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MATLAB Discussion :

Erreur "index out of bounds" lors de la lecture d'un fichier binaire


Sujet :

MATLAB

  1. #1
    Guitoudugte
    Invité(e)
    Par défaut Erreur "index out of bounds" lors de la lecture d'un fichier binaire
    Bonjour à tous, fraichement inscrit depuis quelques minutes, je viens poser mon petit problème de matlab. Je précise que j'ai très peu de connaissance et que je galère depuis plusieurs jours. Je me tourne donc vers vous, en espérant trouver une réponse. merci par avance.

    Voici une partie du programme:

    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    name1='Mask.tif';
    fido1=fopen(name1);
    entete1=fread(fido1,490,'int8');
    mask=fread(fido1,[280 280],'uint8');
    mask=mask/255;
     
    name='MI=300.add';
    fido=fopen(name);
    entete=fread(fido,2^16,'int8');
    for i=1:20
       entetimage=fread(fido,20,'int8');
       toto=fread(fido,[2*280 280],'uint8');
       tata=toto(1:2:2*280,: )+256.*toto(2:2:2*280,: );
     
       tata=144.87-50/2+tata.*50/4096;
     
       for k=1:280
            for j=1:280 
     
             tata(k,j)=1279.531559/(log(1.767305265/tata(k,j)+8391.636646))-273;
     
            end
       end
    end
    Pour simplifier l'explication, j'ai pris des sequences d'image par caméra infrarouge (extension "ADD"), que je dois traiter pour obtenir les profils de température. Donc dans un premier temps je lis l'image mask et je l'enregistre dans une matrice. Ensuite je lis les images prises par la caméra que j'enregistre dans une matrice tata. Je transforme les valeurs de la matrice de NN en UI (unité de la caméra). Puis je finis par transformer les valeurs de la matrice tata de UI en T°.

    Mon problème se pose sur la dernière ligne :
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
    tata(k,j)=1279.531559/(log(1.767305265/tata(k,j)+8391.636646))-273;
    j'obtiens cette erreur:

    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    ??? Attempted to access tata(1,31); index out of bounds because size(tata)=[280,30].
     
    Error in ==> FilmPIR at 23
                tata(k,j)=1279.531559/(log(1.767305265/tata(k,j)+8391.636646))-273;
    merci par avance à celui ou celle qui me débloquera.
    bien à vous
    guillaume
    Dernière modification par Jerome Briot ; 31/03/2007 à 17h58. Motif: Modification du titre + ajout balise code (#)

  2. #2
    Rédacteur/Modérateur

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    Le nombre de colonnes de la matrice "tata" est de 30, et tu veux accéder aux colonnes 1 à 280 dans la boucle sur "j", donc cela pose un problème évident d'indexage.
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    « J'étais le meilleur ami que le vieux Jim avait au monde. Il fallait choisir. J'ai réfléchi un moment, puis je me suis dit : "Tant pis ! J'irai en enfer" » (Saint Huck)

  3. #3
    Guitoudugte
    Invité(e)
    Par défaut
    j'avais compris cela, car dans le workspace il me dis bien que ma matrice
    fait <280*30>. Pourtant je pense qu'elle est bien definie non
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
    tata=(256.*toto(1:2:280,:))+256.*toto(2:2:280,:);
    car la matrice toto fait <560*280>
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
      toto=fread(fido,[2*280 280],'uint8');

  4. #4
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    Ajoutes la fonction WHOS juste avant la boucle sur "k" pour vérifier la taille des matrices à chaque itération sur "i".
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  5. #5
    Guitoudugte
    Invité(e)
    Par défaut
    Il fait 8 passe sur i avant de me sortir l'erreur

    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    Name      Size                    Bytes  Class
     
      i         1x1                         8  double array
     
    Grand total is 1 element using 8 bytes
    j'ai ce truc qui s'affiche 8 fois. et i vaut bien 8 dans le workspace

  6. #6
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    Par défaut
    WHOS devrait trouver plus de variables.
    As-tu bien fait ceci :
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    name1='Mask.tif';
    fido1=fopen(name1,'r');
    entete1=fread(fido1,490,'int8');
    mask=fread(fido1,[280 280],'uint8');
    mask=mask/255;
    
    name='MI=300.add';
    fido=fopen(name,'r');
    entete=fread(fido,2^16,'int8');
    for i=1:20
       entetimage=fread(fido,20,'int8');
       toto=fread(fido,[2*280 280],'uint8');
       tata=toto(1:2:2*280,: )+256.*toto(2:2:2*280,: );
       
       tata=144.87-50/2+tata.*50/4096;
       whos
       for k=1:280
            for j=1:280 
        
             tata(k,j)=1279.531559/(log(1.767305265/tata(k,j)+8391.636646))-273;
            
            end
       end
    end
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  7. #7
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    Par défaut
    Tu peux aussi faire ceci :

    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    name1='Mask.tif';
    fido1=fopen(name1,'r');
    entete1=fread(fido1,490,'int8');
    mask=fread(fido1,[280 280],'uint8');
    mask=mask/255;
    
    name='MI=300.add';
    fido=fopen(name,'r');
    entete=fread(fido,2^16,'int8');
    for i=1:20
       entetimage=fread(fido,20,'int8');
       [toto,count]=fread(fido,[2*280 280],'uint8');
       if count~=(2*280*280)
          error('Moins de 2*280*280 octets ont été lu')
       end
       tata=toto(1:2:2*280,: )+256.*toto(2:2:2*280,: );
       
       tata=144.87-50/2+tata.*50/4096;
    
       for k=1:280
            for j=1:280 
        
             tata(k,j)=1279.531559/(log(1.767305265/tata(k,j)+8391.636646))-273;
            
            end
       end
    end
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  8. #8
    Guitoudugte
    Invité(e)
    Par défaut
    hum, non désolé j'avais mis que Whos('i').

    je viens de le faire uniquement avec Whos voici le resultat:
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    Name             Size                    Bytes  Class
     
      entete       65536x1                    524288  double array
      entete1        490x1                      3920  double array
      entetimage      20x1                       160  double array
      fido             1x1                         8  double array
      fido1            1x1                         8  double array
      i                1x1                         8  double array
      j                1x1                         8  double array
      k                1x1                         8  double array
      mask           280x280                  627200  double array
      name             1x10                       20  char array
      name1            1x8                        16  char array
      tata           280x30                    67200  double array
      totalimage       1x1                         8  double array
      toto           560x30                   134400  double array
     
    Grand total is 169670 elements using 1357252 bytes

  9. #9
    Guitoudugte
    Invité(e)
    Par défaut
    je viens d'essayer ta manip, apparement pas de surprise

    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    ??? Error using ==> FilmPIR
    Moins de 2*280*280 octets on été lu
     
    Error in ==> FilmPIR at 17
          error('Moins de 2*280*280 octets on été lu')

  10. #10
    Rédacteur/Modérateur

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    Par défaut
    Le problème vient donc de FREAD. Es-tu sur que la fin du fichier n'est pas atteinte ? Es-tu sur pour la taille de l'en-tête ? 2^16 c'est un peu beaucoup non ?

    Essaies avec ceci :
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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       if count~=(2*280*280)
          error(sprintf('Moins de 2*280*280 octets ont été lu à l'itération %d',i))
       end
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  11. #11
    Guitoudugte
    Invité(e)
    Par défaut
    aucune idée pour la taille de l'entête, car c'est un programme que j'ai recuperé (qui a priori donnait des résultats avant, mais plus maintenant), et j'en aurais vraiment besion.

    voici le dernier relevé avec le dernier changement de code
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    Name             Size                    Bytes  Class
     
      count            1x1                         8  double array
      entete       65536x1                    524288  double array
      entete1        490x1                      3920  double array
      entetimage      20x1                       160  double array
      fido             1x1                         8  double array
      fido1            1x1                         8  double array
      i                1x1                         8  double array
      j                1x1                         8  double array
      k                1x1                         8  double array
      mask           280x280                  627200  double array
      name             1x10                       20  char array
      name1            1x8                        16  char array
      tata           280x280                  627200  double array
      totalimage       1x1                         8  double array
      toto           560x280                 1254400  double array
     
    Grand total is 379671 elements using 3037260 bytes
     
    ??? Error using ==> FilmPIR
    Moins de 2*280*280 octets ont été lu à litération 8
     
    Error in ==> FilmPIR at 17
          error(sprintf('Moins de 2*280*280 octets ont été lu à litération %d',i))
    désolé de t'harceler comme ca, mais en tout cas merci pour ton aide
    Dernière modification par Jerome Briot ; 31/03/2007 à 15h39.

  12. #12
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    Par défaut
    Si je calcul bien, la taille de ton fichier dois être (au minimum) de <entete+20*entetimage+20*toto> soit en octets :
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
    1
    2
    3
    4
    2^16+20*20+20*2*280*280
    ans =
     
         3201936
    Pour connaitre la taille de ton fichier (tu peux aussi utiliser ton OS) :
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
    1
    2
    3
    4
    fid=fopen('MI=300.add','r');
    fseek(fid,0,'eof');
    taille=ftell(fid);
    fclose(fid);
    Alors ?
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    « J'étais le meilleur ami que le vieux Jim avait au monde. Il fallait choisir. J'ai réfléchi un moment, puis je me suis dit : "Tant pis ! J'irai en enfer" » (Saint Huck)

  13. #13
    Guitoudugte
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    taille = 1.1796e+006 octets

  14. #14
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    Donc ton fichier ne peut pas contenir toutes les données <entete+20*entetimage+20*toto> puisque sa taille est inférieur à 3201936 octets !

    Désolé, mais la seule solution est de revoir ton format de lecture
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  15. #15
    Guitoudugte
    Invité(e)
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    oki je vais voir tout ca, en tout cas merci pour ton aide. @ bientot

  16. #16
    Rédacteur/Modérateur

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    Si tu es sur que ton fichier contient bien 20 groupes successifs de données, tu peux calculer la taille de l'entête comme ceci :
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
    taille_entete=taille_fichier-20*20+20*2*280*280
    Ensuite tu remplaces le 2^16 dans ton code par cette valeur :
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
    entete=fread(fido,taille_entete,'int8');
    Je reconnais que c'est de la bidouille
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