Discussion :

[ctobini]

Bonjour,

J'ai une table composée d'une colonne id AUTO_INCREMENT et une colonne sequence TEXT.

Cette sequence est >= 500 caractères (ADN).

Lorsque je veux créer un index UNIQUE ou mettre sequence en clé primaire (en plus de l'id) j'ai une erreur de longueur de clé.

Sauriez-vous vous comment résoudre ce problème (éventuellement un CHECK) ?

En vous remerciant,

C. Tobini

[qi130]

Pour les colonnes BLOB et TEXT la longueur d'index est obligatoire

http://dev.mysql.com/doc/refman/5.0/...ate-index.html

[ctobini]

Bonjour et merci de la réponse,

Ca marche parfaitement dans ce contexte, merci !

Mon problème maintenant est que je travaille sur des séquences d'ADN composées des lettres A, T, G ou C.

Sachant que 2 séquences peuvent varier d'une seule lettre et que la longueur est variable, il m'est impossible de préciser une taille de comparaison pour l'index UNIQUE, et la comparaison doit donc se faire sur tous les caractères pour des séquences de même longueur.

Le moyen d'effectuer ceci est-il de créer un trigger qui me permettrait de vérifier la préexistence avant insertion de 'sequence' ?

Ex:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
3
4
5
SELECT INTO variable sequence FROM table WHERE sequence = ?
IF FOUND
 RETURN 1
ELSE
 RETURN 0

Et selon le code de retour effectuer l'insertion ou pas.

C. Tobini

[qi130]

Pour éviter ce genre de pb, il faudrait peut-être regarder du coté des mécanismes genre CRC afin d'obtenir une valeur qui sera indexable.

[ctobini]

C'est-à-dire obtenir un nombre à partir d'un CRC et indexer ce nombre à la place de la séquence ?

C. Tobini

[qi130]

C'est-à-dire obtenir un nombre à partir d'un CRC et indexer ce nombre à la place de la séquence ?

C. Tobini

C'est cela même