Discussion :

[Tomme]

Bonjour,
J'ai quelques requête à faire sur une base de donnée en SQL

la base :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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TABLE PROJECT
  PROJECTID      CHARACTER(10) (Primary Key)
  PROJECT_NAME   CHARACTER(40)
 
TABLE COMPOUND
  COMPID	     CHARACTER(15) (Primary Key)
  STRUCTURE      BLOB
 
TABLE REACTION
  REACTIONID     INTEGER (Primary Key)
  COMPID         CHARACTER(15)
  BATCHNO        CHARACTER(35)(Unique Key)
  PROJECTID      CHARACTER(10)
  LIBRARYNAME    CHARACTER(35)
 
TABLE BIOLOGICAL_DATA
  COMPID              CHARACTER(15)
  BATCHNO             CHARACTER(35)
  TESTID              NUMBER
  PROJECTID           CHARACTER(10)
  NUM_VALUE           NUMBER
  ANALYTICALID        INTEGER
  REACTIONID          INTEGER
  BIODATAID           INTEGER (Primary Key)
 
TABLE SAMPLE_DATA
  ANALYTICALID         INTEGER (Primary Key)
  REACTIONID           INTEGER  
  PROJECTID            CHARACTER(10)
  BARCODE              CHARACTER(35)
  CONTAINERID          CHARACTER(35)
  WELL                 NUMBER
  QUANTITY             NUMBER
  UNIT                 CHARACTER(10)
  PURITY               NUMBER

Mes requète :

1) obtenir la liste de tous les projets (PROJECTID) et le nombre total de "batches" (repéré par, je pense, BATCHNO) pour chaqu'un.

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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select PROJECTID, count(BATCHNO) as “number of batches”
from PROJECT P, REACTION R
where P.PROJECTID = R.PROJECTID

2) obtenir la liste de tous les projets (PROJECTID) et le nombre total de "biological results" (repéré par, je pense, BIODATAID) pour chaqu'un.

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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select PROJECTID, count(BIODATAID) as “number of  biological results”
from PROJECT P, BIOLOGICAL_DATA B
where P.PROJECTID = B.PROJECTID

3) obtenir la liste de tous les composants (COMPID) et le nombre total de "batches"(lots) et "sample"(échantillon) pour chaqu'un.

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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select COMPID, count(BATCHNO), sum(QUANTITY)
from BIOLOGICAL_DATA B, SAMPLE_DATA S
where B.ANALYTICALID = S.ANALYTICALID

4) obtenir la liste de tous les "batches"(lots) (BATCHNO) ayant une "purity" moyenne >50 pour les "samples"(échantillions) ayant une "quantity">10.

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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select BATCHNO, avg(PURITY)
from REACTION R, SAMPLE_DATA S
where R.REACTIONID = S.REACTIONID
and S.QUANTITY <10
group by BATCHNO
having AVG(PURITY)<50

5) obtenir la liste de tous les "batches"(lots) (BATCHNO) n'ayant pas de "biological data"

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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select BATCHNO
from REACTION R
where R.BATCHNO not in(
		select BATCHNO from BIOLOGICAL_DATA )

Voilà c'est assez long je m'en excuse,

Est-ce quelqu'un peut me dire si mes réponses sont correctes, et sinon quelles sont fautes que je doit corriger ?

Je débute en SQL, donc toute aide est la bien venue !!

MERCI d'avance !!

[qi130]

Je ne vois pas l'intérêt de la jointure sur la 1...

[ced]

Bonjour,

Si je peux me permettre quelques remarques .
De manière générale, puisque tu débutes en SQL, essaie de prendre l'habitude d'écrire les jointures avec la synthaxe INNER JOIN, LEFT JOIN... plutôt que par la condition de jointure dans le WHERE. C'est plus propre, ça permet d'identifier ce qui est du domaine de la jointure et du domaine de la condition... Bref, ça n'a que des avantages.
Voici un excellent tutoriel pour apprendre tout ça : SQL de A à Z.

Prenons maintenant les requêtes les unes après les autres :
1/ il faut un GROUP BY pour avoir le nombre de batchs par projet :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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SELECT P.PROJECTID, count(R.BATCHNO) AS NB_BATCHES
FROM PROJECT P
INNER JOIN REACTION R ON P.PROJECTID = R.PROJECTID
GROUP BY P.PROJECTID

Il faut également donner l'alias P ou R devant PROJECTID dans le SELECT et le GROUP BY, sinon MySQL hésitera entre les 2... et renverra une erreur.
Dernière remarque, renommer le nombre de batches par un nom sans espaces (éventuellement en mettant entre ` (touches Alt Gr + 7) et non pas entre guillemets).

2/ Idem que pour la requête 1.

3/ Egalement les mêmes remarques. Ne connaissant pas les données dans les tables, il est difficile de te dire si la condition de jointure est correcte ou pas... Avec un jeu de données en exemple, ça serait peut-être plus simple...
Attention, avec le INNER JOIN, on élimine les lignes qui n'ont pas de correspondance. Pour avoir 0 en retour du COUNT, il faut faire un LEFT JOIN.

4/ Encore une fois, mettre les alias d'une des deux tables sur les données du SELECT (en tout cas pour BATCHNO), ainsi que dans le GROUP BY.

5/ Pour de meilleures performances, on obtient le même résultat sans sous-requête avec une jointure à gauche comme ça :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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SELECT R.BATCHNO
FROM REACTION R
LEFT JOIN BIOLOGICAL_DATA B ON R.BATCHNO = B.BATCHNO
WHERE B.BATCHNO IS NULL

Elle tournera plus vite et est compatible avec toutes les versions de MySQL.

Voilà quelques indications .

Bon courage,

ced