Discussion :

[Jasmine80]

Bonjour,

J'essaie d'utiliser le module Bio-Grep :
http://search.cpan.org/~limaone/Bio-...ib/Bio/Grep.pm

script

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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use strict;
use warnings;
 
 
use Bio::Grep;
 
 
my $sbe = Bio::Grep->new('Vmatch');
 
$sbe->generate_database
({
        file => 'TestFile.cdna',
        datapath    => 'P:/Perl/',
        description => 'Test',
});

message d'erreur

The symlink function is unimplemented at C:/Perl/site/lib/Bio/Grep/Backend/BackendI.pm line 450.

Ce qui correspond à

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

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    if ( defined $args->{copy} && $args->{copy} ) {
        copy( $args->{file}, $newfile )
            or $self->throw(
            -class => 'Bio::Root::IOException',
            -text  => "Can't copy " . $args->{file} . " to $newfile",
            -value => $!
            );
    }
    else {
        my $abs_path = $self->is_path( abs_path( $args->{file} ) );
        symlink( $abs_path, $newfile )
            or $self->throw(
            -class => 'Bio::Root::IOException',
            -text  => "Can't symlink " . $abs_path . " to $newfile",
            -value => $!
            );
    }

Pourriez-vous m'aider à comprendre ce qui ne fonctionne pas s'il vous plait.


Merci beaucoup,



Jasmine,

[Jasmine80]

J'ai trouvé ceci
http://search.cpan.org/~autrijus/Win....04/Symlink.pm

Win32
Interfaces to some Win32 API Functions

Je vais essayer de l'installer pour voir si cela fonctionne.


Jasmine,

[Jasmine80]

Maintenant, j'ai un autre message d'erreur.

Le point d'entrée de procédure Perl_sv_2iv_flags est introuvable dans la bibliothèque de liaisons dynamique perl58.dll

Pourriez-vous m'expliquer ce que cela signifie s'il vous plait?


Merci,

[Jasmine80]

J'ai trouvé sur un autre forum quelqu'un ayant le même problème que moi
http://grokbase.com/topic/2007/09/13...8LILQzahMl1jeI

Apparemment le problème serait que le package PAR contiendrait une "image de perl58.ddl" d'une version de perl plus précoce.

J'ai installer la dernière version de Perl et je n'ai plus de message d'erreur.

PAR a donc été mis automatiquement à jour par la même occasion? Vu que le problème était qu'il contenait une mauvaise version de perl58.ddl.


Merci,


Jasmine,