Discussion :

[Julie19]

Bonjour,

Je veux réaliser une analyse de redondance (RDA) qui est une analyse contrainte directe asymétrique mais je rencontre un pb sur R quand je veux effectuer la RDA. Lorsque je veux regarder le pourcentage de variance porté par les axes, un message d'erreur s'affiche :

Error in data.frame(Axis = 1:length(vars3.each), Proportion = vars3.each, :
arguments imply differing number of rows: 2, 0

J'ai testé et cela viendrait de 2 variables qui n'ont pourtant aucun pb dans le tableau...

Merci de votre aide !

[tototode]

Bonjour,

Bonjour,

Je veux réaliser une analyse de redondance (RDA) qui est une analyse contrainte directe asymétrique mais je rencontre un pb sur R quand je veux effectuer la RDA. Lorsque je veux regarder le pourcentage de variance porté par les axes, un message d'erreur s'affiche :

J'ai testé et cela viendrait de 2 variables qui n'ont pourtant aucun pb dans le tableau...

Merci de votre aide !

Sans plus d'explication sur ton jeu de données (sa strucuture) et le code que tu as utilisé (les commandes, les packages, etc.) il va être très difficile de te répondre.

cdlt

[Julie19]

Bonjour,


Sans plus d'explication sur ton jeu de données (sa strucuture) et le code que tu as utilisé (les commandes, les packages, etc.) il va être très difficile de te répondre.

cdlt

Bonjour,

Voici les informations,

J'ai 2 tableaux :
- un tableau de présence/absence (toutes les espèces en colonnes et chaque ligne correspond à une placette)
- un tableau de variables (toutes les variables en colonnes -pente, exposition, maturité, essence...- et les placettes en lignes à nouveau)

J'utilise le package vegan et RVAideMemoire.

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
RDA<-rda(formule,data=tab.explicatif,scale=TRUE) #ici tout fonctionne
MVA.synt(RDA) #ici j'ai le message d'erreur - cette ligne de code permet d'obtenir le pourcentage de variance porté par les axes

J'ai essayé avec un autre jeu de données tout marche et pourtant le tableau est structuré de la même façon...

[tototode]

re,

Du coup si le problème est spécifique à ton tableau il est dur de te répondre.
Ce que tu peux faire c'est "débugger" la fonction qui pose problème, pour voir à chaque étape ce qui se passe et essayer ainsi de comprendre pourquoi avec ce tableau en particulier ça ne fonctionne pas.
Après il n'y a rien dans la fonction MVA.synt que tu ne puisses obtenir avec la fonction summary (si rda vient bien du package vegan).

Pour que ça soit plus simple de te répondre, il faudrait qu'à l'avenir tu précises quelles library additionnelles tu as utilisées.

cdlt