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R Discussion :

Utiliser un paste dans une commande system ()


Sujet :

R

Vue hybride

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  1. #1
    Membre averti
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    Par défaut Utiliser un paste dans une commande system ()
    Bonjour,

    Voici ma problématique, j'ai un objet R que je sauvegarde dans un répertoire unix
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
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    df <- data.frame (var=1)
    path_repout <- "/home"
    saveRDS (df,file=paste0(path_repout, "/df.RDS"))
     
     
    system (paste0("'chmod -R 777  ", path_repout, "/df.RDS'"))
     
    sh: chmod -R 777 /home/df.RDS: Aucun fichier ou dossier de ce type
    Le saveRDS avec un paste0 me donne un message d'erreur. Est-ce qu'il y a un autre moyen de faire cette commande système?

    Merci

  2. #2
    Membre expérimenté Avatar de Alpacky
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    Par défaut
    Bonjour,

    Quel est le message d'erreur lorsque vous essayez d'écrire votre ".Rds"?
    Selon le message d'erreur (de la commande system): il n'y a pas de fichiers. Donc soit il est créé au mauvais endroit soit il n'est pas créé.

    Par ailleurs plutôt que d'utiliser system("cmd bash") pour changer les droits sur le fichier vous pourriez utiliser des fonctions de R pour la même opération (file.mode pour changer les droits, file.**** pour autre chose ou utiliser des fonctions du package fs)

    Cordialement

  3. #3
    Membre averti
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    Par défaut
    Merci pour votre aide.

    J'ai trouvé en utilisant base::Sys.chmod
    Code : Sélectionner tout - Visualiser dans une fenêtre à part
     base::Sys.chmod ( paste0 (path_repout,"/df.RDS"), "777", use_umask = FALSE)

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