows et ont besoin de mettre à jour Bioperl. Beaucoup de personnes utilisent Bioperl version 1.5 sans s'en rendre compte (vieille version). Vous devez passer à la 1.6 pour bénéficier des nouveautés et surtout avoir une adéquation entre les modules et les documentations disponibles sur le CPAN. Voici les démarches à suivre :

  1. Lancer ppm
  2. Supprimer le repository bioperl si vous en aviez un
  3. Desinstaller les modules :
    • - bioperl
    • - bioperl-run
    • - bundle-bioperl-core
    • - Tous les bioperl existant
  4. Rajouter les repositories :

  5. Une fois les repositories ajouter, installer les modules
    • BioPerl (version 1.6.1 du repository BioPerl).
    • Bundle-BioPerl-Core (version 1.6.1 du repository BioPerl).
    • BioPerl-Run (version 1.006000_001.0.0 du repository Bioperl_update), elle match sur le version la plus récente de bioperl.


Voilà, vous avez maintenant une version de bioperl à jour et fonctionnelle.

N'hésitez pas à me retourner vos soucis.