Discussion :

[Julie19]

Bonjour,

J'aimerai effectuer une projection de matrices avec la fonction projection.matrix() du package popbio et par la suite faire un bootstrap avec la fonction boot.transitions (package popbio également) afin de calculer les intervalles de confiance des lambdas. J'ai déjà calculer les lambdas déterministes grâce aux paramètres démographiques que j'ai estimé, il me faut les intervalles de confiance.
J'ai le tableau suivant :


Je prend pour exemple la paire d'année 2001-2002 dont je transforme les noms de colonne en stage et fate grâce à :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
3
4
data2=select(data, X2001, X2002)
library(questionr)
data2 <- rename.variable(data2, "X2001", "stage")
data2 <- rename.variable(data2, "X2002", "fate")

J'obtiens donc le tableau suivant :


J'essaie ensuite :

Code :

Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part

1
2
stages <- c("2", "3", "4", "5")
projection.matrix(data2, stage, fate, sort = stages)

Mais un message d'erreur s'affiche :

Missing a fertility column with individual fertility rates

Ma matrice est normalement construite par exemple de la manière suivant :


Pouvez-vous m'aider svp ?

Merci