Discussion :

[remixade]

Bonjour à tous,
j'ai un pb avec un de mes scripts perl qui est censé découper un fichier de séquences ADN pour les insérer dans une table sql. J'ai le message "DBD::mysql::st execute failed: Got a packet bigger than 'max_allowed_packet'".
Il est vrai que certaines séquences sont très volumineuses mais j'ai essayé tous les moyens à ma connaissance et je n'arrive pas à m'en sortir...Avez vous une idée ou une direction à me donner pour contourner ce pb sachant que la taille max_allowed_packet est attribuée automatiquement en fonction de la mémoire dispo ?
Merci à vous...
R.

[Invité]

Salut,

Sur quel OS se trouve ton serveur mysql?

[remixade]

je suis sous Redhat Linux Fedora 6 avec 2Go de ram...

[Invité]

Ok,

Est-ce que tu vois la valeur max_allowed_packet dans le fichier /etc/my.cnf?

Sinon tu peux la fixer à 500M dans la section mysqld

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
3
 
[mysqld]
max_allowed_packet=500M

et tu redémarres le service mysqld

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
 
#service mysqld restart

Normallement tu ne devrais plus avoir ce problème après avoir effectué cette modification.

[remixade]

Oui, j'ai tenté ça mais ça n'a pas d'influence puisque la mémoire utilisée par les dernières versions perl est automatique d'après ce que j'ai pu lire...
J'ai quand même déclaré :
[mysqld]
max_allowed_packet=1000M

pour voir...mais sans résultat...

[Invité]

le service mysqld a bien été redémarré?

[Jasmine80]

J'avais eu un problème similaire. Le problème était que max_allowed_packet était insuffisant. J'avais dû modifier le fichier "my.ini". Cela pourra peut-être t'aider. Je suis sous Windows, mais tu peux toujours essayer.

http://www.developpez.net/forums/d23...e/#post1493583
Réponses 4 et 5

[Invité]

J'avais eu un problème similaire. Le problème était que max_allowed_packet était insuffisant. J'avais dû modifier le fichier "my.ini". Cela pourra peut-être t'aider. Je suis sous Windows, mais tu peux toujours essayer.

http://www.developpez.net/forums/d23...e/#post1493583
Réponses 4 et 5

C'est bien ce que je lui ai demandé de faire plus haut...le fichier
my.ini -> windows
my.cnf -> Fedora

Enfin il reste à voir si le service mysql a bien été redémarré correctement....

[Jasmine80]

C'est bien ce que je lui ai demandé de faire plus haut...le fichier
my.ini -> windows
my.cnf -> Fedora

Ah, d'accord. Je ne savais pas que les fichiers étaient nommés différemment. En tous cas, chez moi cela a fonctionné.

[remixade]

Bonjour à tous,
Vraiment désolé d'avoir lancé ce topic et de ne pas y avoir fait suite mais j'ai eu un petit accident de cheville et donc absent du bureau...
En ce qui concerne mon problème, je l'ai résolu, j'avais plusieurs problèmes de configuration en cascade entre apache et mysql. En tous cas, vos réponses m'ont permises de vérifier tout ça et ça fonctionne...
Ce que j'avais lu à propos de la gestion automatique de mémoire pour max_allowed_packet par le serveur mysql est faux, il faut bien définir davantage de mémoire dans my.cnf et redémarrer le serveur...
Merci à vous...