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R Discussion :

Somme du nombre d'occurrences R tableau


Sujet :

R

Vue hybride

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  1. #1
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    Par défaut Somme du nombre d'occurrences R tableau
    Hello

    Comment sommer le nombre d’occurrences à chaque position dans le fragment ?
    En abscisse il y a les lettres possibles.
    En ordonnée il y a les position (position 1, position 2, ... ,position 8).
    Dans le tableau on a donc l’occurrence de chaque lettre aux 8 positions.

    Pour le fragment 1 j'aurai : TATLQAKA : 5+2+3+4+2+1+1+4 = 22
    (T a été retrouvé 5 fois en position 1 + A qui a été retrouvé 2 fois en position 2 + T qui a été retrouvé 3 fois en position 3.....)

    QCLKMLET 3+2+5+3+1+7+3+3 = 27

    Comment le faire en R plutôt qu'à la main

    Merci beaucoup si vous avez une idée !

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  2. #2
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    bonjour une solution avec le tidyverse

    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    library(tidyverse) 
    ## data , colonnes A,B,C...
    ## data2 une colonne segment
     
    #creation d'une fonction qui compte les occurrences
    # les fonctions map prennent en général 2 arguments le premier une liste ou vecteur qui sera parcouru et appliqué au 2ieme argument (fonction ou formule)
    ## c'est l'équivalent d'une boucle for, la fonction renverra une liste ou un dataframe
    ## dans l'exemple ci-dessous  la fonction map_int va renvoyer un vecteur d'entiers les valeurs que vous recherchez
     
    compter <- function(segment,table_score ){
       map_int(1:8,   ## premier argument de la fonction map_int, on parcours le vecteur 1:8 (les 8 lettres des segments) que l'on applique au 2 ieme argument
    ~table_score %>% ## 2 ieme argument, la table qui contient valeurs des occurences
    select(str_sub(segment,.x,.x)) %>%  ## on selectionne la colonne qui correspond au caractere courant du segment 
    slice(.x) %>%  # on selectionne le numéro de ligne qui correspond a la position du caractere courant  dans le segement
    pull()) %>% # on extrait  la valeur recherchée
     reduce(sum) # on somme on applique la fonction sum à la liste d'entier calculée
     } 
     
    ##génération d'un dataframe  de 2 colonne ,segment et nb = valeur recherchée
    ## map_df génère un dataframe(ou tibble)
     resultat <- map_df(data2$segments,~tibble(segments=.,nb=compter(.,table_score =data)))

  3. #3
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    Par défaut
    Bonjour !

    Merci beaucoup pour de votre réponses !
    Il y a t-il des étapes particulières pour installer le (tidyverse) car install.packages("tidyverse") puis library(tidyverse) me retourne le message suivant :
    Error in library(tidyverse) : there is no package called ‘tidyverse’

  4. #4
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    Par défaut
    Quant je tape >resultat, Je reçois la réponse : # A tibble: 0 x 0

    Est ce normal ?

  5. #5
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    Par défaut
    essaye compter('TATLQAKA', data) data étant ton fichier avec valeur des occurrences

  6. #6
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    Par défaut Error
    Bonjour,

    voyez vous une erreur ?

    Je n'ai pas pu télécharger le tidyverse, car il me semble que certains packs sont prérequis.
    Images attachées Images attachées    

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