Discussion :

[gustave22]

Bonjour à tous,

Je suis débutant et je bloque après 2 lignes de code pour lire mon fichier dans JUPYTER NOTEOOK

Au début mon était au format .XLS . Comme je n'arrivais pas à juste le visualiser dans l'explorateur jupyter et que j'ai vu qu'il y avait un probleme de format UTF8, je l'ai enregistré au format CSV. cependant j'ai toujours le message d'erreur fichier non trouvé avec le détail ci-dessous. qq aurait-il une idée?.

Merci

Code python :

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import numpy as np
import matplotlib.pyplot as plt
import pandas as pd
 
df = pd.read_csv ('titanic4.csv')

--------------------------------------------------------------------------
FileNotFoundError                         Traceback (most recent call last)
Input In [28], in <cell line: 1>()
----> 1 df = pd.read_csv ('titanic4.csv')
      3 print(df)

File ~\anaconda3\lib\site-packages\pandas\util\_decorators.py:311, in deprecate_nonkeyword_arguments.<locals>.decorate.<locals>.wrapper(*args, **kwargs)
    305 if len(args) > num_allow_args:
    306     warnings.warn(
    307         msg.format(arguments=arguments),
    308         FutureWarning,
    309         stacklevel=stacklevel,
    310     )
--> 311 return func(*args, **kwargs)

File ~\anaconda3\lib\site-packages\pandas\io\parsers\readers.py:680, in read_csv(filepath_or_buffer, sep, delimiter, header, names, index_col, usecols, squeeze, prefix, mangle_dupe_cols, dtype, engine, converters, true_values, false_values, skipinitialspace, skiprows, skipfooter, nrows, na_values, keep_default_na, na_filter, verbose, skip_blank_lines, parse_dates, infer_datetime_format, keep_date_col, date_parser, dayfirst, cache_dates, iterator, chunksize, compression, thousands, decimal, lineterminator, quotechar, quoting, doublequote, escapechar, comment, encoding, encoding_errors, dialect, error_bad_lines, warn_bad_lines, on_bad_lines, delim_whitespace, low_memory, memory_map, float_precision, storage_options)
    665 kwds_defaults = _refine_defaults_read(
    666     dialect,
    667     delimiter,
   (...)
    676     defaults={"delimiter": ","},
    677 )
    678 kwds.update(kwds_defaults)
--> 680 return _read(filepath_or_buffer, kwds)

File ~\anaconda3\lib\site-packages\pandas\io\parsers\readers.py:575, in _read(filepath_or_buffer, kwds)
    572 _validate_names(kwds.get("names", None))
    574 # Create the parser.
--> 575 parser = TextFileReader(filepath_or_buffer, **kwds)
    577 if chunksize or iterator:
    578     return parser

File ~\anaconda3\lib\site-packages\pandas\io\parsers\readers.py:933, in TextFileReader.__init__(self, f, engine, **kwds)
    930     self.options["has_index_names"] = kwds["has_index_names"]
    932 self.handles: IOHandles | None = None
--> 933 self._engine = self._make_engine(f, self.engine)

File ~\anaconda3\lib\site-packages\pandas\io\parsers\readers.py:1217, in TextFileReader._make_engine(self, f, engine)
   1213     mode = "rb"
   1214 # error: No overload variant of "get_handle" matches argument types
   1215 # "Union[str, PathLike[str], ReadCsvBuffer[bytes], ReadCsvBuffer[str]]"
   1216 # , "str", "bool", "Any", "Any", "Any", "Any", "Any"
-> 1217 self.handles = get_handle(  # type: ignore[call-overload]
   1218     f,
   1219     mode,
   1220     encoding=self.options.get("encoding", None),
   1221     compression=self.options.get("compression", None),
   1222     memory_map=self.options.get("memory_map", False),
   1223     is_text=is_text,
   1224     errors=self.options.get("encoding_errors", "strict"),
   1225     storage_options=self.options.get("storage_options", None),
   1226 )
   1227 assert self.handles is not None
   1228 f = self.handles.handle

File ~\anaconda3\lib\site-packages\pandas\io\common.py:789, in get_handle(path_or_buf, mode, encoding, compression, memory_map, is_text, errors, storage_options)
    784 elif isinstance(handle, str):
    785     # Check whether the filename is to be opened in binary mode.
    786     # Binary mode does not support 'encoding' and 'newline'.
    787     if ioargs.encoding and "b" not in ioargs.mode:
    788         # Encoding
--> 789         handle = open(
    790             handle,
    791             ioargs.mode,
    792             encoding=ioargs.encoding,
    793             errors=errors,
    794             newline="",
    795         )
    796     else:
    797         # Binary mode
    798         handle = open(handle, ioargs.mode)

FileNotFoundError: [Errno 2] No such file or directory: 'titanic4.csv'

​

[Sve@r]

Bonjour

cependant j'ai toujours le message d'erreur fichier non trouvé avec le détail ci-dessous. qq aurait-il une idée?.

Oui, c'est assez simple en fait : ton script Python ne trouve pas le fichier.

Python (et par extension les programmes en général) ne cherchent pas un fichier (surtout nommé en relatif) par rapport à l'emplacement du programme invoqué (sinon cela restreindrait assez drastiquement l'avantage du nommage en relatif) mais par rapport à l'emplacement de celui qui appelle le programme.
Si par exemple je me trouve dans "/var" et que j'appelle un script qui, lui, se trouve dans "/tmp", et que ce script, (qui est interprété par "/usr/bin/python3") tente d'ouvrir le fichier "xxx/fic", alors ce ne sera ni /tmp/xxx/fic, ni /usr/bin/xxx/fic mais /var/xxx/fic (le nom part de mon emplacement) . C'est un petit peu le B+A=BA de l'utilisateur Unix/Linux qui travaille assez généralement en mode lignes de commandes (sous zindow cette notion existe mais elle est masquée par le fait qu'on manipule tout à la souris).

En plus toi tu passes par un intermédiaire supplémentaire "anaconda" donc m'est avis que c'est anaconda qui invoque Python donc le fichier doit être cherché dans le dossier de travail d'anaconda.

[ypcman]

Bonjour
Comme le dit très justement Sve@r, "ton script ne trouve pas le fichier" ... "titanic4.csv".
De la façon dont tu as écris

Code :

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df = pd.read_csv ('titanic4.csv')

le fichier "titanic4.csv" doit simplement se trouver dans le même répertoire et au même niveau que ton script / ton notebook Jupyter (fichier du type *.ipynb)
En revanche, si dans le répertoire où se trouve le script python en *.ipynb tu crées un répertoire "data" dans lequel tu déposes tes fichiers de données, typiquement titanic4.csv, alors tu devras écrire

Code :

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df = pd.read_csv ('data/titanic4.csv')

[papajoker]

bonjour

le fichier "titanic4.csv" doit simplement se trouver dans le même répertoire et au même niveau que ton script

justement non (comme bien stipulé par Sve@r)
Si on ne donne pas de chemin absolu, alors python cherche uniquement depuis le répertoire courant. Et parfois, oui, c'est le même que celui du fichier python...

[Sve@r]

python cherche uniquement depuis le répertoire courant

Une façon de le connaitre est d'afficher os.getcwd()...

[ypcman]

Vous avez sûrement raison. C'est juste que sur mon ordi (Fedora), j'utilise Anaconda et les notebook Jupyter et je n'ai jamais eu ce problème en utilisant "./mon_fich.csv" ou directement "mon_fich.csv' , le script *.ipynb et le fichier csv étant dans le même répertoire ...


Si le pb est le répertoire de travail, la solution doit être du genre

Code :

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import os
os.chdir(/path/to/your/directory/)

[gustave22]

Merci beaucoup ! effectivement je me disais bien qu'il y avait un truc qui cloche mais quand j'avais essayé de mettre tout le chemin ça ne marchait pas non plus (c://document/.....). du coup je crée mon new .ipyk directement dans le dossier de mes data. Encore merci

Bonjour

Oui, c'est assez simple en fait : ton script Python ne trouve pas le fichier.

Python (et par extension les programmes en général) ne cherchent pas un fichier (surtout nommé en relatif) par rapport à l'emplacement du programme invoqué (sinon cela restreindrait assez drastiquement l'avantage du nommage en relatif) mais par rapport à l'emplacement de celui qui appelle le programme.
Si par exemple je me trouve dans "/var" et que j'appelle un script qui, lui, se trouve dans "/tmp", et que ce script, (qui est interprété par "/usr/bin/python3") tente d'ouvrir le fichier "xxx/fic", alors ce ne sera ni /tmp/xxx/fic, ni /usr/bin/xxx/fic mais /var/xxx/fic (le nom part de mon emplacement) . C'est un petit peu le B+A=BA de l'utilisateur Unix/Linux qui travaille assez généralement en mode lignes de commandes (sous zindow cette notion existe mais elle est masquée par le fait qu'on manipule tout à la souris).

En plus toi tu passes par un intermédiaire supplémentaire "anaconda" donc m'est avis que c'est anaconda qui invoque Python donc le fichier doit être cherché dans le dossier de travail d'anaconda.

[gustave22]

Bonjour
Comme le dit très justement Sve@r, "ton script ne trouve pas le fichier" ... "titanic4.csv".
De la façon dont tu as écris

Code :

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df = pd.read_csv ('titanic4.csv')

le fichier "titanic4.csv" doit simplement se trouver dans le même répertoire et au même niveau que ton script / ton notebook Jupyter (fichier du type *.ipynb)
En revanche, si dans le répertoire où se trouve le script python en *.ipynb tu crées un répertoire "data" dans lequel tu déposes tes fichiers de données, typiquement titanic4.csv, alors tu devras écrire

Code :

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df = pd.read_csv ('data/titanic4.csv')

[Sve@r]

mais quand j'avais essayé de mettre tout le chemin ça ne marchait pas non plus (c://document/.....).

Tu as os.path ou pathlib.Path qui te permettent de créer des chemins portables.