Discussion :

[Margotte02]

Bonjour,

j'ai 2 questions:

1) j'aimerais générer une liste de fichiers situés dans un dossier en sélectionnant des fichiers seulement avec certains noms, j'arrive à le faire en indiquant la terminaison des fichiers, par exemple:

si je veux dans le dossier sélectionné uniquement les fichiers finissants par "_N1.xlsx", je fais:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

fichiersN1<- list.files(path=".",pattern = "_N1.xlsx")

ça fonctionne bien, j'ai ceci en appelant la liste "fichiersN1":

> fichiersN1
[1] "year00_dataAll_N1.xlsx" "year00_dataComp_N1.xlsx" "year01_dataAll_N1.xlsx" "year01_dataComp_N1.xlsx" "year02_dataAll_N1.xlsx" "year02_dataComp_N1.xlsx" "year03_dataAll_N1.xlsx" "year03_dataComp_N1.xlsx" "year04_dataAll_N1.xlsx" "year04_dataComp_N1.xlsx" "year05_dataAll_N1.xlsx" "year05_dataComp_N1.xlsx", etc...

J'aimerais trouver une fonction pour sélectionner les fichiers finissants par _N1.xlsx et uniquement ceux de certaines tranches d'années, par exemple des années year01 à year03 donc commençant par "year01", "year02" et "year03". J'aimerais faire ça de manière automatique car j'ai beaucoup de fichiers et j'aimerais créer des listes avec les fichiers finissants par N1 pour différents ensembles d'années, par exemple les années de year01 à year03 (=fichiers de la liste1) puis year03 à year05 (=fichiers de la liste2), etc..

J'arrive à faire des sélections par début de fichier ou fin de fichier mais pas les deux et pas de manière automatique.

2) Ensuite, j'aimerais combiner les lignes des fichiers des différentes listes en un seul gros fichier pour chaque liste, sachant que normalement les fichiers ont les mêmes noms de colonnes, j’arrive à le faire en prenant les fichiers un par un mais pas de manière automatique, par exemple je fais:

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
3
4
5
6
fi1<-read_excel(liste1[1])
fi2<-read_excel(liste2[2])
#common col:
common_col_names<-intersect(names(fi1), names(fi2))
 
fi3<-merge.data.frame(fi1,fi2, by = common_col_names, all.x=TRUE)

Comment faire ça sans devoir appeler les fichiers des listes un par un?

Merci par avance.

[olivier.decourt]

Bonjour.
Pour la question 1, il faut complexifier un peu l'argument pattern de list.files. C'est une expression régulière, ce qui permet pas mal de choses.

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

fichiersN1<- list.files(path=".",pattern = "^year0[1-3].+_N1.xlsx$")

récupère la liste des noms qui commencent par year0 (le ^ marque le début du nom) suivi d'un chiffre entre 1 et 3 inclus (ce que signifie [1-3]) suivi par des caractères quelconques (.+) et enfin _N1.xlsx pour finir le nom (avec $ qui marque la fin du nom, en symétrique de ^).

Pour la question 2, il y a des solutions avec le package {purrr} et la fonction map_df. En premier argument la liste de noms de fichiers et en second ce qu'on veut faire (import et jointure ici), via une fonction ad hoc.